RYR2

RYR2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

4JKQ

Ідентифікатори
Символи RYR2, ARVC2, ARVD2, RYR-2, RyR, VTSIP, ryanodine receptor 2, VACRDS
Зовнішні ІД OMIM: 180902 MGI: 99685 HomoloGene: 37423 GeneCards: RYR2
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння, lymphoblastic leukemia, arrhythmogenic right ventricular dysplasia 2, arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy[1]
Реагує на сполуку
Аденозинтрифосфат, кофеїн, сурамін, прокаїн[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

transmembrane transporter binding
calcium channel activity
calcium-induced calcium release activity
protein kinase A catalytic subunit binding
organic cyclic compound binding
protein self-association
ion channel activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
identical protein binding
enzyme binding
suramin binding
protein kinase A regulatory subunit binding
protein kinase binding
calcium-release channel activity
ryanodine-sensitive calcium-release channel activity
calcium ion binding
calmodulin binding

Клітинна компонента

integral component of membrane
Кальцієві канали
мембрана
саркомера
junctional sarcoplasmic reticulum membrane
sarcoplasmic reticulum
Z disc
sarcoplasmic reticulum membrane
smooth endoplasmic reticulum
клітинна мембрана
GO:0009327 protein-containing complex
cytoplasmic vesicle membrane
Сарколема

Біологічний процес

response to muscle stretch
release of sequestered calcium ion into cytosol
calcium ion transport into cytosol
regulation of cardiac conduction
regulation of cardiac muscle contraction by calcium ion signaling
release of sequestered calcium ion into cytosol by sarcoplasmic reticulum
response to hypoxia
cardiac muscle contraction
regulation of cytosolic calcium ion concentration
positive regulation of the force of heart contraction
regulation of cardiac muscle contraction by regulation of the release of sequestered calcium ion
cardiac muscle hypertrophy
ventricular cardiac muscle cell action potential
cell communication by electrical coupling involved in cardiac conduction
cellular calcium ion homeostasis
establishment of protein localization to endoplasmic reticulum
ion transport
BMP signaling pathway
left ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis
регуляція серцевого ритму
positive regulation of heart rate
detection of calcium ion
response to redox state
cellular response to epinephrine stimulus
multicellular organism development
ion transmembrane transport
positive regulation of sequestering of calcium ion
embryonic heart tube morphogenesis
calcium ion transmembrane transport
cellular response to caffeine
sarcoplasmic reticulum calcium ion transport
canonical Wnt signaling pathway
regulation of SA node cell action potential
response to caffeine
regulation of cardiac muscle contraction
regulation of ventricular cardiac muscle cell action potential
regulation of AV node cell action potential
calcium-mediated signaling using intracellular calcium source
response to muscle activity
calcium ion transport
calcium-mediated signaling
type B pancreatic cell apoptotic process
regulation of atrial cardiac muscle cell action potential
positive regulation of ATPase-coupled calcium transmembrane transporter activity
Purkinje myocyte to ventricular cardiac muscle cell signaling
трансмембранний транспорт

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6262
20191
Ensembl
ENSG00000198626
ENSMUSG00000021313
UniProt
Q92736
E9Q401
RefSeq (мРНК)
NM_001035
NM_023868
RefSeq (білок)
NP_001026
NP_076357
Локус (UCSC) Хр. 1: 237.04 – 237.83 Mb Хр. 13: 11.55 – 12.11 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

RYR2 (англ. Ryanodine receptor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 967 амінокислот, а молекулярна маса — 564 567[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MADGGEGEDEIQFLRTDDEVVLQCTATIHKEQQKLCLAAEGFGNRLCFLE
STSNSKNVPPDLSICTFVLEQSLSVRALQEMLANTVEKSEGQVDVEKWKF
MMKTAQGGGHRTLLYGHAILLRHSYSGMYLCCLSTSRSSTDKLAFDVGLQ
EDTTGEACWWTIHPASKQRSEGEKVRVGDDLILVSVSSERYLHLSYGNGS
LHVDAAFQQTLWSVAPISSGSEAAQGYLIGGDVLRLLHGHMDECLTVPSG
EHGEEQRRTVHYEGGAVSVHARSLWRLETLRVAWSGSHIRWGQPFRLRHV
TTGKYLSLMEDKNLLLMDKEKADVKSTAFTFRSSKEKLDVGVRKEVDGMG
TSEIKYGDSVCYIQHVDTGLWLTYQSVDVKSVRMGSIQRKAIMHHEGHMD
DGISLSRSQHEESRTARVIRSTVFLFNRFIRGLDALSKKAKASTVDLPIE
SVSLSLQDLIGYFHPPDEHLEHEDKQNRLRALKNRQNLFQEEGMINLVLE
CIDRLHVYSSAAHFADVAGREAGESWKSILNSLYELLAALIRGNRKNCAQ
FSGSLDWLISRLERLEASSGILEVLHCVLVESPEALNIIKEGHIKSIISL
LDKHGRNHKVLDVLCSLCVCHGVAVRSNQHLICDNLLPGRDLLLQTRLVN
HVSSMRPNIFLGVSEGSAQYKKWYYELMVDHTEPFVTAEATHLRVGWAST
EGYSPYPGGGEEWGGNGVGDDLFSYGFDGLHLWSGCIARTVSSPNQHLLR
TDDVISCCLDLSAPSISFRINGQPVQGMFENFNIDGLFFPVVSFSAGIKV
RFLLGGRHGEFKFLPPPGYAPCYEAVLPKEKLKVEHSREYKQERTYTRDL
LGPTVSLTQAAFTPIPVDTSQIVLPPHLERIREKLAENIHELWVMNKIEL
GWQYGPVRDDNKRQHPCLVEFSKLPEQERNYNLQMSLETLKTLLALGCHV
GISDEHAEDKVKKMKLPKNYQLTSGYKPAPMDLSFIKLTPSQEAMVDKLA
ENAHNVWARDRIRQGWTYGIQQDVKNRRNPRLVPYTLLDDRTKKSNKDSL
REAVRTLLGYGYNLEAPDQDHAARAEVCSGTGERFRIFRAEKTYAVKAGR
WYFEFETVTAGDMRVGWSRPGCQPDQELGSDERAFAFDGFKAQRWHQGNE
HYGRSWQAGDVVGCMVDMNEHTMMFTLNGEILLDDSGSELAFKDFDVGDG
FIPVCSLGVAQVGRMNFGKDVSTLKYFTICGLQEGYEPFAVNTNRDITMW
LSKRLPQFLQVPSNHEHIEVTRIDGTIDSSPCLKVTQKSFGSQNSNTDIM
FYRLSMPIECAEVFSKTVAGGLPGAGLFGPKNDLEDYDADSDFEVLMKTA
HGHLVPDRVDKDKEATKPEFNNHKDYAQEKPSRLKQRFLLRRTKPDYSTS
HSARLTEDVLADDRDDYDFLMQTSTYYYSVRIFPGQEPANVWVGWITSDF
HQYDTGFDLDRVRTVTVTLGDEKGKVHESIKRSNCYMVCAGESMSPGQGR
NNNGLEIGCVVDAASGLLTFIANGKELSTYYQVEPSTKLFPAVFAQATSP
NVFQFELGRIKNVMPLSAGLFKSEHKNPVPQCPPRLHVQFLSHVLWSRMP
NQFLKVDVSRISERQGWLVQCLDPLQFMSLHIPEENRSVDILELTEQEEL
LKFHYHTLRLYSAVCALGNHRVAHALCSHVDEPQLLYAIENKYMPGLLRA
GYYDLLIDIHLSSYATARLMMNNEYIVPMTEETKSITLFPDENKKHGLPG
IGLSTSLRPRMQFSSPSFVSISNECYQYSPEFPLDILKSKTIQMLTEAVK
EGSLHARDPVGGTTEFLFVPLIKLFYTLLIMGIFHNEDLKHILQLIEPSV
FKEAATPEEESDTLEKELSVDDAKLQGAGEEEAKGGKRPKEGLLQMKLPE
PVKLQMCLLLQYLCDCQVRHRIEAIVAFSDDFVAKLQDNQRFRYNEVMQA
LNMSAALTARKTKEFRSPPQEQINMLLNFKDDKSECPCPEEIRDQLLDFH
EDLMTHCGIELDEDGSLDGNSDLTIRGRLLSLVEKVTYLKKKQAEKPVES
DSKKSSTLQQLISETMVRWAQESVIEDPELVRAMFVLLHRQYDGIGGLVR
ALPKTYTINGVSVEDTINLLASLGQIRSLLSVRMGKEEEKLMIRGLGDIM
NNKVFYQHPNLMRALGMHETVMEVMVNVLGGGESKEITFPKMVANCCRFL
CYFCRISRQNQKAMFDHLSYLLENSSVGLASPAMRGSTPLDVAAASVMDN
NELALALREPDLEKVVRYLAGCGLQSCQMLVSKGYPDIGWNPVEGERYLD
FLRFAVFCNGESVEENANVVVRLLIRRPECFGPALRGEGGNGLLAAMEEA
IKIAEDPSRDGPSPNSGSSKTLDTEEEEDDTIHMGNAIMTFYSALIDLLG
RCAPEMHLIHAGKGEAIRIRSILRSLIPLGDLVGVISIAFQMPTIAKDGN
VVEPDMSAGFCPDHKAAMVLFLDRVYGIEVQDFLLHLLEVGFLPDLRAAA
SLDTAALSATDMALALNRYLCTAVLPLLTRCAPLFAGTEHHASLIDSLLH
TVYRLSKGCSLTKAQRDSIEVCLLSICGQLRPSMMQHLLRRLVFDVPLLN
EHAKMPLKLLTNHYERCWKYYCLPGGWGNFGAASEEELHLSRKLFWGIFD
ALSQKKYEQELFKLALPCLSAVAGALPPDYMESNYVSMMEKQSSMDSEGN
FNPQPVDTSNITIPEKLEYFINKYAEHSHDKWSMDKLANGWIYGEIYSDS
SKVQPLMKPYKLLSEKEKEIYRWPIKESLKTMLAWGWRIERTREGDSMAL
YNRTRRISQTSQVSVDAAHGYSPRAIDMSNVTLSRDLHAMAEMMAENYHN
IWAKKKKMELESKGGGNHPLLVPYDTLTAKEKAKDREKAQDILKFLQING
YAVSRGFKDLELDTPSIEKRFAYSFLQQLIRYVDEAHQYILEFDGGSRGK
GEHFPYEQEIKFFAKVVLPLIDQYFKNHRLYFLSAASRPLCSGGHASNKE
KEMVTSLFCKLGVLVRHRISLFGNDATSIVNCLHILGQTLDARTVMKTGL
ESVKSALRAFLDNAAEDLEKTMENLKQGQFTHTRNQPKGVTQIINYTTVA
LLPMLSSLFEHIGQHQFGEDLILEDVQVSCYRILTSLYALGTSKSIYVER
QRSALGECLAAFAGAFPVAFLETHLDKHNIYSIYNTKSSRERAALSLPTN
VEDVCPNIPSLEKLMEEIVELAESGIRYTQMPHVMEVILPMLCSYMSRWW
EHGPENNPERAEMCCTALNSEHMNTLLGNILKIIYNNLGIDEGAWMKRLA
VFSQPIINKVKPQLLKTHFLPLMEKLKKKAATVVSEEDHLKAEARGDMSE
AELLILDEFTTLARDLYAFYPLLIRFVDYNRAKWLKEPNPEAEELFRMVA
EVFIYWSKSHNFKREEQNFVVQNEINNMSFLITDTKSKMSKAAVSDQERK
KMKRKGDRYSMQTSLIVAALKRLLPIGLNICAPGDQELIALAKNRFSLKD
TEDEVRDIIRSNIHLQGKLEDPAIRWQMALYKDLPNRTDDTSDPEKTVER
VLDIANVLFHLEQKSKRVGRRHYCLVEHPQRSKKAVWHKLLSKQRKRAVV
ACFRMAPLYNLPRHRAVNLFLQGYEKSWIETEEHYFEDKLIEDLAKPGAE
PPEEDEGTKRVDPLHQLILLFSRTALTEKCKLEEDFLYMAYADIMAKSCH
DEEDDDGEEEVKSFEEKEMEKQKLLYQQARLHDRGAAEMVLQTISASKGE
TGPMVAATLKLGIAILNGGNSTVQQKMLDYLKEKKDVGFFQSLAGLMQSC
SVLDLNAFERQNKAEGLGMVTEEGSGEKVLQDDEFTCDLFRFLQLLCEGH
NSDFQNYLRTQTGNNTTVNIIISTVDYLLRVQESISDFYWYYSGKDVIDE
QGQRNFSKAIQVAKQVFNTLTEYIQGPCTGNQQSLAHSRLWDAVVGFLHV
FAHMQMKLSQDSSQIELLKELMDLQKDMVVMLLSMLEGNVVNGTIGKQMV
DMLVESSNNVEMILKFFDMFLKLKDLTSSDTFKEYDPDGKGVISKRDFHK
AMESHKHYTQSETEFLLSCAETDENETLDYEEFVKRFHEPAKDIGFNVAV
LLTNLSEHMPNDTRLQTFLELAESVLNYFQPFLGRIEIMGSAKRIERVYF
EISESSRTQWEKPQVKESKRQFIFDVVNEGGEKEKMELFVNFCEDTIFEM
QLAAQISESDLNERSANKEESEKERPEEQGPRMAFFSILTVRSALFALRY
NILTLMRMLSLKSLKKQMKKVKKMTVKDMVTAFFSSYWSIFMTLLHFVAS
VFRGFFRIICSLLLGGSLVEGAKKIKVAELLANMPDPTQDEVRGDGEEGE
RKPLEAALPSEDLTDLKELTEESDLLSDIFGLDLKREGGQYKLIPHNPNA
GLSDLMSNPVPMPEVQEKFQEQKAKEEEKEEKEETKSEPEKAEGEDGEKE
EKAKEDKGKQKLRQLHTHRYGEPEVPESAFWKKIIAYQQKLLNYFARNFY
NMRMLALFVAFAINFILLFYKVSTSSVVEGKELPTRSSSENAKVTSLDSS
SHRIIAVHYVLEESSGYMEPTLRILAILHTVISFFCIIGYYCLKVPLVIF
KREKEVARKLEFDGLYITEQPSEDDIKGQWDRLVINTQSFPNNYWDKFVK
RKVMDKYGEFYGRDRISELLGMDKAALDFSDAREKKKPKKDSSLSAVLNS
IDVKYQMWKLGVVFTDNSFLYLAWYMTMSVLGHYNNFFFAAHLLDIAMGF
KTLRTILSSVTHNGKQLVLTVGLLAVVVYLYTVVAFNFFRKFYNKSEDGD
TPDMKCDDMLTCYMFHMYVGVRAGGGIGDEIEDPAGDEYEIYRIIFDITF
FFFVIVILLAIIQGLIIDAFGELRDQQEQVKEDMETKCFICGIGNDYFDT
VPHGFETHTLQEHNLANYLFFLMYLINKDETEHTGQESYVWKMYQERCWE
FFPAGDCFRKQYEDQLN

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, саркоплазматичному ретикулумі.

Література

  • Awad S.S., Lamb H.K., Morgan J.M., Dunlop W., Gillespie J.I. (1997). Differential expression of ryanodine receptor RyR2 mRNA in the non-pregnant and pregnant human myometrium. Biochem. J. 322: 777—783. PMID 9148749 DOI:10.1042/bj3220777
  • Martin C., Chapman K.E., Seckl J.R., Ashley R.H. (1998). Partial cloning and differential expression of ryanodine receptor/calcium-release channel genes in human tissues including the hippocampus and cerebellum. Neuroscience. 85: 205—216. PMID 9607712 DOI:10.1016/S0306-4522(97)00612-X
  • Bers D.M. (2002). Cardiac excitation-contraction coupling. Nature. 415: 198—205. PMID 11805843 DOI:10.1038/415198a
  • Currie S. (2009). Cardiac ryanodine receptor phosphorylation by CaM Kinase II: keeping the balance right. Front. Biosci. 14: 5134—5156. PMID 19482609 DOI:10.2741/3591
  • Ozawa T. (2010). Modulation of ryanodine receptor Ca2+ channels. Mol. Med. Report. 3: 199—204. PMID 21472222 DOI:10.3892/mmr_00000240
  • Lanner J.T., Georgiou D.K., Joshi A.D., Hamilton S.L. (2010). Ryanodine receptors: structure, expression, molecular details, and function in calcium release. Cold Spring Harb. Perspect. Biol. 2: E3996—E3996. PMID 20961976 DOI:10.1101/cshperspect.a003996

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з RYR2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Ryanodine receptor 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10484 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
  6. UniProt, Q92736 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
 
Ліганд-залежні
Потенціалкеровані
  • L-тип/Cavα
  • N-тип/Cavα2.2
  • P-тип/Cavα
  • Q-тип/Cavα2.1
  • R-тип/Cavα2.3
  • T-тип/Cavα
 
постійно відчинені
Протончутливі
  • Кислота
Потенціалкеровані
 
K+: Калієві канали
Кальцій-активовані
Вхідного випрямлення
Двопородоменні
Потенціалкеровані
 
Різні
Cl: Хлорні канали
H+: Протонні канали
M+: CNG-канали
M+: TRP-канали
H2O (+ розчини): Порини
Цитоплазма: Щілинні контакти
 
За механізмом залежності
Ion channel class