La saison 2006 du Championnat du Soudan de football est la quarante-deuxième édition de la première division au Soudan, la Sudan Premier League. Elle regroupe, sous forme d'une poule unique, les douze meilleures équipes du pays qui se rencontrent deux fois, à domicile et à l'extérieur. En fin de saison, les deux derniers du classement sont relégués et remplacés par les deux meilleurs clubs de deuxième division.
C'est le club d'Al Hilal Omdurman, triple tenant du titre, qui remporte à nouveau le championnat cette saison après avoir terminé en tête du classement final, avec sept points d'avance sur Al Merreikh Omdurman et vingt-quatre sur Al Jazeerat Al-Feel. C'est le 19e titre de champion du Soudan de l'histoire du club, qui manque le doublé en s'inclinant face à son dauphin en finale de la Coupe du Soudan.