MYC

MYC
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1A93, 1EE4, 1MV0, 1NKP, 2A93, 2OR9, 4Y7R

Ідентифікатори
Символи MYC, MRTL, MYCC, bHLHe39, c-Myc, v-myc avian myelocytomatosis viral oncogene homolog, MYC proto-oncogene, bHLH transcription factor, Genes, myc, c-myc
Зовнішні ІД OMIM: 190080 MGI: 97250 HomoloGene: 31092 GeneCards: MYC
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
protein dimerization activity
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
transcription factor binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
E-box binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0032403 protein-containing complex binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

нуклеоплазма
ядерце
клітинне ядро
GO:0009327 protein-containing complex

Біологічний процес

Сигнальний шлях Notch
ремоделювання хроматину
negative regulation of monocyte differentiation
positive regulation of metanephric cap mesenchymal cell proliferation
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
regulation of telomere maintenance
positive regulation of epithelial cell proliferation
positive regulation of fibroblast proliferation
cellular response to UV
oxygen transport
negative regulation of apoptotic process
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:0051312, GO:0007083 chromosome organization
MAPK cascade
cellular response to DNA damage stimulus
positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
branching involved in ureteric bud morphogenesis
negative regulation of cell division
fibroblast apoptotic process
positive regulation of mesenchymal cell proliferation
positive regulation of response to DNA damage stimulus
positive regulation of cell population proliferation
positive regulation of DNA biosynthetic process
регуляція експресії генів
canonical Wnt signaling pathway
negative regulation of stress-activated MAPK cascade
energy reserve metabolic process
response to growth factor
response to gamma radiation
negative regulation of fibroblast proliferation
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
cellular iron ion homeostasis
beta-catenin-TCF complex assembly
transcription, DNA-templated
transcription by RNA polymerase II
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
protein deubiquitination
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of telomerase activity
GO:1901313 positive regulation of gene expression
protein-DNA complex disassembly
ERK1 and ERK2 cascade
cellular response to hypoxia
G1/S transition of mitotic cell cycle
cytokine-mediated signaling pathway
positive regulation of DNA methylation

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4609
17869
Ensembl
ENSG00000136997
ENSMUSG00000022346
UniProt
P01106
P01108
RefSeq (мРНК)
NM_002467
NM_001354870
NM_001177352
NM_001177353
NM_001177354
NM_010849
RefSeq (білок)
NP_002458
NP_001341799
NP_001170823
NP_001170824
NP_001170825
NP_034979
Локус (UCSC) Хр. 8: 127.74 – 127.74 Mb Хр. 15: 61.86 – 61.86 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

MYC (англ. MYC proto-oncogene, bHLH transcription factor) – сім'я регуляторних генів та прото-онкогенів, які кодують однойменні фактори транскрипції. Сімейство Myc складається з трьох споріднених генів людини: c-myc, l-myc і n-myc. c-myc був першим геном, виявленим у цій родині, завдяки гомології з вірусним геном v-myc. При раку c-myc часто виражається конститутивно. Розташований у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 439 амінокислот, а молекулярна маса — 48 804[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MPLNVSFTNRNYDLDYDSVQPYFYCDEEENFYQQQQQSELQPPAPSEDIW
KKFELLPTPPLSPSRRSGLCSPSYVAVTPFSLRGDNDGGGGSFSTADQLE
MVTELLGGDMVNQSFICDPDDETFIKNIIIQDCMWSGFSAAAKLVSEKLA
SYQAARKDSGSPNPARGHSVCSTSSLYLQDLSAAASECIDPSVVFPYPLN
DSSSPKSCASQDSSAFSPSSDSLLSSTESSPQGSPEPLVLHEETPPTTSS
DSEEEQEDEEEIDVVSVEKRQAPGKRSESGSPSAGGHSKPPHSPLVLKRC
HVSTHQHNYAAPPSTRKDYPAAKRVKLDSVRVLRQISNNRKCTSPRSSDT
EENVKRRTHNVLERQRRNELKRSFFALRDQIPELENNEKAPKVVILKKAT
AYILSVQAEEQKLISEEDLLRKRREQLKHKLEQLRNSCA

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Colby W.W., Chen E.Y., Smith D.H., Levinson A.D. (1983). Identification and nucleotide sequence of a human locus homologous to the v-myc oncogene of avian myelocytomatosis virus MC29. Nature. 301: 722—725. PMID 6298632 DOI:10.1038/301722a0
  • Rabbitts T.H., Hamlyn P.H., Baer R. (1983). Altered nucleotide sequences of a translocated c-myc gene in Burkitt lymphoma. Nature. 306: 760—765. PMID 6419122 DOI:10.1038/306760a0
  • Watson D.K., Psallidopoulos M.C., Samuel K.P., Dalla-Favera R., Papas T.S. (1983). Nucleotide sequence analysis of human c-myc locus, chicken homologue, and myelocytomatosis virus MC29 transforming gene reveals a highly conserved gene product. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 80: 3642—3645. PMID 6304729 DOI:10.1073/pnas.80.12.3642
  • Rabbitts T.H., Forster A., Hamlyn P., Baer R. (1984). Effect of somatic mutation within translocated c-myc genes in Burkitt's lymphoma. Nature. 309: 592—597. PMID 6547209 DOI:10.1038/309592a0
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Bentley D.L., Groudine M. (1986). Novel promoter upstream of the human c-myc gene and regulation of c-myc expression in B-cell lymphomas. Mol. Cell. Biol. 6: 3481—3489. PMID 3540591 DOI:10.1128/MCB.6.10.3481

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7553 (англ.) . Архів оригіналу за 31 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
  4. UniProt, P01106 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 8
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші