LSM5

LSM5
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتينOrtholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين

3JCR

معرفات
أسماء بديلة LSM5, YER146W, homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated
معرفات خارجية الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 607285 MGI: MGI:1913623 HomoloGene: 40833 GeneCards: 23658
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية

• ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني
• RNA binding

مكونات خلوية

• U6 snRNP
• عصارة خلوية
• Lsm1-7-Pat1 complex
• U4/U6 x U5 tri-snRNP complex
• spliceosomal complex
• نواة
• بلازم نووي
• U2-type precatalytic spliceosome
• Lsm2-8 complex

عمليات حيوية

• nuclear-transcribed mRNA catabolic process
• mRNA splicing, via spliceosome
• mRNA processing
• exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA
• تضفير الآر أن إيه
• response to bacterium

المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي




المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
أنواع الإنسان الفأر
أنتريه 23658 66373
Ensembl ENSG00000106355 ENSMUSG00000091625
يونيبروت

Q9Y4Y9

P62322

RefSeq (رنا مرسال.)

‏NM_001130710، ‏NM_001139499، ‏NM_012322، ‏XM_047420100 NR_024466، ‏NM_001130710، ‏NM_001139499، ‏NM_012322، ‏XM_047420100

NM_025520

RefSeq (بروتين)

‏NP_001132971، ‏NP_036454 NP_001124182، ‏NP_001132971، ‏NP_036454

NP_079796

الموقع (UCSC n/a Chr 6: 56.68 – 56.68 Mb
بحث ببمد [1] [2]
ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنساناعرض/عدّل فأر

LSM5‏ (LSM5 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين LSM5 في الإنسان.[1][2][3]

الوظيفة

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

الأهمية السريرية

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

المراجع

  1. ^ "Entrez Gene: LSM5 LSM5 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.
  2. ^ Salgado-Garrido J، Bragado-Nilsson E، Kandels-Lewis S، Seraphin B (أغسطس 1999). "Sm and Sm-like proteins assemble in two related complexes of deep evolutionary origin". EMBO J. ج. 18 ع. 12: 3451–62. DOI:10.1093/emboj/18.12.3451. PMC:1171424. PMID:10369684.
  3. ^ Ingelfinger D، Arndt-Jovin DJ، Luhrmann R، Achsel T (يناير 2003). "The human LSm1-7 proteins colocalize with the mRNA-degrading enzymes Dcp1/2 and Xrnl in distinct cytoplasmic foci". RNA. ج. 8 ع. 12: 1489–501. DOI:10.1017/S1355838202021726. PMC:1370355. PMID:12515382.

قراءة متعمقة

  • Rual JF؛ Venkatesan K؛ Hao T؛ وآخرون (2005). "Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network". Nature. ج. 437 ع. 7062: 1173–8. DOI:10.1038/nature04209. PMID:16189514. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |name-list-format= تم تجاهله يقترح استخدام |name-list-style= (مساعدة)
  • Gerhard DS؛ Wagner L؛ Feingold EA؛ وآخرون (2004). "The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. ج. 14 ع. 10B: 2121–7. DOI:10.1101/gr.2596504. PMC:528928. PMID:15489334. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |name-list-format= تم تجاهله يقترح استخدام |name-list-style= (مساعدة)
  • Lehner B، Sanderson CM (2004). "A Protein Interaction Framework for Human mRNA Degradation". Genome Res. ج. 14 ع. 7: 1315–23. DOI:10.1101/gr.2122004. PMC:442147. PMID:15231747.
  • Ota T؛ Suzuki Y؛ Nishikawa T؛ وآخرون (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. ج. 36 ع. 1: 40–5. DOI:10.1038/ng1285. PMID:14702039. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |name-list-format= تم تجاهله يقترح استخدام |name-list-style= (مساعدة)
  • Scherer SW؛ Cheung J؛ MacDonald JR؛ وآخرون (2003). "Human Chromosome 7: DNA Sequence and Biology". Science. ج. 300 ع. 5620: 767–72. DOI:10.1126/science.1083423. PMC:2882961. PMID:12690205. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |name-list-format= تم تجاهله يقترح استخدام |name-list-style= (مساعدة)
  • Strausberg RL؛ Feingold EA؛ Grouse LH؛ وآخرون (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 99 ع. 26: 16899–903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMC:139241. PMID:12477932. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |name-list-format= تم تجاهله يقترح استخدام |name-list-style= (مساعدة)
  • Eystathioy T؛ Peebles CL؛ Hamel JC؛ وآخرون (2002). "Autoantibody to hLSm4 and the heptameric LSm complex in anti-Sm sera". Arthritis Rheum. ج. 46 ع. 3: 726–34. DOI:10.1002/art.10220. PMID:11920408. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |name-list-format= تم تجاهله يقترح استخدام |name-list-style= (مساعدة)
  • Suzuki H؛ Fukunishi Y؛ Kagawa I؛ وآخرون (2001). "Protein–Protein Interaction Panel Using Mouse Full-Length cDNAs". Genome Res. ج. 11 ع. 10: 1758–65. DOI:10.1101/gr.180101. PMC:311163. PMID:11591653. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |name-list-format= تم تجاهله يقترح استخدام |name-list-style= (مساعدة)
  • Friesen WJ، Dreyfuss G (2000). "Specific sequences of the Sm and Sm-like (Lsm) proteins mediate their interaction with the spinal muscular atrophy disease gene product (SMN)". J. Biol. Chem. ج. 275 ع. 34: 26370–5. DOI:10.1074/jbc.M003299200. PMID:10851237.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  • Achsel T؛ Brahms H؛ Kastner B؛ وآخرون (1999). "A doughnut-shaped heteromer of human Sm-like proteins binds to the 3'-end of U6 snRNA, thereby facilitating U4/U6 duplex formation in vitro". EMBO J. ج. 18 ع. 20: 5789–802. DOI:10.1093/emboj/18.20.5789. PMC:1171645. PMID:10523320. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |name-list-format= تم تجاهله يقترح استخدام |name-list-style= (مساعدة)
معرفات كيميائية
  • ع
  • ن
  • ت
جينات الكروموسوم 7
جينات الكروموسوم 7
  • أيقونة بوابةبوابة طب
  • أيقونة بوابةبوابة الكيمياء الحيوية
  • أيقونة بوابةبوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
أيقونة بذرة

هذه بذرة مقالة عن جين على كروموسوم 7 بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.

التصنيفات الطبية
المعرفات الخارجية