ALYREF

ALYREF
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتينOrtholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين

3ULH

معرفات
أسماء بديلة ALYREF, ALY, ALY/REF, BEF, REF, THOC4, Aly/REF export factor
معرفات خارجية الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 604171 HomoloGene: 134554 GeneCards: 10189
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية

‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني
ربط حمض نووي
RNA binding

مكونات خلوية

سيتوبلازم
عصارة خلوية
nuclear speck
catalytic step 2 spliceosome
غشاء
transcription export complex
exon-exon junction complex
spliceosomal complex
حويصلة خارج خلوية
نواة
بلازم نووي

عمليات حيوية

regulation of DNA recombination
mRNA splicing, via spliceosome
termination of RNA polymerase II transcription
mRNA transport
mRNA processing
viral mRNA export from host cell nucleus
mRNA export from nucleus
positive regulation of DNA-templated transcription, elongation
osteoblast differentiation
replication fork processing
‏GO:0022415 viral process
mRNA 3'-end processing
تضفير الآر أن إيه
RNA export from nucleus
‏GO:0015915 نقل

المصادر:Amigo / QuickGO
تماثلات متسلسلة
أنواع الإنسان الفأر
أنتريه 10189 690585
Ensembl ENSG00000183684 ENSRNOG00000036687
يونيبروت

Q86V81

D3ZXH7

RefSeq (رنا مرسال.)

‏NR_158770 NM_005782، ‏NR_158770

‏XM_006247925 NM_001109602، ‏XM_006247925

RefSeq (بروتين)

NP_005773

‏XP_006247987، ‏XP_038942805، ‏NP_001381323 NP_001103072، ‏XP_006247987، ‏XP_038942805، ‏NP_001381323

الموقع (UCSC n/a 10:109770876-109774639 Chr rat 10: 109.77 – 109.77 Mb
بحث ببمد [1] [2]
ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنساناعرض/عدّل فأر

ALYREF‏ (Aly/REF export factor) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين ALYREF في الإنسان.[1][2][3]

الوظيفة

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

الأهمية السريرية

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

المراجع

  1. ^ Muravenko OV، Gizatullin RZ، Al-Amin AN، Protopopov AI، Kashuba VI، Zelenin AV، Zabarovsky ER (يناير 2001). "Human ALY/BEF gene Map position 17q25.3". Chromosome Res. ج. 8 ع. 6: 562. DOI:10.1023/A:1009236126053. PMID:11032328.
  2. ^ "Entrez Gene: ALYREF Aly/REF export factor". مؤرشف من الأصل في 2010-03-07.
  3. ^ "Entrez Gene: THOC4 THO complex 4". مؤرشف من الأصل في 2010-03-07.

قراءة متعمقة

  • Bruhn L، Munnerlyn A، Grosschedl R (1997). "ALY, a context-dependent coactivator of LEF-1 and AML-1, is required for TCRalpha enhancer function". Genes Dev. ج. 11 ع. 5: 640–53. DOI:10.1101/gad.11.5.640. PMID:9119228.
  • Neubauer G، King A، Rappsilber J، وآخرون (1998). "Mass spectrometry and EST-database searching allows characterization of the multi-protein spliceosome complex". Nat. Genet. ج. 20 ع. 1: 46–50. DOI:10.1038/1700. PMID:9731529.
  • Wichmann I، Garcia-Lozano JR، Respaldiza N، وآخرون (1999). "Autoantibodies to transcriptional regulation proteins DEK and ALY in a patient with systemic lupus erythematosus". Hum. Immunol. ج. 60 ع. 1: 57–62. DOI:10.1016/S0198-8859(98)00085-8. PMID:9952027.
  • Virbasius CM، Wagner S، Green MR (1999). "A human nuclear-localized chaperone that regulates dimerization, DNA binding, and transcriptional activity of bZIP proteins". Mol. Cell. ج. 4 ع. 2: 219–28. DOI:10.1016/S1097-2765(00)80369-X. PMID:10488337.
  • Le Hir H، Izaurralde E، Maquat LE، Moore MJ (2001). "The spliceosome deposits multiple proteins 20-24 nucleotides upstream of mRNA exon-exon junctions". EMBO J. ج. 19 ع. 24: 6860–9. DOI:10.1093/emboj/19.24.6860. PMC:305905. PMID:11118221.
  • Kim VN، Kataoka N، Dreyfuss G (2001). "Role of the nonsense-mediated decay factor hUpf3 in the splicing-dependent exon-exon junction complex". Science. ج. 293 ع. 5536: 1832–6. DOI:10.1126/science.1062829. PMID:11546873.
  • Luo ML، Zhou Z، Magni K، وآخرون (2001). "Pre-mRNA splicing and mRNA export linked by direct interactions between UAP56 and Aly". Nature. ج. 413 ع. 6856: 644–7. DOI:10.1038/35098106. PMID:11675789.
  • Kataoka N، Diem MD، Kim VN، وآخرون (2002). "Magoh, a human homolog of Drosophila mago nashi protein, is a component of the splicing-dependent exon-exon junction complex". EMBO J. ج. 20 ع. 22: 6424–33. DOI:10.1093/emboj/20.22.6424. PMC:125744. PMID:11707413.
  • Strässer K، Masuda S، Mason P، وآخرون (2002). "TREX is a conserved complex coupling transcription with messenger RNA export". Nature. ج. 417 ع. 6886: 304–8. DOI:10.1038/nature746. PMID:11979277.
  • Jurica MS، Licklider LJ، Gygi SR، وآخرون (2002). "Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis". RNA. ج. 8 ع. 4: 426–39. DOI:10.1017/S1355838202021088. PMC:1370266. PMID:11991638.
  • Rappsilber J، Ryder U، Lamond AI، Mann M (2002). "Large-scale proteomic analysis of the human spliceosome". Genome Res. ج. 12 ع. 8: 1231–45. DOI:10.1101/gr.473902. PMC:186633. PMID:12176931.
  • Chen IH، Sciabica KS، Sandri-Goldin RM (2002). "ICP27 interacts with the RNA export factor Aly/REF to direct herpes simplex virus type 1 intronless mRNAs to the TAP export pathway". J. Virol. ج. 76 ع. 24: 12877–89. DOI:10.1128/JVI.76.24.12877-12889.2002. PMC:136725. PMID:12438613.
  • Strausberg RL، Feingold EA، Grouse LH، وآخرون (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 99 ع. 26: 16899–903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMC:139241. PMID:12477932.
  • McCracken S، Longman D، Johnstone IL، وآخرون (2004). "An evolutionarily conserved role for SRm160 in 3'-end processing that functions independently of exon junction complex formation". J. Biol. Chem. ج. 278 ع. 45: 44153–60. DOI:10.1074/jbc.M306856200. PMID:12944400.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  • Pryor A، Tung L، Yang Z، وآخرون (2004). "Growth-regulated expression and G0-specific turnover of the mRNA that encodes URH49, a mammalian DExH/D box protein that is highly related to the mRNA export protein UAP56". Nucleic Acids Res. ج. 32 ع. 6: 1857–65. DOI:10.1093/nar/gkh347. PMC:390356. PMID:15047853.
  • Gerhard DS، Wagner L، Feingold EA، وآخرون (2004). "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. ج. 14 ع. 10B: 2121–7. DOI:10.1101/gr.2596504. PMC:528928. PMID:15489334.
  • Ong SE، Mittler G، Mann M (2005). "Identifying and quantifying in vivo methylation sites by heavy methyl SILAC". Nat. Methods. ج. 1 ع. 2: 119–26. DOI:10.1038/nmeth715. PMID:15782174.
  • Masuda S، Das R، Cheng H، وآخرون (2005). "Recruitment of the human TREX complex to mRNA during splicing". Genes Dev. ج. 19 ع. 13: 1512–7. DOI:10.1101/gad.1302205. PMC:1172058. PMID:15998806.
  • Mertz JA، Kobayashi R، Dudley JP (2007). "ALY is a common coactivator of RUNX1 and c-Myb on the type B leukemogenic virus enhancer". J. Virol. ج. 81 ع. 7: 3503–13. DOI:10.1128/JVI.02253-06. PMC:1866045. PMID:17229714.
  • Quaresma AJ، Sievert R، Nickerson JA (2013). "Regulation of mRNA export by the PI3 kinase/AKT signal transduction pathway". Mol. Biol. Cell. ج. 24 ع. 8: 1208–21. DOI:10.1091/mbc.E12-06-0450. PMC:3623641. PMID:23427269.
  • ع
  • ن
  • ت
جينات الكروموسوم 17
جينات الكروموسوم 17
  • أيقونة بوابةبوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
  • أيقونة بوابةبوابة طب
  • أيقونة بوابةبوابة الكيمياء الحيوية
التصنيفات الطبية
المعرفات الخارجية
أيقونة بذرة

هذه بذرة مقالة عن بروتين بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.