ZC3HAV1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2X5Y, 4X52

Ідентифікатори

Символи

ZC3HAV1, ARTD13, FLB6421, PARP13, ZAP, ZC3H2, ZC3HDC2, zinc finger CCCH-type containing, antiviral 1

Зовнішні ІД

OMIM: 607312 MGI: 1926031 HomoloGene: 10585 GeneCards: ZC3HAV1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • cadherin binding • NAD+ ADP-ribosyltransferase activity • NAD+ binding • protein ADP-ribosylase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма
Біологічний процес	• positive regulation of interferon-alpha production • процес імунної системи • response to virus • positive regulation of mRNA catabolic process • negative regulation of viral genome replication • positive regulation of RIG-I signaling pathway • defense response to virus • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • вроджений імунітет • positive regulation of interferon-beta production • protein poly-ADP-ribosylation • protein ADP-ribosylation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


56829


78781

Ensembl


ENSG00000105939


ENSMUSG00000029826

UniProt


Q7Z2W4


Q3UPF5

RefSeq (мРНК)


NM_020119 NM_024625 NM_001363491


NM_028421 NM_028864 NM_001347122

RefSeq (білок)


NP_064504 NP_078901 NP_001350420


NP_001334051 NP_082697 NP_083140

Локус (UCSC)

Хр. 7: 139.04 – 139.13 Mb

Хр. 6: 38.28 – 38.33 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ZC3HAV1 (англ. Zinc finger CCCH-type containing, antiviral 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 902 амінокислот, а молекулярна маса — 101 431^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADPEVCCFI	TKILCAHGGR	MALDALLQEI	ALSEPQLCEV	LQVAGPDRFV
VLETGGEAGI	TRSVVATTRA	RVCRRKYCQR	PCDNLHLCKL	NLLGRCNYSQ
SERNLCKYSH	EVLSEENFKV	LKNHELSGLN	KEELAVLLLQ	SDPFFMPEIC
KSYKGEGRQQ	ICNQQPPCSR	LHICDHFTRG	NCRFPNCLRS	HNLMDRKVLA
IMREHGLNPD	VVQNIQDICN	SKHMQKNPPG	PRAPSSHRRN	MAYRARSKSR
DRFFQGSQEF	LASASASAER	SCTPSPDQIS	HRASLEDAPV	DDLTRKFTYL
GSQDRARPPS	GSSKATDLGG	TSQAGTSQRF	LENGSQEDLL	HGNPGSTYLA
SNSTSAPNWK	SLTSWTNDQG	ARRKTVFSPT	LPAARSSLGS	LQTPEAVTTR
KGTGLLSSDY	RIINGKSGTQ	DIQPGPLFNN	NADGVATDIT	STRSLNYKST
SSGHREISSP	RIQDAGPASR	DVQATGRIAD	DADPRVALVN	DSLSDVTSTT
SSRVDDHDSE	EICLDHLCKG	CPLNGSCSKV	HFHLPYRWQM	LIGKTWTDFE
HMETIEKGYC	NPGIHLCSVG	SYTINFRVMS	CDSFPIRRLS	TPSSVTKPAN
SVFTTKWIWY	WKNESGTWIQ	YGEEKDKRKN	SNVDSSYLES	LYQSCPRGVV
PFQAGSRNYE	LSFQGMIQTN	IASKTQKDVI	RRPTFVPQWY	VQQMKRGPDH
QPAKTSSVSL	TATFRPQEDF	CFLSSKKYKL	SEIHHLHPEY	VRVSEHFKAS
MKNFKIEKIK	KIENSELLDK	FTWKKSQMKE	EGKLLFYATS	RAYVESICSN
NFDSFLHETH	ENKYGKGIYF	AKDAIYSHKN	CPYDAKNVVM	FVAQVLVGKF
TEGNITYTSP	PPQFDSCVDT	RSNPSVFVIF	QKDQVYPQYV	IEYTEDKACV
IS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, противірусний захист, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Kerns J.A., Emerman M., Malik H.S. (2008). Positive selection and increased antiviral activity associated with the PARP-containing isoform of human zinc-finger antiviral protein. PLoS Genet. 4: E21—E21. PMID 18225958 DOI:10.1371/journal.pgen.0040021
Zhu Y., Gao G. (2008). ZAP-mediated mRNA degradation. RNA Biol. 5: 65—67. PMID 18418085 DOI:10.4161/rna.5.2.6044
Jeong M.S., Kim E.J., Jang S.B. (2010). Expression and RNA-binding of human zinc-finger antiviral protein. Biochem. Biophys. Res. Commun. 396: 696—702. PMID 20451500 DOI:10.1016/j.bbrc.2010.04.164
Ye P., Liu S., Zhu Y., Chen G., Gao G. (2010). DEXH-Box protein DHX30 is required for optimal function of the zinc-finger antiviral protein. Protein Cell. 1: 956—964. PMID 21204022 DOI:10.1007/s13238-010-0117-8

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23721 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q7Z2W4 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.