GATA3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4HC7, 4HC9, 4HCA

Ідентифікатори

Символи

GATA3, HDR, HDRS, GATA binding protein 3

Зовнішні ІД

OMIM: 131320 MGI: 95663 HomoloGene: 1550 GeneCards: GATA3

Пов'язані генетичні захворювання

ревматоїдний артрит, Гострий лімфобластний лейкоз, лімфогранульоматоз, hypoparathyroidism-deafness-renal disease syndrome^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • HMG box domain binding • chromatin binding • зв'язування з іоном металу • DNA binding • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • interleukin-2 receptor binding • core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • protein dimerization activity • E-box binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • zinc ion binding • transcription factor binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001104 transcription coregulator activity
Клітинна компонента	• клітинне ядро • transcription regulator complex • нуклеоплазма
Біологічний процес	• negative regulation of cell population proliferation • regulation of establishment of cell polarity • ureteric bud formation • negative regulation of cell cycle • thymic T cell selection • response to ethanol • positive regulation of T cell differentiation • erythrocyte differentiation • inner ear morphogenesis • cell maturation • regulation of histone H3-K27 methylation • cardiac right ventricle morphogenesis • phosphatidylinositol 3-kinase signaling • norepinephrine biosynthetic process • ear development • homeostasis of number of cells • sympathetic nervous system development • T-helper 2 cell differentiation • regulation of cellular response to X-ray • Детермінація • post-embryonic development • cellular response to BMP stimulus • mesonephros development • neuron differentiation • regulation of neuron apoptotic process • GO:0072468 сигнальна трансдукція • cellular response to cytokine stimulus • cellular response to interleukin-4 • T cell receptor signaling pathway • neuron migration • positive regulation of interleukin-5 production • regulation of CD4-positive, alpha-beta T cell differentiation • parathyroid gland development • negative regulation of DNA demethylation • positive regulation of interleukin-4 production • negative regulation of mammary gland epithelial cell proliferation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • thymus development • нейробіологія розвитку • otic vesicle development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of T-helper 2 cell cytokine production • regulation of nephron tubule epithelial cell differentiation • positive regulation of thyroid hormone generation • lymphocyte migration • negative regulation of interleukin-2 production • regulation of neuron projection development • uterus development • axon guidance • mesenchymal to epithelial transition • negative regulation of cell proliferation involved in mesonephros development • aortic valve morphogenesis • cellular response to tumor necrosis factor • negative regulation of fat cell differentiation • anatomical structure morphogenesis • cellular response to interferon-alpha • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • T cell differentiation • response to virus • negative regulation of endothelial cell apoptotic process • вроджений імунітет • canonical Wnt signaling pathway involved in metanephric kidney development • positive regulation of transcription regulatory region DNA binding • positive regulation of endothelial cell migration • positive regulation of interleukin-13 production • in utero embryonic development • negative regulation of interferon-gamma production • humoral immune response • developmental growth • розвиток нирки • positive regulation of ureteric bud formation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • mast cell differentiation • positive regulation of histone H3-K9 acetylation • positive regulation of cell differentiation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • male gonad development • nephric duct morphogenesis • ventricular septum development • GO:0032737 positive regulation of cytokine production • lens development in camera-type eye • negative regulation of fibroblast growth factor receptor signaling pathway involved in ureteric bud formation • transcription, DNA-templated • negative regulation of gene expression • parathyroid hormone secretion • nephric duct formation • процес імунної системи • negative regulation of inflammatory response • pharyngeal system development • embryonic organ development • response to estrogen • зсідання крові • negative regulation of glial cell-derived neurotrophic factor receptor signaling pathway involved in ureteric bud formation • positive regulation of signal transduction • ureter maturation • positive regulation of histone H3-K14 acetylation • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • response to gamma radiation • GO:0000767 cell morphogenesis • embryonic hemopoiesis • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell motility • pro-T cell differentiation • TOR signaling • type IV hypersensitivity • defense response • regulation of histone H3-K4 methylation • renal system development • positive regulation of protein kinase B signaling • cell activation • ремоделювання хроматину • T cell differentiation in thymus • cochlea development • transcription by RNA polymerase II • protein deubiquitination • anatomical structure formation involved in morphogenesis • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • cytokine-mediated signaling pathway • heart development • animal organ morphogenesis • гістогенез • розвиток клітин • digestive tract development • immune system development • regulation of epithelial cell differentiation • ureter morphogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


2625


14462

Ensembl


ENSG00000107485


ENSMUSG00000015619

UniProt


P23771


P23772

RefSeq (мРНК)


NM_001002295 NM_002051


NM_008091 NM_001355110 NM_001355111 NM_001355112

RefSeq (білок)


NP_001002295 NP_002042


NP_032117 NP_001342039 NP_001342040 NP_001342041

Локус (UCSC)

Хр. 10: 8.05 – 8.08 Mb

Хр. 2: 9.86 – 9.89 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GATA3 (англ. GATA binding protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 443 амінокислот, а молекулярна маса — 47 916^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEVTADQPRW	VSHHHPAVLN	GQHPDTHHPG	LSHSYMDAAQ	YPLPEEVDVL
FNIDGQGNHV	PPYYGNSVRA	TVQRYPPTHH	GSQVCRPPLL	HGSLPWLDGG
KALGSHHTAS	PWNLSPFSKT	SIHHGSPGPL	SVYPPASSSS	LSGGHASPHL
FTFPPTPPKD	VSPDPSLSTP	GSAGSARQDE	KECLKYQVPL	PDSMKLESSH
SRGSMTALGG	ASSSTHHPIT	TYPPYVPEYS	SGLFPPSSLL	GGSPTGFGCK
SRPKARSSTG	RECVNCGATS	TPLWRRDGTG	HYLCNACGLY	HKMNGQNRPL
IKPKRRLSAA	RRAGTSCANC	QTTTTTLWRR	NANGDPVCNA	CGLYYKLHNI
NRPLTMKKEG	IQTRNRKMSS	KSKKCKKVHD	SLEDFPKNSS	FNPAALSRHM
SSLSHISPFS	HSSHMLTTPT	PMHPPSSLSF	GPHHPSSMVT	AMG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Marine J., Winoto A. (1991). The human enhancer-binding protein Gata3 binds to several T-cell receptor regulatory elements. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 7284—7288. PMID 1871134 DOI:10.1073/pnas.88.16.7284
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з GATA3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4172 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, P23771 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 10

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма