ZFYVE9 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук для людей: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1DEV, 1MK2, 4BKW | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ZFYVE9, MADHIP, NSP, PPP1R173, SARA, SMADIP, zinc finger FYVE-type containing 9 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603755 MGI: 2652838 HomoloGene: 3527 GeneCards: ZFYVE9 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • 1-phosphatidylinositol binding • serine-type peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • protein domain specific binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • ендосома • early endosome • early endosome membrane • мембрана • гіалоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • ендоцитоз • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • протеоліз • endosomal transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_004799 NM_007323 NM_007324 |
| | NM_183300 NM_001347163 NM_001384118 |
|
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 52.14 – 52.35 Mb | Хр. 4: 108.49 – 108.64 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ZFYVE9 (англ. Zinc finger FYVE-type containing 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 425 амінокислот, а молекулярна маса — 156 403[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MENYFQAEAY | | NLDKVLDEFE | | QNEDETVSST | | LLDTKWNKIL | | DPPSHRLSFN |
PTLASVNESA | | VSNESQPQLK | | VFSLAHSAPL | | TTEEEDHCAN | | GQDCNLNPEI |
ATMWIDENAV | | AEDQLIKRNY | | SWDDQCSAVE | | VGEKKCGNLA | | CLPDEKNVLV |
VAVMHNCDKR | | TLQNDLQDCN | | NYNSQSLMDA | | FSCSLDNENR | | QTDQFSFSIN |
ESTEKDMNSE | | KQMDPLNRPK | | TEGRSVNHLC | | PTSSDSLASV | | CSPSQLKDDG |
SIGRDPSMSA | | ITSLTVDSVI | | SSQGTDGCPA | | VKKQENYIPD | | EDLTGKISSP |
RTDLGSPNSF | | SHMSEGILMK | | KEPAEESTTE | | ESLRSGLPLL | | LKPDMPNGSG |
RNNDCERCSD | | CLVPNEVRAD | | ENEGYEHEET | | LGTTEFLNMT | | EHFSESQDMT |
NWKLTKLNEM | | NDSQVNEEKE | | KFLQISQPED | | TNGDSGGQCV | | GLADAGLDLK |
GTCISESEEC | | DFSTVIDTPA | | ANYLSNGCDS | | YGMQDPGVSF | | VPKTLPSKED |
SVTEEKEIEE | | SKSECYSNIY | | EQRGNEATEG | | SGLLLNSTGD | | LMKKNYLHNF |
CSQVPSVLGQ | | SSPKVVASLP | | SISVPFGGAR | | PKQPSNLKLQ | | IPKPLSDHLQ |
NDFPANSGNN | | TKNKNDILGK | | AKLGENSATN | | VCSPSLGNIS | | NVDTNGEHLE |
SYEAEISTRP | | CLALAPDSPD | | NDLRAGQFGI | | SARKPFTTLG | | EVAPVWVPDS |
QAPNCMKCEA | | RFTFTKRRHH | | CRACGKVFCA | | SCCSLKCKLL | | YMDRKEARVC |
VICHSVLMNA | | QAWENMMSAS | | SQSPNPNNPA | | EYCSTIPPLQ | | QAQASGALSS |
PPPTVMVPVG | | VLKHPGAEVA | | QPREQRRVWF | | ADGILPNGEV | | ADAAKLTMNG |
TSSAGTLAVS | | HDPVKPVTTS | | PLPAETDICL | | FSGSITQVGS | | PVGSAMNLIP |
EDGLPPILIS | | TGVKGDYAVE | | EKPSQISVMQ | | QLEDGGPDPL | | VFVLNANLLS |
MVKIVNYVNR | | KCWCFTTKGM | | HAVGQSEIVI | | LLQCLPDEKC | | LPKDIFNHFV |
QLYRDALAGN | | VVSNLGHSFF | | SQSFLGSKEH | | GGFLYVTSTY | | QSLQDLVLPT |
PPYLFGILIQ | | KWETPWAKVF | | PIRLMLRLGA | | EYRLYPCPLF | | SVRFRKPLFG |
ETGHTIMNLL | | ADFRNYQYTL | | PVVQGLVVDM | | EVRKTSIKIP | | SNRYNEMMKA |
MNKSNEHVLA | | GGACFNEKAD | | SHLVCVQNDD | | GNYQTQAISI | | HNQPRKVTGA |
SFFVFSGALK | | SSSGYLAKSS | | IVEDGVMVQI | | TAENMDSLRQ | | ALREMKDFTI |
TCGKADAEEP | | QEHIHIQWVD | | DDKNVSKGVV | | SPIDGKSMET | | ITNVKIFHGS |
EYKANGKVIR | | WTEVFFLEND | | DQHNCLSDPA | | DHSRLTEHVA | | KAFCLALCPH |
LKLLKEDGMT | | KLGLRVTLDS | | DQVGYQAGSN | | GQPLPSQYMN | | DLDSALVPVI |
HGGACQLSEG | | PVVMELIFYI | | LENIV |
Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендосомах.
Література
- Tsukazaki T., Chiang T.A., Davison A.F., Attisano L., Wrana J.L. (1998). SARA, a FYVE domain protein that recruits Smad2 to the TGFbeta receptor. Cell. 95: 779—791. PMID 9865696 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81701-8
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
- Lin H.K., Bergmann S., Pandolfi P.P. (2004). Cytoplasmic PML function in TGF-beta signalling. Nature. 431: 205—211. PMID 15356634 DOI:10.1038/nature02783
- Qin B.Y., Lam S.S., Correia J.J., Lin K. (2002). Smad3 allostery links TGF-beta receptor kinase activation to transcriptional control. Genes Dev. 16: 1950—1963. PMID 12154125 DOI:10.1101/gad.1002002
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6775 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O95405 (англ.) . Архів оригіналу за 30 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |