WDR1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | WDR1, AIP1, HEL-S-52, NORI-1, WD repeat domain 1, PFITS |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604734 MGI: 1337100 HomoloGene: 6628 GeneCards: WDR1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • actin binding • actin filament binding |
---|
Клітинна компонента | • extracellular region • myelin sheath • podosome • міжклітинні контакти • cell projection • екзосома • цитоскелет • мікрофіламент • cell-cell junction • цитоплазма • гіалоплазма • cortical actin cytoskeleton • клітинна мембрана |
---|
Біологічний процес | • platelet degranulation • слух • actin cytoskeleton organization • regulation of ventricular cardiac muscle cell membrane repolarization • regulation of oligodendrocyte differentiation • maintenance of epithelial cell apical/basal polarity • apical junction assembly • regulation of actin filament depolymerization • neutrophil mediated immunity • regulation of cell shape • actin filament fragmentation • Тромбоцитопоез • positive regulation of actin filament depolymerization • cortical cytoskeleton organization • locomotion • establishment of planar polarity of follicular epithelium • sarcomere organization • neutrophil migration • actin filament depolymerization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 4: 10.07 – 10.12 Mb | Хр. 5: 38.68 – 38.72 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
WDR1 (англ. WD repeat domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 606 амінокислот, а молекулярна маса — 66 194[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPYEIKKVFA | | SLPQVERGVS | | KIIGGDPKGN | | NFLYTNGKCV | | ILRNIDNPAL |
ADIYTEHAHQ | | VVVAKYAPSG | | FYIASGDVSG | | KLRIWDTTQK | | EHLLKYEYQP |
FAGKIKDIAW | | TEDSKRIAVV | | GEGREKFGAV | | FLWDSGSSVG | | EITGHNKVIN |
SVDIKQSRPY | | RLATGSDDNC | | AAFFEGPPFK | | FKFTIGDHSR | | FVNCVRFSPD |
GNRFATASAD | | GQIYIYDGKT | | GEKVCALGGS | | KAHDGGIYAI | | SWSPDSTHLL |
SASGDKTSKI | | WDVSVNSVVS | | TFPMGSTVLD | | QQLGCLWQKD | | HLLSVSLSGY |
INYLDRNNPS | | KPLHVIKGHS | | KSIQCLTVHK | | NGGKSYIYSG | | SHDGHINYWD |
SETGENDSFA | | GKGHTNQVSR | | MTVDESGQLI | | SCSMDDTVRY | | TSLMLRDYSG |
QGVVKLDVQP | | KCVAVGPGGY | | AVVVCIGQIV | | LLKDQRKCFS | | IDNPGYEPEV |
VAVHPGGDTV | | AIGGVDGNVR | | LYSILGTTLK | | DEGKLLEAKG | | PVTDVAYSHD |
GAFLAVCDAS | | KVVTVFSVAD | | GYSENNVFYG | | HHAKIVCLAW | | SPDNEHFASG |
GMDMMVYVWT | | LSDPETRVKI | | QDAHRLHHVS | | SLAWLDEHTL | | VTTSHDASVK |
EWTITY |
Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах, клітинних відростках.
Література
- Adler H.J., Winnicki R.S., Gong T.-W.L., Lomax M.I. (1999). A gene upregulated in the acoustically damaged chick basilar papilla encodes a novel WD40 repeat protein. Genomics. 56: 59—69. PMID 10036186 DOI:10.1006/geno.1998.5672
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Cervero P., Himmel M., Kruger M., Linder S. (2012). Proteomic analysis of podosome fractions from macrophages reveals similarities to spreading initiation centres. Eur. J. Cell Biol. 91: 908—922. PMID 22721921 DOI:10.1016/j.ejcb.2012.05.005
- Lechuga S., Baranwal S., Ivanov A.I. (2015). Actin-interacting protein 1 controls assembly and permeability of intestinal epithelial apical junctions. Am. J. Physiol. 308: G745—G756. PMID 25792565 DOI:10.1152/ajpgi.00446.2014
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12754 (англ.) . Архів оригіналу за 15 червня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
- ↑ UniProt, O75083 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |