KIR3DL1 |
---|
|
Доступные структуры |
---|
PDB | Поиск ортологов: PDBe RCSB |
---|
Список идентификаторов PDB |
---|
3VH8, 3WUW, 5B38, 5B39 |
|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | KIR3DL1, CD158E1, KIR, KIR3DL1/S1, NKAT-3, NKAT3, NKB1, NKB1B, KIR3DL2, killer cell immunoglobulin like receptor, three Ig domains and long cytoplasmic tail 1, KIR2DL5B |
---|
Внешние ID | OMIM: 604946 MGI: 3612791 HomoloGene: 135918 GeneCards: KIR3DL1 |
---|
|
Расположение гена (Мышь) |
---|
![X-хромосома мыши](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/59/Ideogram_house_mouse_chromosome_X.svg/260px-Ideogram_house_mouse_chromosome_X.svg.png) | Хр. | X-хромосома мыши[2] |
---|
| Локус | X F1|X 58.45 cM | Начало | 135,348,856 bp[2] |
---|
Конец | 135,444,805 bp[2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
Наибольшая экспрессия в | - upper lobe of left lung
- olfactory zone of nasal mucosa
|
| | Дополнительные справочные данные |
|
---|
BioGPS | ![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/3e/PBB_GE_KIR3DL1_211389_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_KIR3DL1_211389_x_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/39/PBB_GE_KIR3DL1_211687_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_KIR3DL1_211687_x_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/35/PBB_GE_KIR3DL1_207313_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_KIR3DL1_207313_x_at_fs.png) | Дополнительные справочные данные |
|
---|
|
Генная онтология |
---|
Молекулярная функция | - HLA-B specific inhibitory MHC class I receptor activity
- amyloid-beta binding
- связывание с белками плазмы
| Компонент клетки | - часть мембраны
- клеточная мембрана
- часть клеточной мембраны
- мембрана
| Биологический процесс | - иммунный ответ
- natural killer cell mediated cytotoxicity
- regulation of immune response
- передача сигнала
| Источники: Amigo, QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | ENSG00000284589 ENSG00000274146 ENSG00000278368 ENSG00000273775 ENSG00000276501
|
---|
ENSG00000278427 ENSG00000274948 ENSG00000274036 ENSG00000274920 ENSG00000275786 ENSG00000276329 ENSG00000277272 ENSG00000283954 ENSG00000275486 ENSG00000275545 ENSG00000278079 ENSG00000273518 ENSG00000275717 ENSG00000277175 ENSG00000167633 ENSG00000283729 ENSG00000283731 ENSG00000276423 ENSG00000275659 ENSG00000278856 ENSG00000284426 ENSG00000275288 ENSG00000284093 ENSG00000283827 ENSG00000284177 ENSG00000276379 ENSG00000284342 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (белок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Chr 19: 54.82 – 54.83 Mb | Chr X: 135.35 – 135.44 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
KIR3DL1 (англ. Killer cell immunoglobulin-like receptor 3DL1; CD158e) — мембранный белок семейства иммуноглобулино-подобных рецепторов, представленных на естественных киллерах. Продукт гена человека KIR3DL1[5][6][7].
Функции
KIR3DL1 — мембранный гликопротеин из семейства иммуноглобулино-подобных рецепторов естественных киллеров KIR. Гены этого семейства — полиморфные и высокогомологичные, расположены у человека на участке 19-й хромосомы 19q13.4 в границах 1 Mb лейкоцитарного рецепторного комплекса LRC. Белки KIR кклассифицируются по числу внеклеточных иммуноглобулиновых доменов (2D или 3D) и по длинному (L) либо короткому (S) цитоплазматическому участку. Белки с длинным цитоплазматическим доменом передают ингибирующий сигнал после связывания с лигандом, что опосредовано ингибирующим ITIM-мотивом рецептора, тагда как рецепторы с коротким цитоплазматическим доменом не содержат ITIM-мотив и ассоциированы с белком, связывающим протеинтирозинкиназу TYRO, который переносит активирующий сигнал. Лиганды нескольких рецепторов KIR — тяжёлые цепи HLA из некоторых подтипов главного комплекса гистосовместимости класса I МНС-I. Таким образом рецепторы этого семейства играют важную роль в регуляции иммунного ответа[7].
KIR3DL1 является рецептором аллели человеческого лейкоцитарного антигена HLA Bw4 главного комплекса гистосовместимости класса МНС-I. При стимуляции рецептор ингибирует активность естественных киллеров и предотвращает лизис клеток-мишеней[8].
Структура
KIR3DL1 включает 444 аминокислоты, молекулярная масса — 49,1 кДа (каноническая изоформа). Описано по крайней мере 2 изоформы гликопротеина, образующихся в результате альтернативного сплайсинга. Изоформа 2 значительно короче канонической, состоит из 349 аминокислот (молекулярная масса 38,4 кДа).
Примечания
- ↑ 1 2 3 ENSG00000274146, ENSG00000278368, ENSG00000273775, ENSG00000276501, ENSG00000278427, ENSG00000274948, ENSG00000274036, ENSG00000274920, ENSG00000275786, ENSG00000276329, ENSG00000277272, ENSG00000283954, ENSG00000275486, ENSG00000275545, ENSG00000278079, ENSG00000273518, ENSG00000275717, ENSG00000277175, ENSG00000167633, ENSG00000283729, ENSG00000283731, ENSG00000276423, ENSG00000275659, ENSG00000278856, ENSG00000284426, ENSG00000275288, ENSG00000284093, ENSG00000283827, ENSG00000284177, ENSG00000276379, ENSG00000284342 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000284589, ENSG00000274146, ENSG00000278368, ENSG00000273775, ENSG00000276501, ENSG00000278427, ENSG00000274948, ENSG00000274036, ENSG00000274920, ENSG00000275786, ENSG00000276329, ENSG00000277272, ENSG00000283954, ENSG00000275486, ENSG00000275545, ENSG00000278079, ENSG00000273518, ENSG00000275717, ENSG00000277175, ENSG00000167633, ENSG00000283729, ENSG00000283731, ENSG00000276423, ENSG00000275659, ENSG00000278856, ENSG00000284426, ENSG00000275288, ENSG00000284093, ENSG00000283827, ENSG00000284177, ENSG00000276379, ENSG00000284342 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000057439 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Colonna M, Samaridis J (May 1995). "Cloning of immunoglobulin-superfamily members associated with HLA-C and HLA-B recognition by human natural killer cells". Science. 268 (5209): 405—8. Bibcode:1995Sci...268..405C. doi:10.1126/science.7716543. PMID 7716543.
- ↑ Wagtmann N, Biassoni R, Cantoni C, Verdiani S, Malnati MS, Vitale M, Bottino C, Moretta L, Moretta A, Long EO (Jun 1995). "Molecular clones of the p58 NK cell receptor reveal immunoglobulin-related molecules with diversity in both the extra- and intracellular domains". Immunity. 2 (5): 439—49. doi:10.1016/1074-7613(95)90025-X. PMID 7749980.
- ↑ 1 2 Entrez Gene: KIR3DL1 killer cell immunoglobulin-like receptor, three domains, long cytoplasmic tail, 1 (неопр.).
- ↑ Vivian JP, Duncan RC, Berry R, O'Connor GM, Reid HH, Beddoe T; et al. (2011). "Killer cell immunoglobulin-like receptor 3DL1-mediated recognition of human leukocyte antigen B." Nature. 479 (7373): 401–5. doi:10.1038/nature10517. PMC 3723390. PMID 22020283.
{{cite journal}}
: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
Литература
- Selvakumar A, Steffens U, Dupont B (1997). "Polymorphism and domain variability of human killer cell inhibitory receptors". Immunol. Rev. 155 (1): 183—96. doi:10.1111/j.1600-065X.1997.tb00951.x. PMID 9059894. S2CID 7040904.
- D'Andrea A, Chang C, Franz-Bacon K, et al. (1995). "Molecular cloning of NKB1. A natural killer cell receptor for HLA-B allotypes". J. Immunol. 155 (5): 2306—10. PMID 7650366.
- Litwin V, Gumperz J, Parham P, et al. (1994). "NKB1: a natural killer cell receptor involved in the recognition of polymorphic HLA-B molecules". J. Exp. Med. 180 (2): 537—43. doi:10.1084/jem.180.2.537. PMC 2191610. PMID 8046332.
- Döhring C, Samaridis J, Colonna M (1996). "Alternatively spliced forms of human killer inhibitory receptors". Immunogenetics. 44 (3): 227—30. doi:10.1007/BF02602590. PMID 8662091. S2CID 38478576.
- Pende D, Biassoni R, Cantoni C, et al. (1996). "The natural killer cell receptor specific for HLA-A allotypes: a novel member of the p58/p70 family of inhibitory receptors that is characterized by three immunoglobulin-like domains and is expressed as a 140-kD disulphide-linked dimer". J. Exp. Med. 184 (2): 505—18. doi:10.1084/jem.184.2.505. PMC 2192700. PMID 8760804.
- Wagtmann N, Rajagopalan S, Winter CC, et al. (1996). "Killer cell inhibitory receptors specific for HLA-C and HLA-B identified by direct binding and by functional transfer". Immunity. 3 (6): 801—9. doi:10.1016/1074-7613(95)90069-1. PMID 8777725.
- Valiante NM, Uhrberg M, Shilling HG, et al. (1998). "Functionally and structurally distinct NK cell receptor repertoires in the peripheral blood of two human donors". Immunity. 7 (6): 739—51. doi:10.1016/S1074-7613(00)80393-3. PMID 9430220.
- Uhrberg M, Valiante NM, Shum BP, et al. (1998). "Human diversity in killer cell inhibitory receptor genes". Immunity. 7 (6): 753—63. doi:10.1016/S1074-7613(00)80394-5. PMID 9430221.
- Vyas Y, Selvakumar A, Steffens U, Dupont B (1999). "Multiple transcripts of the killer cell immunoglobulin-like receptor family, KIR3DL1 (NKB1), are expressed by natural killer cells of a single individual". Tissue Antigens. 52 (6): 510—9. doi:10.1111/j.1399-0039.1998.tb03081.x. PMID 9894849.
- Kwon D, Chwae YJ, Choi IH, et al. (2000). "Diversity of the p70 killer cell inhibitory receptor (KIR3DL) family members in a single individual". Mol. Cells. 10 (1): 54—60. doi:10.1007/s10059-000-0054-0. PMID 10774747. S2CID 21075797.
- Crum KA, Logue SE, Curran MD, Middleton D (2001). "Development of a PCR-SSOP approach capable of defining the natural killer cell inhibitory receptor (KIR) gene sequence repertoires". Tissue Antigens. 56 (4): 313—26. doi:10.1034/j.1399-0039.2000.560403.x. PMID 11098931.
- Gardiner CM, Guethlein LA, Shilling HG, et al. (2001). "Different NK cell surface phenotypes defined by the DX9 antibody are due to KIR3DL1 gene polymorphism". J. Immunol. 166 (5): 2992—3001. doi:10.4049/jimmunol.166.5.2992. PMID 11207248.
- Yamochi T, Semba K, Tsuji K, et al. (2002). "ik3-1/Cables is a substrate for cyclin-dependent kinase 3 (cdk 3)". Eur. J. Biochem. 268 (23): 6076—82. doi:10.1046/j.0014-2956.2001.02555.x. PMID 11733001.
- Shilling HG, Guethlein LA, Cheng NW, et al. (2002). "Allelic polymorphism synergizes with variable gene content to individualize human KIR genotype". J. Immunol. 168 (5): 2307—15. doi:10.4049/jimmunol.168.5.2307. PMID 11859120.
- Martin MP, Gao X, Lee JH, et al. (2002). "Epistatic interaction between KIR3DS1 and HLA-B delays the progression to AIDS". Nat. Genet. 31 (4): 429—34. doi:10.1038/ng934. PMID 12134147. S2CID 6805903.
- Chwae YJ, Chang MJ, Park SM, et al. (2002). "Molecular mechanism of the activation-induced cell death inhibition mediated by a p70 inhibitory killer cell Ig-like receptor in Jurkat T cells". J. Immunol. 169 (7): 3726—35. doi:10.4049/jimmunol.169.7.3726. PMID 12244166.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899—903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
![Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c9/Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg/14px-Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg.png) |
---|
1-50 | - CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E)
- CD2
- CD3 (γ, δ, ε)
- CD4
- CD5
- CD6
- CD7
- CD8 (a)
- CD9
- CD10
- CD11 (a, b, c, d)
- CD13
- CD14
- CD15
- CD16 (A, B)
- CD18
- CD19
- CD20
- CD21
- CD22
- CD23
- CD24
- CD25
- CD26
- CD27
- CD28
- CD29
- CD30
- CD31
- CD32 (A, B)
- CD33
- CD34
- CD35
- CD36
- CD37
- CD38
- CD39
- CD40
- CD41
- CD42 (a, b, c, d)
- CD43
- CD44
- CD45
- CD46
- CD47
- CD48
- CD49 (a, b, c, d, e, f)
- CD50
|
---|
51-100 | - CD51
- CD52
- CD53
- CD54
- CD55
- CD56
- CD57
- CD58
- CD59
- CD61
- CD62 (E, L, P)
- CD63
- CD64 (A, B, C)
- CD66 (a, b, c, d, e, f)
- CD68
- CD69
- CD70
- CD71
- CD72
- CD73
- CD74
- CD78
- CD79 (a, b)
- CD80
- CD81
- CD82
- CD83
- CD84
- CD85 (a, d, e, h, j, k)
- CD86
- CD87
- CD88
- CD89
- CD90
- CD91
- CD92
- CD93
- CD94
- CD95
- CD96
- CD97
- CD98
- CD99
- CD100
|
---|
101-150 | |
---|
151-200 | - CD151
- CD152
- CD153
- CD154
- CD155
- CD156 (a, b, c)
- CD157
- CD158 (a, d, e, i, k)
- CD159 (a, c)
- CD160
- CD161
- CD162
- CD163
- CD164
- CD166
- CD167 (a, b)
- CD168
- CD169
- CD170
- CD171
- CD172 (a, b, g)
- CD174
- CD177
- CD178
- CD179 (a, b)
- CD181
- CD182
- CD183
- CD184
- CD185
- CD186
- CD191
- CD192
- CD193
- CD194
- CD195
- CD196
- CD197
- CDw198
- CDw199
- CD200
|
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|
351-400 | |
---|