RORB

RORB
Ідентифікатори
Символи RORB, NR1F2, ROR-BETA, RZR-BETA, RZRB, bA133M9.1, RAR-related orphan receptor beta, RAR related orphan receptor B, EIG15
Зовнішні ІД OMIM: 601972 MGI: 1343464 HomoloGene: 38250 GeneCards: RORB
Пов'язані генетичні захворювання
аметропія, generalized epilepsy[1]
Реагує на сполуку
третиноїн[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

sequence-specific DNA binding
DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
zinc ion binding
transcription factor binding
зв'язування з іоном металу
steroid hormone receptor activity
GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
melatonin receptor activity

Клітинна компонента

нуклеоплазма
клітинне ядро

Біологічний процес

cellular response to retinoic acid
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
відповідь на стимул
ритмічний процес
retinal cone cell development
negative regulation of osteoblast differentiation
transcription, DNA-templated
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
multicellular organism development
regulation of circadian rhythm
retinal rod cell development
eye photoreceptor cell development
transcription initiation from RNA polymerase II promoter
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
зір
steroid hormone mediated signaling pathway
intracellular receptor signaling pathway
amacrine cell differentiation
retina development in camera-type eye
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
G protein-coupled receptor signaling pathway
transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6096
225998
Ensembl
ENSG00000198963
ENSMUSG00000036192
UniProt
Q92753
Q58EY0
Q8R1B8
RefSeq (мРНК)
NM_006914
NM_001365023
NM_001043354
NM_001289921
NM_146095
RefSeq (білок)
NP_008845
NP_001351952
NP_001036819
NP_001276850
NP_666207
Локус (UCSC) Хр. 9: 74.5 – 74.69 Mb Хр. 19: 18.91 – 19.09 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

RORB (англ. Nuclear receptor ROR-beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 470 амінокислот, а молекулярна маса — 53 220[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MCENQLKTKADATAQIEVIPCKICGDKSSGIHYGVITCEGCKGFFRRSQQ
NNASYSCPRQRNCLIDRTNRNRCQHCRLQKCLALGMSRDAVKFGRMSKKQ
RDSLYAEVQKHQQRLQEQRQQQSGEAEALARVYSSSISNGLSNLNNETSG
TYANGHVIDLPKSEGYYNVDSGQPSPDQSGLDMTGIKQIKQEPIYDLTSV
PNLFTYSSFNNGQLAPGITMTEIDRIAQNIIKSHLETCQYTMEELHQLAW
QTHTYEEIKAYQSKSREALWQQCAIQITHAIQYVVEFAKRITGFMELCQN
DQILLLKSGCLEVVLVRMCRAFNPLNNTVLFEGKYGGMQMFKALGSDDLV
NEAFDFAKNLCSLQLTEEEIALFSSAVLISPDRAWLIEPRKVQKLQEKIY
FALQHVIQKNHLDDETLAKLIAKIPTITAVCNLHGEKLQVFKQSHPEIVN
TLFPPLYKELFNPDCATGCK

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з RORB переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Nuclear receptor ROR-beta переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10259 (англ.) . Архів оригіналу за 4 квітня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
  6. UniProt, Q92753 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 9
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші