SYNCRIP

SYNCRIP
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتينOrtholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين

2DGU, 2MXT, 2NBB

معرفات
أسماء بديلة SYNCRIP, GRY-RBP, GRYRBP, HNRNPQ, HNRPQ1, NSAP1, PP68, hnRNP-Q, synaptotagmin binding cytoplasmic RNA interacting protein
معرفات خارجية الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 616686 MGI: MGI:1891690 HomoloGene: 4648 GeneCards: 10492
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية

• poly(A) binding
• ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني
• ربط حمض نووي
• RNA binding
• mRNA binding
• mRNA 5'-UTR binding

مكونات خلوية

• CRD-mediated mRNA stability complex
• سيتوبلازم
• catalytic step 2 spliceosome
• histone pre-mRNA 3'end processing complex
• intracellular membrane-bounded organelle
• بلازم نووي
• شبكة إندوبلازمية
• GAIT complex
• spliceosomal complex
• نواة
• غشاء
• ribonucleoprotein complex

عمليات حيوية

• CRD-mediated mRNA stabilization
• mRNA splicing, via spliceosome
• ‏GO:0033168، ‏GO:0036404، ‏GO:1902360 المعالجة
• negative regulation of translation
• mRNA processing
• osteoblast differentiation
• تضفير الآر أن إيه
• cellular response to interferon-gamma
• ‏GO:0022415 viral process
• regulation of translation

المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي




المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
أنواع الإنسان الفأر
أنتريه 10492 56403
Ensembl ENSG00000135316 ENSMUSG00000032423
يونيبروت

O60506

Q7TMK9

RefSeq (رنا مرسال.)

‏NM_001159673، ‏NM_001159674، ‏NM_001159675، ‏NM_001159676، ‏NM_001159677، ‏NM_001253771، ‏NM_006372، ‏XM_005248635، ‏XM_005248636، ‏XM_017010176، ‏XM_017010177، ‏XM_017010178، ‏XM_017010179، ‏XM_047418081، ‏XM_047418082، ‏XM_047418083 XM_005248637، ‏NM_001159673، ‏NM_001159674، ‏NM_001159675، ‏NM_001159676، ‏NM_001159677، ‏NM_001253771، ‏NM_006372، ‏XM_005248635، ‏XM_005248636، ‏XM_017010176، ‏XM_017010177، ‏XM_017010178، ‏XM_017010179، ‏XM_047418081، ‏XM_047418082، ‏XM_047418083

‏NM_019666، ‏NM_019796، ‏XM_006511293، ‏XM_006511294، ‏NM_001311113 NM_001284328، ‏NM_019666، ‏NM_019796، ‏XM_006511293، ‏XM_006511294، ‏NM_001311113

RefSeq (بروتين)

‏NP_001153146، ‏NP_001153147، ‏NP_001153148، ‏NP_001153149، ‏NP_001240700، ‏NP_006363، ‏XP_005248692، ‏XP_005248693، ‏XP_005248694، ‏XP_016865665، ‏XP_016865666، ‏XP_016865667، ‏XP_016865668، ‏XP_016865669 NP_001153145، ‏NP_001153146، ‏NP_001153147، ‏NP_001153148، ‏NP_001153149، ‏NP_001240700، ‏NP_006363، ‏XP_005248692، ‏XP_005248693، ‏XP_005248694، ‏XP_016865665، ‏XP_016865666، ‏XP_016865667، ‏XP_016865668، ‏XP_016865669

‏NP_001298042، ‏NP_062640، ‏NP_062770، ‏XP_006511356، ‏XP_006511357 NP_001271257، ‏NP_001298042، ‏NP_062640، ‏NP_062770، ‏XP_006511356، ‏XP_006511357

الموقع (UCSC n/a Chr 9: 88.33 – 88.36 Mb
بحث ببمد [1] [2]
ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنساناعرض/عدّل فأر

SYNCRIP‏ (Synaptotagmin binding cytoplasmic RNA interacting protein) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين SYNCRIP في الإنسان.[1][2][3]

الوظيفة

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

الأهمية السريرية

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

المراجع

  1. ^ "Entrez Gene: SYNCRIP synaptotagmin binding, cytoplasmic RNA interacting protein". مؤرشف من الأصل في 2019-12-07.
  2. ^ Lau PP، Chang BH، Chan L (أبريل 2001). "Two-hybrid cloning identifies an RNA-binding protein, GRY-RBP, as a component of apobec-1 editosome". Biochemical and Biophysical Research Communications. ج. 282 ع. 4: 977–83. DOI:10.1006/bbrc.2001.4679. PMID:11352648.
  3. ^ Harris CE، Boden RA، Astell CR (يناير 1999). "A novel heterogeneous nuclear ribonucleoprotein-like protein interacts with NS1 of the minute virus of mice". Journal of Virology. ج. 73 ع. 1: 72–80. PMC:103810. PMID:9847309.

قراءة متعمقة

  • Maruyama K، Sugano S (يناير 1994). "Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides". Gene. ج. 138 ع. 1–2: 171–4. DOI:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID:8125298.
  • Fu C، Chan AC (أكتوبر 1997). "Identification of two tyrosine phosphoproteins, pp70 and pp68, which interact with phospholipase Cgamma, Grb2, and Vav after B cell antigen receptor activation". The Journal of Biological Chemistry. ج. 272 ع. 43: 27362–8. DOI:10.1074/jbc.272.43.27362. PMID:9341187.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  • Suzuki Y، Yoshitomo-Nakagawa K، Maruyama K، Suyama A، Sugano S (أكتوبر 1997). "Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library". Gene. ج. 200 ع. 1–2: 149–56. DOI:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID:9373149.
  • Neubauer G، King A، Rappsilber J، Calvio C، Watson M، Ajuh P، Sleeman J، Lamond A، Mann M (سبتمبر 1998). "Mass spectrometry and EST-database searching allows characterization of the multi-protein spliceosome complex". Nature Genetics. ج. 20 ع. 1: 46–50. DOI:10.1038/1700. PMID:9731529.
  • Mizutani A، Fukuda M، Ibata K، Shiraishi Y، Mikoshiba K (مارس 2000). "SYNCRIP, a cytoplasmic counterpart of heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R, interacts with ubiquitous synaptotagmin isoforms". The Journal of Biological Chemistry. ج. 275 ع. 13: 9823–31. DOI:10.1074/jbc.275.13.9823. PMID:10734137.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  • Grosset C، Chen CY، Xu N، Sonenberg N، Jacquemin-Sablon H، Shyu AB (سبتمبر 2000). "A mechanism for translationally coupled mRNA turnover: interaction between the poly(A) tail and a c-fos RNA coding determinant via a protein complex". Cell. ج. 103 ع. 1: 29–40. DOI:10.1016/S0092-8674(00)00102-1. PMID:11051545.
  • Blanc V، Navaratnam N، Henderson JO، Anant S، Kennedy S، Jarmuz A، Scott J، Davidson NO (مارس 2001). "Identification of GRY-RBP as an apolipoprotein B RNA-binding protein that interacts with both apobec-1 and apobec-1 complementation factor to modulate C to U editing". The Journal of Biological Chemistry. ج. 276 ع. 13: 10272–83. DOI:10.1074/jbc.M006435200. PMID:11134005.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  • Mourelatos Z، Abel L، Yong J، Kataoka N، Dreyfuss G (أكتوبر 2001). "SMN interacts with a novel family of hnRNP and spliceosomal proteins". The EMBO Journal. ج. 20 ع. 19: 5443–52. DOI:10.1093/emboj/20.19.5443. PMC:125643. PMID:11574476.
  • Rossoll W، Kröning AK، Ohndorf UM، Steegborn C، Jablonka S، Sendtner M (يناير 2002). "Specific interaction of Smn, the spinal muscular atrophy determining gene product, with hnRNP-R and gry-rbp/hnRNP-Q: a role for Smn in RNA processing in motor axons?". Human Molecular Genetics. ج. 11 ع. 1: 93–105. DOI:10.1093/hmg/11.1.93. PMID:11773003.
  • Jurica MS، Licklider LJ، Gygi SR، Grigorieff N، Moore MJ (أبريل 2002). "Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis". Rna. ج. 8 ع. 4: 426–39. DOI:10.1017/S1355838202021088. PMC:1370266. PMID:11991638.
  • Hresko RC، Mueckler M (يوليو 2002). "Identification of pp68 as the Tyrosine-phosphorylated Form of SYNCRIP/NSAP1. A cytoplasmic RNA-binding protein". The Journal of Biological Chemistry. ج. 277 ع. 28: 25233–8. DOI:10.1074/jbc.M202556200. PMID:11994298.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  • Carty SM، Greenleaf AL (أغسطس 2002). "Hyperphosphorylated C-terminal repeat domain-associating proteins in the nuclear proteome link transcription to DNA/chromatin modification and RNA processing". Molecular & Cellular Proteomics. ج. 1 ع. 8: 598–610. DOI:10.1074/mcp.M200029-MCP200. PMID:12376575.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  • Angenstein F، Evans AM، Settlage RE، Moran ST، Ling SC، Klintsova AY، Shabanowitz J، Hunt DF، Greenough WT (أكتوبر 2002). "A receptor for activated C kinase is part of messenger ribonucleoprotein complexes associated with polyA-mRNAs in neurons". The Journal of Neuroscience. ج. 22 ع. 20: 8827–37. PMID:12388589.
  • Hinsby AM، Olsen JV، Bennett KL، Mann M (يناير 2003). "Signaling initiated by overexpression of the fibroblast growth factor receptor-1 investigated by mass spectrometry". Molecular & Cellular Proteomics. ج. 2 ع. 1: 29–36. DOI:10.1074/mcp.M200075-MCP200. PMID:12601080.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  • Moraes KC، Quaresma AJ، Maehnss K، Kobarg J (يناير 2003). "Identification and characterization of proteins that selectively interact with isoforms of the mRNA binding protein AUF1 (hnRNP D)". Biological Chemistry. ج. 384 ع. 1: 25–37. DOI:10.1515/BC.2003.004. PMID:12674497.
  • Kim JH، Paek KY، Ha SH، Cho S، Choi K، Kim CS، Ryu SH، Jang SK (سبتمبر 2004). "A cellular RNA-binding protein enhances internal ribosomal entry site-dependent translation through an interaction downstream of the hepatitis C virus polyprotein initiation codon". Molecular and Cellular Biology. ج. 24 ع. 18: 7878–90. DOI:10.1128/MCB.24.18.7878-7890.2004. PMC:515056. PMID:15340051.
  • Quaresma AJ، Bressan GC، Gava LM، Lanza DC، Ramos CH، Kobarg J (أبريل 2009). "Human hnRNP Q re-localizes to cytoplasmic granules upon PMA, thapsigargin, arsenite and heat-shock treatments". Experimental Cell Research. ج. 315 ع. 6: 968–80. DOI:10.1016/j.yexcr.2009.01.012. PMID:19331829.
  • Moraes KC، Quaresma AJ، Maehnss K، Kobarg J (يناير 2003). "Identification and characterization of proteins that selectively interact with isoforms of the mRNA binding protein AUF1 (hnRNP D)". Biological Chemistry. ج. 384 ع. 1: 25–37. DOI:10.1515/BC.2003.004. ISSN:1431-6730. PMID:12674497.
معرفات كيميائية
  • ع
  • ن
  • ت
جينات الكروموسوم 6
جينات الكروموسوم 6
  • أيقونة بوابةبوابة طب
  • أيقونة بوابةبوابة الكيمياء الحيوية
  • أيقونة بوابةبوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
أيقونة بذرة

هذه بذرة مقالة عن جين على كروموسوم 6 بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.

التصنيفات الطبية
المعرفات الخارجية