PANGOLIN
- 4.3.1 (2023年7月26日)[1]
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PANGOLIN(Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages,中文又翻譯為彭高命名系統)是一个由Rambaut Lab成员开发的软件工具,與其相关的网络应用由位於英國南劍橋郡的基因组病原体监测中心(英语:Centre for Genomic Pathogen Surveillance)开发[2]。該工具可以被用來對严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2的基因譜系(英语:Lineage (genetic))進行动态命名(PANGO命名法)[3]。
據此命名系統的發起人之一Andrew Rambaut所說,SARS-CoV-2有數以萬計的基因體,該基因體數量可是前所未見的,由於截至2020年7月還沒有共識去為SARS-CoV-2種系命名,因此就訂出這個Pango Lineage系統來為基因體譜系命名。
参考文献
- ^ Release 4.3.1. 2023年7月26日 [2023年8月1日].
- ^ Real-Time Epidemiology for COVID-19. www.pathogensurveillance.net. [22 January 2021]. (原始内容存档于2021-01-17).
- ^ Rambaut, A.; Holmes, E.C.; O’Toole, Á.; et al. A dynamic nomenclature proposal for SARS-CoV-2 lineages to assist genomic epidemiology. Nature Microbiology(英语:Nature Microbiology). 2020, 5 (11): 1403–1407 [2021-05-15]. PMID 32669681. doi:10.1038/s41564-020-0770-5. (原始内容存档于2020-12-24).