THRA

THRA
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1NAV, 2H77, 2H79, 3HZF, 3ILZ, 3JZB, 4LNW, 4LNX

Ідентифікатори
Символи THRA, AR7, CHNG6, EAR7, ERB-T-1, ERBA, ERBA1, NR1A1, THRA1, THRA2, c-ERBA-1, thyroid hormone receptor, alpha, thyroid hormone receptor alpha, TRalpha
Зовнішні ІД OMIM: 190120 MGI: 98742 HomoloGene: 37747 GeneCards: THRA
Пов'язані генетичні захворювання
congenital nongoitrous hypothryoidism 6[1]
Реагує на сполуку
DL-3,3',5'-triiodothyronine, tiratricol, трийодтиронін, левотироксин[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
single-stranded RNA binding
zinc ion binding
chromatin DNA binding
GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity
steroid receptor RNA activator RNA binding
transcription factor binding
TBP-class protein binding
steroid hormone receptor activity
DNA binding
protein domain specific binding
sequence-specific DNA binding
зв'язування з іоном металу
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
thyroid hormone binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0032403 protein-containing complex binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
nuclear receptor coactivator activity
signaling receptor activity

Клітинна компонента

цитоплазма
нуклеоплазма
клітинне ядро
гіалоплазма
RNA polymerase II transcription regulator complex

Біологічний процес

GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
response to cold
cytoplasmic sequestering of transcription factor
hormone-mediated signaling pathway
regulation of thyroid hormone mediated signaling pathway
thyroid gland development
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
осифікація
female courtship behavior
cartilage condensation
negative regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly
type I pneumocyte differentiation
transcription, DNA-templated
steroid hormone mediated signaling pathway
transcription by RNA polymerase II
regulation of lipid catabolic process
regulation of heart contraction
animal organ morphogenesis
positive regulation of female receptivity
learning or memory
regulation of myeloid cell apoptotic process
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription initiation from RNA polymerase II promoter
erythrocyte differentiation
negative regulation of DNA-templated transcription, initiation
positive regulation of myotube differentiation
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
intracellular receptor signaling pathway
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
thyroid hormone mediated signaling pathway
multicellular organism development
brain development
диференціація клітин
response to lipid
positive regulation of cold-induced thermogenesis

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7067
21833
Ensembl
ENSG00000126351
ENSMUSG00000058756
UniProt
P10827
P63058
RefSeq (мРНК)
NM_199334
NM_001190918
NM_001190919
NM_003250
NM_178060
NM_001313983
RefSeq (білок)
NP_001177847
NP_001177848
NP_003241
NP_955366
NP_001300912
NP_835161
Локус (UCSC) Хр. 17: 40.06 – 40.09 Mb Хр. 11: 98.63 – 98.66 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

THRA (англ. Thyroid hormone receptor, alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 490 амінокислот, а молекулярна маса — 54 816[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEQKPSKVECGSDPEENSARSPDGKRKRKNGQCSLKTSMSGYIPSYLDKD
EQCVVCGDKATGYHYRCITCEGCKGFFRRTIQKNLHPTYSCKYDSCCVID
KITRNQCQLCRFKKCIAVGMAMDLVLDDSKRVAKRKLIEQNRERRRKEEM
IRSLQQRPEPTPEEWDLIHIATEAHRSTNAQGSHWKQRRKFLPDDIGQSP
IVSMPDGDKVDLEAFSEFTKIITPAITRVVDFAKKLPMFSELPCEDQIIL
LKGCCMEIMSLRAAVRYDPESDTLTLSGEMAVKREQLKNGGLGVVSDAIF
ELGKSLSAFNLDDTEVALLQAVLLMSTDRSGLLCVDKIEKSQEAYLLAFE
HYVNHRKHNIPHFWPKLLMKEREVQSSILYKGAAAEGRPGGSLGVHPEGQ
QLLGMHVVQGPQVRQLEQQLGEAGSLQGPVLQHQSPKSPQQRLLELLHRS
GILHARAVCGEDDSSEADSPSSSEEEPEVCEDLAGNAASP

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Pfahl M., Benbrook D. (1987). Nucleotide sequence of cDNA encoding a novel human thyroid hormone receptor. Nucleic Acids Res. 15: 9613—9613. PMID 3684612 DOI:10.1093/nar/15.22.9613
  • Nakai A., Sakurai A., Bell G.I., Degroot L.J. (1988). Characterization of a third human thyroid hormone receptor coexpressed with other thyroid hormone receptors in several tissues. Mol. Endocrinol. 2: 1087—1092. PMID 2464749 DOI:10.1210/mend-2-11-1087
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Benbrook D., Pfahl M. (1987). A novel thyroid hormone receptor encoded by a cDNA clone from a human testis library. Science. 238: 788—791. PMID 3672126 DOI:10.1126/science.3672126
  • Yang Y.Z., Burgos-Trinidad M., Wu Y., Koenig R.J. (1996). Thyroid hormone receptor variant alpha2. Role of the ninth heptad in dna binding, heterodimerization with retinoid X receptors, and dominant negative activity. J. Biol. Chem. 271: 28235—28242. PMID 8910441 DOI:10.1074/jbc.271.45.28235

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з THRA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Thyroid hormone receptor alpha переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11796 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  6. UniProt, P10827 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 17
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші