PPARA

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1I7G, 1K7L, 1KKQ, 2NPA, 2P54, 2REW, 2ZNN, 3ET1, 3FEI, 3G8I, 3KDT, 3KDU, 3SP6, 3VI8, 4BCR, 4CI4, 5AZT

Ідентифікатори

Символи

PPARA, NR1C1, PPAR, PPARalpha, hPPAR, peroxisome proliferator activated receptor alpha, PPAR-alpha

Зовнішні ІД

MGI: 104740 HomoloGene: 21047 GeneCards: PPARA

Реагує на сполуку

bezafibrate, ciprofibrate, clofibrate, farglitazar, fenofibrate, gemfibrozil, oleic monoethanolamide, pirinixic acid^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • sequence-specific DNA binding • protein domain specific binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • steroid hormone receptor activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin conjugating enzyme binding • lipid binding • transcription factor binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • signaling receptor activity • GO:0032403 protein-containing complex binding • transcription coactivator binding • phosphatase binding • NFAT protein binding • MDM2/MDM4 family protein binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • fatty acid binding • nuclear receptor coactivator activity
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • RNA polymerase II transcription regulator complex
Біологічний процес	• lipoprotein metabolic process • negative regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • positive regulation of fatty acid beta-oxidation • negative regulation of glycolytic process • response to hypoxia • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of blood pressure • lipid metabolism • ритмічний процес • Загоєння ран • negative regulation of leukocyte cell-cell adhesion • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • fatty acid transport • negative regulation of protein binding • negative regulation of appetite • circadian regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • fatty acid metabolic process • behavioral response to nicotine • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of cholesterol storage • response to insulin • heart development • intracellular receptor signaling pathway • negative regulation of transcription regulatory region DNA binding • negative regulation of sequestering of triglyceride • regulation of circadian rhythm • regulation of fatty acid metabolic process • epidermis development • регуляція експресії генів • enamel mineralization • positive regulation of gluconeogenesis • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • negative regulation of inflammatory response • negative regulation of macrophage derived foam cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • steroid hormone mediated signaling pathway • negative regulation of neuron death • positive regulation of fatty acid oxidation • regulation of lipid metabolic process • GO:0072468 сигнальна трансдукція • multicellular organism development • hormone-mediated signaling pathway • диференціація клітин • response to lipid • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of cell growth involved in cardiac muscle cell development
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5465


19013

Ensembl


ENSG00000186951


ENSMUSG00000022383

UniProt


Q07869 Q86SF0


P23204

RefSeq (мРНК)

NM_001001928 NM_001001929 NM_001001930 NM_005036 NM_032644
NM_001362872 NM_001362873 NM_001393941 NM_001393942 NM_001393943 NM_001393944 NM_001393945 NM_001393946 NM_001393947


NM_001113418 NM_011144

RefSeq (білок)


NP_001001928 NP_005027 NP_001349801 NP_001349802


NP_001106889 NP_035274

Локус (UCSC)

Хр. 22: 46.15 – 46.24 Mb

Хр. 15: 85.62 – 85.69 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PPARA (англ. Peroxisome proliferator activated receptor alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 468 амінокислот, а молекулярна маса — 52 225^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVDTESPLCP	LSPLEAGDLE	SPLSEEFLQE	MGNIQEISQS	IGEDSSGSFG
FTEYQYLGSC	PGSDGSVITD	TLSPASSPSS	VTYPVVPGSV	DESPSGALNI
ECRICGDKAS	GYHYGVHACE	GCKGFFRRTI	RLKLVYDKCD	RSCKIQKKNR
NKCQYCRFHK	CLSVGMSHNA	IRFGRMPRSE	KAKLKAEILT	CEHDIEDSET
ADLKSLAKRI	YEAYLKNFNM	NKVKARVILS	GKASNNPPFV	IHDMETLCMA
EKTLVAKLVA	NGIQNKEAEV	RIFHCCQCTS	VETVTELTEF	AKAIPGFANL
DLNDQVTLLK	YGVYEAIFAM	LSSVMNKDGM	LVAYGNGFIT	REFLKSLRKP
FCDIMEPKFD	FAMKFNALEL	DDSDISLFVA	AIICCGDRPG	LLNVGHIEKM
QEGIVHVLRL	HLQSNHPDDI	FLFPKLLQKM	ADLRQLVTEH	AQLVQIIKKT
ESDAALHPLL	QEIYRDMY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами, іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Sher T., Yi H.F., McBride O.W., Gonzales F.J. (1993). cDNA cloning, chromosomal mapping, and functional characterization of the human peroxisome proliferator activated receptor. Biochemistry. 32: 5598—5604. PMID 7684926 DOI:10.1021/bi00072a015
Mukherjee R., Jow L., Noonan D., McDonnell D.P. (1994). Human and rat peroxisome proliferator activated receptors (PPARs) demonstrate similar tissue distribution but different responsiveness to PPAR activators. J. Steroid Biochem. Mol. Biol. 51: 157—166. PMID 7981125 DOI:10.1016/0960-0760(94)90089-2
Tugwood J.D., Aldridge T.C., Lambe K.G., Macdonald N., Woodyatt N.J. (1996). Peroxisome proliferator-activated receptors: structures and function. Ann. N. Y. Acad. Sci. 804: 252—265. PMID 8993548 DOI:10.1111/j.1749-6632.1996.tb18620.x
Kobayashi T., Kodani Y., Nozawa A., Endo Y., Sawasaki T. (2008). DNA-binding profiling of human hormone nuclear receptors via fluorescence correlation spectroscopy in a cell-free system. FEBS Lett. 582: 2737—2744. PMID 18619963 DOI:10.1016/j.febslet.2008.07.003
Li H., Gomes P.J., Chen J.D. (1997). RAC3, a steroid/nuclear receptor-associated coactivator that is related to SRC-1 and TIF2. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 8479—8484. PMID 9238002 DOI:10.1073/pnas.94.16.8479
Gorla-Bajszczak A., Juge-Aubry C., Pernin A., Burger A.G., Meier C.A. (1999). Conserved amino acids in the ligand-binding and tau(i) domains of the peroxisome proliferator-activated receptor alpha are necessary for heterodimerization with RXR. Mol. Cell. Endocrinol. 147: 37—47. PMID 10195690 DOI:10.1016/S0303-7207(98)00217-2

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Peroxisome proliferator activated receptor alpha переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9232 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q07869 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 22

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма