AHR

AHR
Ідентифікатори
Символи AHR, bHLHe76, aryl hydrocarbon receptor, Aryl hydrocarbon receptor, RP85
Зовнішні ІД OMIM: 600253 MGI: 105043 HomoloGene: 1224 GeneCards: AHR
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
Hsp90 protein binding
protein dimerization activity
transcription factor binding
GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity
E-box binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
protein heterodimerization activity
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
TFIID-class transcription factor complex binding
transcription coactivator binding
TBP-class protein binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
protein homodimerization activity
sequence-specific double-stranded DNA binding

Клітинна компонента

цитоплазма
transcription regulator complex
cytosolic aryl hydrocarbon receptor complex
nuclear aryl hydrocarbon receptor complex
клітинне ядро
aryl hydrocarbon receptor complex
гіалоплазма
нуклеоплазма
GO:0009327 protein-containing complex

Біологічний процес

GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
ритмічний процес
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription by RNA polymerase II
circadian regulation of gene expression
transcription, DNA-templated
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
regulation of B cell proliferation
blood vessel development
регуляція експресії генів
xenobiotic metabolic process
клітинний цикл
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
response to toxic substance
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:0097285 апоптоз
intracellular receptor signaling pathway
GO:1901555, GO:1905705 response to drug
cAMP-mediated signaling
cellular response to cAMP
cellular response to forskolin
cellular response to 2,3,7,8-tetrachlorodibenzodioxine

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
196
11622
Ensembl
ENSG00000106546
ENSMUSG00000019256
UniProt
P35869
P30561
RefSeq (мРНК)
NM_001621
NM_013464
NM_001314027
RefSeq (білок)
NP_001612
NP_001300956
NP_038492
Локус (UCSC) Хр. 7: 16.92 – 17.35 Mb Хр. 12: 35.55 – 35.59 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

AHR (англ. Aryl hydrocarbon receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 848 амінокислот, а молекулярна маса — 96 147[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MNSSSANITYASRKRRKPVQKTVKPIPAEGIKSNPSKRHRDRLNTELDRL
ASLLPFPQDVINKLDKLSVLRLSVSYLRAKSFFDVALKSSPTERNGGQDN
CRAANFREGLNLQEGEFLLQALNGFVLVVTTDALVFYASSTIQDYLGFQQ
SDVIHQSVYELIHTEDRAEFQRQLHWALNPSQCTESGQGIEEATGLPQTV
VCYNPDQIPPENSPLMERCFICRLRCLLDNSSGFLAMNFQGKLKYLHGQK
KKGKDGSILPPQLALFAIATPLQPPSILEIRTKNFIFRTKHKLDFTPIGC
DAKGRIVLGYTEAELCTRGSGYQFIHAADMLYCAESHIRMIKTGESGMIV
FRLLTKNNRWTWVQSNARLLYKNGRPDYIIVTQRPLTDEEGTEHLRKRNT
KLPFMFTTGEAVLYEATNPFPAIMDPLPLRTKNGTSGKDSATTSTLSKDS
LNPSSLLAAMMQQDESIYLYPASSTSSTAPFENNFFNESMNECRNWQDNT
APMGNDTILKHEQIDQPQDVNSFAGGHPGLFQDSKNSDLYSIMKNLGIDF
EDIRHMQNEKFFRNDFSGEVDFRDIDLTDEILTYVQDSLSKSPFIPSDYQ
QQQSLALNSSCMVQEHLHLEQQQQHHQKQVVVEPQQQLCQKMKHMQVNGM
FENWNSNQFVPFNCPQQDPQQYNVFTDLHGISQEFPYKSEMDSMPYTQNF
ISCNQPVLPQHSKCTELDYPMGSFEPSPYPTTSSLEDFVTCLQLPENQKH
GLNPQSAIITPQTCYAGAVSMYQCQPEPQHTHVGQMQYNPVLPGQQAFLN
KFQNGVLNETYPAELNNINNTQTTTHLQPLHHPSEARPFPDLTSSGFL

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рецепторів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, біологічні ритми, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Itoh S., Kamataki T. (1993). Human Ah receptor cDNA: analysis for highly conserved sequences. Nucleic Acids Res. 21: 3578—3578. PMID 8393992 DOI:10.1093/nar/21.15.3578
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Bennett P., Ramsden D.B., Williams A.C. (1996). Complete structural characterisation of the human aryl hydrocarbon receptor gene. Clin. Mol. Pathol. 49: M12—M16. PMID 16696038 DOI:10.1136/mp.49.1.M12
  • Nguyen T.A., Hoivik D., Lee J.-E., Safe S. (1999). Interactions of nuclear receptor coactivator/corepressor proteins with the aryl hydrocarbon receptor complex. Arch. Biochem. Biophys. 367: 250—257. PMID 10395741 DOI:10.1006/abbi.1999.1282
  • Puga A., Xia Y., Elferink C. (2002). Role of the aryl hydrocarbon receptor in cell cycle regulation. Chem. Biol. Interact. 141: 117—130. PMID 12213388 DOI:10.1016/S0009-2797(02)00069-8
  • Antenos M., Casper R.F., Brown T.J. (2002). Interaction with Nedd8, a ubiquitin-like protein, enhances the transcriptional activity of the aryl hydrocarbon receptor. J. Biol. Chem. 277: 44028—44034. PMID 12215427 DOI:10.1074/jbc.M202413200

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:348 (англ.) . Архів оригіналу за 21 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
  4. UniProt, P35869 (англ.) . Архів оригіналу за 13 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 7

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші


Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.