YTHDC1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2YUD, 4R3H, 4R3I | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | YTHDC1, YT521, YT521-B, YTH domain containing 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 617283 MGI: 2443713 HomoloGene: 15796 GeneCards: YTHDC1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • N6-methyladenosine-containing RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • nuclear speck • клітинна мембрана • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • mRNA processing • mRNA splice site selection • Сплайсинг РНК • regulation of mRNA splicing, via spliceosome • mRNA export from nucleus • dosage compensation by inactivation of X chromosome • posttranscriptional regulation of gene expression |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | ENSG00000275272 ENSG00000083896 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001031732 NM_133370 NM_001330698 |
| | NM_177680 NM_001347375 NM_001347376 NM_001359907 NM_001359908 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001026902 NP_001317627 NP_588611 |
| | NP_001334304 NP_001334305 NP_808348 NP_001346836 NP_001346837 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 4: 68.31 – 68.35 Mb | Хр. 5: 86.95 – 86.98 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
YTHDC1 (англ. YTH domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 727 амінокислот, а молекулярна маса — 84 700[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAADSREEKD | | GELNVLDDIL | | TEVPEQDDEL | | YNPESEQDKN | | EKKGSKRKSD |
RMESTDTKRQ | | KPSVHSRQLV | | SKPLSSSVSN | | NKRIVSTKGK | | SATEYKNEEY |
QRSERNKRLD | | ADRKIRLSSS | | ASREPYKNQP | | EKTCVRKRDP | | ERRAKSPTPD |
GSERIGLEVD | | RRASRSSQSS | | KEEVNSEEYG | | SDHETGSSGS | | SDEQGNNTEN |
EEEGVEEDVE | | EDEEVEEDAE | | EDEEVDEDGE | | EEEEEEEEEE | | EEEEEEEEEY |
EQDERDQKEE | | GNDYDTRSEA | | SDSGSESVSF | | TDGSVRSGSG | | TDGSDEKKKE |
RKRARGISPI | | VFDRSGSSAS | | ESYAGSEKKH | | EKLSSSVRAV | | RKDQTSKLKY |
VLQDARFFLI | | KSNNHENVSL | | AKAKGVWSTL | | PVNEKKLNLA | | FRSARSVILI |
FSVRESGKFQ | | GFARLSSESH | | HGGSPIHWVL | | PAGMSAKMLG | | GVFKIDWICR |
RELPFTKSAH | | LTNPWNEHKP | | VKIGRDGQEI | | ELECGTQLCL | | LFPPDESIDL |
YQVIHKMRHK | | RRMHSQPRSR | | GRPSRREPVR | | DVGRRRPEDY | | DIHNSRKKPR |
IDYPPEFHQR | | PGYLKDPRYQ | | EVDRRFSGVR | | RDVFLNGSYN | | DYVREFHNMG |
PPPPWQGMPP | | YPGMEQPPHH | | PYYQHHAPPP | | QAHPPYSGHH | | PVPHEARYRD |
KRVHDYDMRV | | DDFLRRTQAV | | VSGRRSRPRE | | RDRERERDRP | | RDNRRDRERD |
RGRDRERERE | | RLCDRDRDRG | | ERGRYRR |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXII. The complete sequences of 50 new cDNA clones which code for large proteins. DNA Res. 8: 319—327. PMID 11853319 DOI:10.1093/dnares/8.6.319
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30626 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q96MU7 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |