HES5

HES5
Ідентифікатори
Символи HES5, bHLHb38, hes family bHLH transcription factor 5
Зовнішні ІД OMIM: 607348 MGI: 104876 HomoloGene: 7755 GeneCards: HES5
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
protein dimerization activity
transcription factor binding
chromatin binding
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
double-stranded DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001106 transcription corepressor activity
sequence-specific DNA binding
sequence-specific double-stranded DNA binding

Клітинна компонента

нуклеоплазма
клітинне ядро
компонент клітини

Біологічний процес

Сигнальний шлях Notch
auditory receptor cell fate determination
establishment of epithelial cell polarity
диференціація клітин
negative regulation of astrocyte differentiation
regulation of inner ear auditory receptor cell differentiation
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
negative regulation of neuron differentiation
inner ear receptor cell stereocilium organization
comma-shaped body morphogenesis
metanephric nephron tubule morphogenesis
chondrocyte differentiation
central nervous system myelination
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
cell maturation
negative regulation of forebrain neuron differentiation
transcription, DNA-templated
нейробіологія розвитку
negative regulation of stem cell differentiation
neuronal stem cell population maintenance
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
multicellular organism development
glial cell fate commitment
telencephalon development
brain development
inner ear auditory receptor cell differentiation
адгезія клітин
astrocyte differentiation
cartilage development
forebrain radial glial cell differentiation
regulation of myelination
negative regulation of oligodendrocyte differentiation
S-shaped body morphogenesis
neural tube development
neuron differentiation
positive regulation of cell population proliferation
positive regulation of BMP signaling pathway
negative regulation of pro-B cell differentiation
регуляція диференціювання клітин
smoothened signaling pathway
oligodendrocyte development
camera-type eye development
specification of loop of Henle identity
regulation of epithelial cell proliferation
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
negative regulation of inner ear receptor cell differentiation
regulation of neurogenesis
positive regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT
positive regulation of Notch signaling pathway
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
positive regulation of smooth muscle cell proliferation
positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein
GO:0034622 protein-containing complex assembly
somitogenesis
central nervous system development
anterior/posterior pattern specification
negative regulation of inner ear auditory receptor cell differentiation

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
388585
15208
Ensembl
ENSG00000273529
ENSG00000197921
ENSMUSG00000048001
UniProt
Q5TA89
P70120
RefSeq (мРНК)
NM_001010926
NM_010419
NM_001370755
RefSeq (білок)
NP_001010926
NP_034549
NP_001357684
Локус (UCSC) Хр. 1: 2.53 – 2.53 Mb Хр. 4: 155.05 – 155.05 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

HES5 (англ. Hes family bHLH transcription factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 166 амінокислот, а молекулярна маса — 18 226[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAPSTVAVELLSPKEKNRLRKPVVEKMRRDRINSSIEQLKLLLEQEFARH
QPNSKLEKADILEMAVSYLKHSKAFVAAAGPKSLHQDYSEGYSWCLQEAV
QFLTLHAASDTQMKLLYHFQRPPAAPAAPAKEPKAPGAAPPPALSAKATA
AAAAAHQPACGLWRPW

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, нейрогенез. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Katoh M., Katoh M. (2004). Identification and characterization of human HES2, HES3, and HES5 genes in silico. Int. J. Oncol. 25: 529—534. PMID 15254753

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19764 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
  4. UniProt, Q5TA89 (англ.) . Архів оригіналу за 8 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші