RFX5

RFX5
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتينOrtholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين

2KW3, 3V30

معرفات
أسماء بديلة RFX5, regulatory factor X5
معرفات خارجية الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 601863 HomoloGene: 388 GeneCards: 5993
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية

• ‏GO:0001131، ‏GO:0001151، ‏GO:0001130، ‏GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
• ‏GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
• ربط دي إن إي
• ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني
• ‏GO:0001077، ‏GO:0001212، ‏GO:0001213، ‏GO:0001211، ‏GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
• sequence-specific DNA binding
• ‏GO:0001200، ‏GO:0001133، ‏GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

مكونات خلوية

• نواة

عمليات حيوية

• ‏GO:0009373 ضبط نسخ الدنا
• ‏GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
• نسخ الدنا
• ‏GO:0044324، ‏GO:0003256، ‏GO:1901213، ‏GO:0046019، ‏GO:0046020، ‏GO:1900094، ‏GO:0061216، ‏GO:0060994، ‏GO:1902064، ‏GO:0003258، ‏GO:0072212 ضبط النسخ انطلاقاً من محفز بوليميراز الرنا الثاني
• transcription by RNA polymerase II
• ‏GO:0003257، ‏GO:0010735، ‏GO:1901228، ‏GO:1900622، ‏GO:1904488 ضبط زيادي للنسخ انطلاقا من محفز بوليميراز الرنا الثاني

المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي


المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
أنواع الإنسان الفأر
أنتريه 5993 310659
Ensembl ENSG00000143390 ENSRNOG00000021012
يونيبروت

P48382
F6R6G4

D3ZHD7

RefSeq (رنا مرسال.)

‏NM_000449، ‏NM_001025603، ‏XM_005245405، ‏XM_005245406، ‏XM_011509847، ‏XM_011509848، ‏XM_011509849، ‏XM_017001999، ‏XM_017002000، ‏XM_024448791 XM_011509850، ‏NM_000449، ‏NM_001025603، ‏XM_005245405، ‏XM_005245406، ‏XM_011509847، ‏XM_011509848، ‏XM_011509849، ‏XM_017001999، ‏XM_017002000، ‏XM_024448791

‏XM_006232876، ‏XM_006232878، ‏XM_017590896، ‏XM_039102348، ‏XM_039102349 NM_001107694، ‏XM_006232876، ‏XM_006232878، ‏XM_017590896، ‏XM_039102348، ‏XM_039102349

RefSeq (بروتين)

‏NP_001020774، ‏XP_016857488، ‏XP_016857489، ‏XP_024304559، ‏NP_001366341، ‏NP_001366342، ‏NP_001366343، ‏NP_001366344، ‏NP_001366345، ‏NP_001366346، ‏NP_001366347، ‏NP_001366348، ‏NP_001366349 NP_000440، ‏NP_001020774، ‏XP_016857488، ‏XP_016857489، ‏XP_024304559، ‏NP_001366341، ‏NP_001366342، ‏NP_001366343، ‏NP_001366344، ‏NP_001366345، ‏NP_001366346، ‏NP_001366347، ‏NP_001366348، ‏NP_001366349

‏XP_006232938، ‏XP_006232940، ‏XP_017446385، ‏XP_038958276، ‏XP_038958277 NP_001101164، ‏XP_006232938، ‏XP_006232940، ‏XP_017446385، ‏XP_038958276، ‏XP_038958277

الموقع (UCSC n/a norvegicus 2:182521202-182528717 Chr Rattus norvegicus 2: 182.52 – 182.53 Mb
بحث ببمد [1] [2]
ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنساناعرض/عدّل فأر

RFX5‏ (Regulatory factor X5) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين RFX5 في الإنسان.[1]

الوظيفة

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

الأهمية السريرية

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

المراجع

  1. ^ "Entrez Gene: RFX5 regulatory factor X, 5 (influences HLA class II expression)". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.

قراءة متعمقة

  • Reith W، Mach B (2001). "The bare lymphocyte syndrome and the regulation of MHC expression". Annual Review of Immunology. ج. 19: 331–73. DOI:10.1146/annurev.immunol.19.1.331. PMID:11244040.
  • Steimle V، Durand B، Barras E، Zufferey M، Hadam MR، Mach B، Reith W (مايو 1995). "A novel DNA-binding regulatory factor is mutated in primary MHC class II deficiency (bare lymphocyte syndrome)". Genes & Development. ج. 9 ع. 9: 1021–32. DOI:10.1101/gad.9.9.1021. PMID:7744245.
  • Maruyama K، Sugano S (يناير 1994). "Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides". Gene. ج. 138 ع. 1–2: 171–4. DOI:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID:8125298.
  • Durand B، Sperisen P، Emery P، Barras E، Zufferey M، Mach B، Reith W (مارس 1997). "RFXAP, a novel subunit of the RFX DNA binding complex is mutated in MHC class II deficiency". The EMBO Journal. ج. 16 ع. 5: 1045–55. DOI:10.1093/emboj/16.5.1045. PMC:1169704. PMID:9118943.
  • Scholl T، Mahanta SK، Strominger JL (يونيو 1997). "Specific complex formation between the type II bare lymphocyte syndrome-associated transactivators CIITA and RFX5". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 94 ع. 12: 6330–4. DOI:10.1073/pnas.94.12.6330. PMC:21049. PMID:9177217.
  • Moreno CS، Rogers EM، Brown JA، Boss JM (يونيو 1997). "Regulatory factor X, a bare lymphocyte syndrome transcription factor, is a multimeric phosphoprotein complex". Journal of Immunology. ج. 158 ع. 12: 5841–8. PMID:9190936.
  • Suzuki Y، Yoshitomo-Nakagawa K، Maruyama K، Suyama A، Sugano S (أكتوبر 1997). "Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library". Gene. ج. 200 ع. 1–2: 149–56. DOI:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID:9373149.
  • Masternak K، Barras E، Zufferey M، Conrad B، Corthals G، Aebersold R، Sanchez JC، Hochstrasser DF، Mach B، Reith W (نوفمبر 1998). "A gene encoding a novel RFX-associated transactivator is mutated in the majority of MHC class II deficiency patients". Nature Genetics. ج. 20 ع. 3: 273–7. DOI:10.1038/3081. PMID:9806546.
  • Nagarajan UM، Louis-Plence P، DeSandro A، Nilsen R، Bushey A، Boss JM (فبراير 1999). "RFX-B is the gene responsible for the most common cause of the bare lymphocyte syndrome, an MHC class II immunodeficiency". Immunity. ج. 10 ع. 2: 153–62. DOI:10.1016/S1074-7613(00)80016-3. PMID:10072068.
  • Peijnenburg A، Van Eggermond MC، Van den Berg R، Sanal O، Vossen JM، Van den Elsen PJ (أبريل 1999). "Molecular analysis of an MHC class II deficiency patient reveals a novel mutation in the RFX5 gene". Immunogenetics. ج. 49 ع. 4: 338–45. DOI:10.1007/s002510050501. PMID:10079298.
  • Villard J، Peretti M، Masternak K، Barras E، Caretti G، Mantovani R، Reith W (مايو 2000). "A functionally essential domain of RFX5 mediates activation of major histocompatibility complex class II promoters by promoting cooperative binding between RFX and NF-Y". Molecular and Cellular Biology. ج. 20 ع. 10: 3364–76. DOI:10.1128/MCB.20.10.3364-3376.2000. PMC:85629. PMID:10779326.
  • Nekrep N، Jabrane-Ferrat N، Peterlin BM (يونيو 2000). "Mutations in the bare lymphocyte syndrome define critical steps in the assembly of the regulatory factor X complex". Molecular and Cellular Biology. ج. 20 ع. 12: 4455–61. DOI:10.1128/MCB.20.12.4455-4461.2000. PMC:85813. PMID:10825209.
  • Sengupta PK، Fargo J، Smith BD (يوليو 2002). "The RFX family interacts at the collagen (COL1A2) start site and represses transcription". The Journal of Biological Chemistry. ج. 277 ع. 28: 24926–37. DOI:10.1074/jbc.M111712200. PMID:11986307.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  • Nekrep N، Jabrane-Ferrat N، Wolf HM، Eibl MM، Geyer M، Peterlin BM (نوفمبر 2002). "Mutation in a winged-helix DNA-binding motif causes atypical bare lymphocyte syndrome". Nature Immunology. ج. 3 ع. 11: 1075–81. DOI:10.1038/ni840. PMID:12368908.
  • Xu Y، Wang L، Buttice G، Sengupta PK، Smith BD (ديسمبر 2003). "Interferon gamma repression of collagen (COL1A2) transcription is mediated by the RFX5 complex". The Journal of Biological Chemistry. ج. 278 ع. 49: 49134–44. DOI:10.1074/jbc.M309003200. PMID:12968017.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  • Nagarajan UM، Long AB، Harreman MT، Corbett AH، Boss JM (يوليو 2004). "A hierarchy of nuclear localization signals governs the import of the regulatory factor X complex subunits and MHC class II expression". Journal of Immunology. ج. 173 ع. 1: 410–9. DOI:10.4049/jimmunol.173.1.410. PMID:15210800.
  • Hjerrild M، Stensballe A، Rasmussen TE، Kofoed CB، Blom N، Sicheritz-Ponten T، Larsen MR، Brunak S، Jensen ON، Gammeltoft S (2004). "Identification of phosphorylation sites in protein kinase A substrates using artificial neural networks and mass spectrometry". Journal of Proteome Research. ج. 3 ع. 3: 426–33. DOI:10.1021/pr0341033. PMID:15253423.
معرفات كيميائية
  • ع
  • ن
  • ت
جينات الكروموسوم 1
جينات الكروموسوم 1
  • أيقونة بوابةبوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
  • أيقونة بوابةبوابة طب
  • أيقونة بوابةبوابة الكيمياء الحيوية
أيقونة بذرة

هذه بذرة مقالة عن جين على كروموسوم 1 بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.

التصنيفات الطبية
المعرفات الخارجية