TRPC6

Ідентифікатори

Символи

TRPC6, FSGS2, TRP6, transient receptor potential cation channel subfamily C member 6

Зовнішні ІД

OMIM: 603652 MGI: 109523 HomoloGene: 37944 GeneCards: TRPC6

Пов'язані генетичні захворювання

focal segmental glomerulosclerosis 2, focal segmental glomerulosclerosis, familial idiopathic steroid-resistant nephrotic syndrome^[1]

Реагує на сполуку

20-HETE, Арахідонова кислота, 2-aminoethoxydiphenylborate, гідрон^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• actinin binding • store-operated calcium channel activity • clathrin binding • inositol 1,4,5 trisphosphate binding • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin binding • calcium channel activity • cation channel activity • protein homodimerization activity • ATPase binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • slit diaphragm • cation channel complex
Біологічний процес	• regulation of cytosolic calcium ion concentration • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration • GO:0010260 старіння людини • cation transport • ion transport • single fertilization • platelet activation • positive regulation of ion transmembrane transporter activity • negative regulation of dendrite morphogenesis • positive regulation of peptidyl-threonine phosphorylation • calcium ion transmembrane transport • positive regulation of neuron differentiation • neuron differentiation • manganese ion transport • cellular response to hypoxia • calcium ion transport • cellular response to hydrogen peroxide • positive regulation of calcium ion transport • трансмембранний транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7225


22068

Ensembl


ENSG00000137672


ENSMUSG00000031997

UniProt


Q9Y210


Q61143

RefSeq (мРНК)


NM_004621


NM_001282086 NM_001282087 NM_013838

RefSeq (білок)


NP_004612


NP_001269015 NP_001269016 NP_038866

Локус (UCSC)

Хр. 11: 101.45 – 101.87 Mb

Хр. 9: 8.54 – 8.68 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRPC6 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily C member 6) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 931 амінокислот, а молекулярна маса — 106 326^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSQSPAFGPR	RGSSPRGAAG	AAARRNESQD	YLLMDSELGE	DGCPQAPLPC
YGYYPCFRGS	DNRLAHRRQT	VLREKGRRLA	NRGPAYMFSD	RSTSLSIEEE
RFLDAAEYGN	IPVVRKMLEE	CHSLNVNCVD	YMGQNALQLA	VANEHLEITE
LLLKKENLSR	VGDALLLAIS	KGYVRIVEAI	LSHPAFAEGK	RLATSPSQSE
LQQDDFYAYD	EDGTRFSHDV	TPIILAAHCQ	EYEIVHTLLR	KGARIERPHD
YFCKCNDCNQ	KQKHDSFSHS	RSRINAYKGL	ASPAYLSLSS	EDPVMTALEL
SNELAVLANI	EKEFKNDYKK	LSMQCKDFVV	GLLDLCRNTE	EVEAILNGDV
ETLQSGDHGR	PNLSRLKLAI	KYEVKKFVAH	PNCQQQLLSI	WYENLSGLRQ
QTMAVKFLVV	LAVAIGLPFL	ALIYWFAPCS	KMGKIMRGPF	MKFVAHAASF
TIFLGLLVMN	AADRFEGTKL	LPNETSTDNA	KQLFRMKTSC	FSWMEMLIIS
WVIGMIWAEC	KEIWTQGPKE	YLFELWNMLD	FGMLAIFAAS	FIARFMAFWH
ASKAQSIIDA	NDTLKDLTKV	TLGDNVKYYN	LARIKWDPSD	PQIISEGLYA
IAVVLSFSRI	AYILPANESF	GPLQISLGRT	VKDIFKFMVI	FIMVFVAFMI
GMFNLYSYYI	GAKQNEAFTT	VEESFKTLFW	AIFGLSEVKS	VVINYNHKFI
ENIGYVLYGV	YNVTMVIVLL	NMLIAMINSS	FQEIEDDADV	EWKFARAKLW
FSYFEEGRTL	PVPFNLVPSP	KSLFYLLLKL	KKWISELFQG	HKKGFQEDAE
MNKINEEKKL	GILGSHEDLS	KLSLDKKQVG	HNKQPSIRSS	EDFHLNSFNN
PPRQYQKIMK	RLIKRYVLQA	QIDKESDEVN	EGELKEIKQD	ISSLRYELLE
EKSQNTEDLA	ELIRELGEKL	SMEPNQEETN	R

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lussier M. P., Lepage P. K., Bousquet S. M., Boulay G. (2008). RNF24, a new TRPC interacting protein, causes the intracellular retention of TRPC. Cell Calcium. 43: 432—443. PMID 17850865 DOI:10.1016/j.ceca.2007.07.009

Див. також

Хромосома 11

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TRPC6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily C member 6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12338 (англ.) . Архів оригіналу за 15 травня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y210 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані