TRIP6 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1X61, 2DLO | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRIP6, OIP-1, OIP1, TRIP-6, TRIP6i2, ZRP-1, thyroid hormone receptor interactor 6 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602933 MGI: 1343458 HomoloGene: 37757 GeneCards: TRIP6 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • kinase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • interleukin-1 receptor binding • зв'язування з іоном металу • thyroid hormone receptor binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • interleukin-1 receptor complex • цитоскелет • клітинне ядро • focal adhesion • цитоплазма • гіалоплазма • stress fiber |
---|
Біологічний процес | • focal adhesion assembly • адгезія клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • positive regulation of cell migration • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling • GO:0072468 сигнальна трансдукція |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 7: 100.87 – 100.87 Mb | Хр. 5: 137.31 – 137.31 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRIP6 (англ. Thyroid hormone receptor interactor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 476 амінокислот, а молекулярна маса — 50 288[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSGPTWLPPK | | QPEPARAPQG | | RAIPRGTPGP | | PPAHGAALQP | | HPRVNFCPLP |
SEQCYQAPGG | | PEDRGPAWVG | | SHGVLQHTQG | | LPADRGGLRP | | GSLDAEIDLL |
SSTLAELNGG | | RGHASRRPDR | | QAYEPPPPPA | | YRTGSLKPNP | | ASPLPASPYG |
GPTPASYTTA | | STPAGPAFPV | | QVKVAQPVRG | | CGPPRRGASQ | | ASGPLPGPHF |
PLPGRGEVWG | | PGYRSQREPG | | PGAKEEAAGV | | SGPAGRGRGG | | EHGPQVPLSQ |
PPEDELDRLT | | KKLVHDMNHP | | PSGEYFGQCG | | GCGEDVVGDG | | AGVVALDRVF |
HVGCFVCSTC | | RAQLRGQHFY | | AVERRAYCEG | | CYVATLEKCA | | TCSQPILDRI |
LRAMGKAYHP | | GCFTCVVCHR | | GLDGIPFTVD | | ATSQIHCIED | | FHRKFAPRCS |
VCGGAIMPEP | | GQEETVRIVA | | LDRSFHIGCY | | KCEECGLLLS | | SEGECQGCYP |
LDGHILCKAC | | SAWRIQELSA | | TVTTDC |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, клітинних контактах.
Література
- Yi J., Beckerle M.C. (1998). The human TRIP6 gene encodes a LIM domain protein and maps to chromosome 7q22, a region associated with tumorigenesis. Genomics. 49: 314—316. PMID 9598321 DOI:10.1006/geno.1998.5248
- Murthy K.K., Clark K., Fortin Y., Shen S.-H., Banville D. (1999). ZRP-1, a zyxin-related protein, interacts with the second PDZ domain of the cytosolic protein tyrosine phosphatase hPTP1E. J. Biol. Chem. 274: 20679—20687. PMID 10400701 DOI:10.1074/jbc.274.29.20679
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Lee J.W., Choi H.-S., Gyuris J., Brent R., Moore D.D. (1995). Two classes of proteins dependent on either the presence or absence of thyroid hormone for interaction with the thyroid hormone receptor. Mol. Endocrinol. 9: 243—254. PMID 7776974 DOI:10.1210/mend.9.2.7776974
- Xu J., Lai Y.-J., Lin W.-C., Lin F.-T. (2004). TRIP6 enhances lysophosphatidic acid-induced cell migration by interacting with the lysophosphatidic acid 2 receptor. J. Biol. Chem. 279: 10459—10468. PMID 14688263 DOI:10.1074/jbc.M311891200
- Petit M.M.R., Crombez K.R.M.O., Vervenne H.B.V.K., Weyns N., Van de Ven W.J.M. (2005). The tumor suppressor Scrib selectively interacts with specific members of the zyxin family of proteins. FEBS Lett. 579: 5061—5068. PMID 16137684 DOI:10.1016/j.febslet.2005.08.012
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12311 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q15654 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |