GLI1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2GLI, 4BLB, 4KMD

Ідентифікатори

Символи

GLI1, GLI, GLI family zinc finger 1, PAPA8, PPD1

Зовнішні ІД

OMIM: 165220 MGI: 95727 HomoloGene: 3859 GeneCards: GLI1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • microtubule binding • chromatin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • війка • нуклеоплазма • ciliary base • ciliary tip • GO:0035085 Аксонема • клітинне ядро
Біологічний процес	• epidermal cell differentiation • proximal/distal pattern formation • диференціація клітин • pituitary gland development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of smoothened signaling pathway • lung development • positive regulation of cell migration • smoothened signaling pathway involved in regulation of cerebellar granule cell precursor cell proliferation • notochord regression • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of DNA replication • ventral midline development • multicellular organism development • regulation of smoothened signaling pathway • liver regeneration • response to wounding • regulation of osteoblast differentiation • osteoblast differentiation • Сперматогенез • positive regulation of cell population proliferation • cerebellar cortex morphogenesis • regulation of hepatocyte proliferation • canonical Wnt signaling pathway • smoothened signaling pathway • dorsal/ventral pattern formation • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • digestive tract morphogenesis • prostate gland development • positive regulation of cardiac muscle cell proliferation • positive regulation of cell cycle G1/S phase transition
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


2735


14632

Ensembl


ENSG00000111087


ENSMUSG00000025407

UniProt


P08151


P47806

RefSeq (мРНК)


NM_001160045 NM_001167609 NM_005269


NM_010296

RefSeq (білок)


NP_001153517 NP_001161081 NP_005260


NP_034426

Локус (UCSC)

Хр. 12: 57.46 – 57.47 Mb

Хр. 10: 127.17 – 127.18 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GLI1 (англ. GLI family zinc finger 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 106 амінокислот, а молекулярна маса — 117 904^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFNSMTPPPI	SSYGEPCCLR	PLPSQGAPSV	GTEGLSGPPF	CHQANLMSGP
HSYGPARETN	SCTEGPLFSS	PRSAVKLTKK	RALSISPLSD	ASLDLQTVIR
TSPSSLVAFI	NSRCTSPGGS	YGHLSIGTMS	PSLGFPAQMN	HQKGPSPSFG
VQPCGPHDSA	RGGMIPHPQS	RGPFPTCQLK	SELDMLVGKC	REEPLEGDMS
SPNSTGIQDP	LLGMLDGRED	LEREEKREPE	SVYETDCRWD	GCSQEFDSQE
QLVHHINSEH	IHGERKEFVC	HWGGCSRELR	PFKAQYMLVV	HMRRHTGEKP
HKCTFEGCRK	SYSRLENLKT	HLRSHTGEKP	YMCEHEGCSK	AFSNASDRAK
HQNRTHSNEK	PYVCKLPGCT	KRYTDPSSLR	KHVKTVHGPD	AHVTKRHRGD
GPLPRAPSIS	TVEPKREREG	GPIREESRLT	VPEGAMKPQP	SPGAQSSCSS
DHSPAGSAAN	TDSGVEMTGN	AGGSTEDLSS	LDEGPCIAGT	GLSTLRRLEN
LRLDQLHQLR	PIGTRGLKLP	SLSHTGTTVS	RRVGPPVSLE	RRSSSSSSIS
SAYTVSRRSS	LASPFPPGSP	PENGASSLPG	LMPAQHYLLR	ARYASARGGG
TSPTAASSLD	RIGGLPMPPW	RSRAEYPGYN	PNAGVTRRAS	DPAQAADRPA
PARVQRFKSL	GCVHTPPTVA	GGGQNFDPYL	PTSVYSPQPP	SITENAAMDA
RGLQEEPEVG	TSMVGSGLNP	YMDFPPTDTL	GYGGPEGAAA	EPYGARGPGS
LPLGPGPPTN	YGPNPCPQQA	SYPDPTQETW	GEFPSHSGLY	PGPKALGGTY
SQCPRLEHYG	QVQVKPEQGC	PVGSDSTGLA	PCLNAHPSEG	PPHPQPLFSH
YPQPSPPQYL	QSGPYTQPPP	DYLPSEPRPC	LDFDSPTHST	GQLKAQLVCN
YVQSQQELLW	EGGGREDAPA	QEPSYQSPKF	LGGSQVSPSR	AKAPVNTYGP
GFGPNLPNHK	SGSYPTPSPC	HENFVVGANR	ASHRAAAPPR	LLPPLPTCYG
PLKVGGTNPS	CGHPEVGRLG	GGPALYPPPE	GQVCNPLDSL	DLDNTQLDFV
AILDEPQGLS	PPPSHDQRGS	SGHTPPPSGP	PNMAVGNMSV	LLRSLPGETE
FLNSSA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Kinzler K.W., Ruppert J.M., Bigner S.H., Vogelstein B. (1988). The GLI gene is a member of the Kruppel family of zinc finger proteins. Nature. 332: 371—374. PMID 2832761 DOI:10.1038/332371a0
Lo H.W., Zhu H., Cao X., Aldrich A., Ali-Osman F. (2009). A novel splice variant of GLI1 that promotes glioblastoma cell migration and invasion. Cancer Res. 69: 6790—6798. PMID 19706761 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-09-0886
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kinzler K.W., Vogelstein B. (1990). The GLI gene encodes a nuclear protein which binds specific sequences in the human genome. Mol. Cell. Biol. 10: 634—642. PMID 2105456 DOI:10.1128/MCB.10.2.634
Koyabu Y., Nakata K., Mizugishi K., Aruga J., Mikoshiba K. (2001). Physical and functional interactions between Zic and Gli proteins. J. Biol. Chem. 276: 6889—6892. PMID 11238441 DOI:10.1074/jbc.C000773200
Maloverjan A., Piirsoo M., Michelson P., Kogerman P., Osterlund T. (2010). Identification of a novel serine/threonine kinase ULK3 as a positive regulator of Hedgehog pathway. Exp. Cell Res. 316: 627—637. PMID 19878745 DOI:10.1016/j.yexcr.2009.10.018

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4317 (англ.) . Архів оригіналу за 27 липня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, P08151 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма