TRAK2

Ідентифікатори

Символи

TRAK2, ALS2CR3, CALS-C, GRIF-1, GRIF1, MILT2, OIP98, trafficking kinesin protein 2

Зовнішні ІД

OMIM: 607334 MGI: 1918077 HomoloGene: 22861 GeneCards: TRAK2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• signaling receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GABA receptor binding • kinesin binding • TPR domain binding • enzyme binding • myosin binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • ендосома • клітинна мембрана • early endosome • мітохондрія • клітинне ядро • dendrite cytoplasm • дендрит (нейробіологія) • neuron projection • neuronal cell body • axonal growth cone • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • axon cytoplasm
Біологічний процес	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • сортування білків • protein O-linked glycosylation • anterograde dendritic transport of mitochondrion • endosome to lysosome transport • dendrite morphogenesis • negative regulation of axonogenesis • dendritic transport of mitochondrion • anterograde axonal transport • GO:0034613 protein localization • Нейрогенез • vesicle transport along microtubule • mitochondrion distribution • anterograde axonal transport of mitochondrion
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


66008


70827

Ensembl


ENSG00000115993


ENSMUSG00000026028

UniProt


O60296


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_015049


NM_172406

RefSeq (білок)


NP_055864


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 2: 201.38 – 201.45 Mb

Хр. 1: 58.9 – 58.97 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRAK2 (англ. Trafficking kinesin protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 914 амінокислот, а молекулярна маса — 101 419^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSQSQNAIFT	SPTGEENLMN	SNHRDSESIT	DVCSNEDLPE	VELVSLLEEQ
LPQYRLKVDT	LFLYENQDWT	QSPHQRQHAS	DALSPVLAEE	TFRYMILGTD
RVEQMTKTYN	DIDMVTHLLA	ERDRDLELAA	RIGQALLKRN	HVLSEQNESL
EEQLGQAFDQ	VNQLQHELCK	KDELLRIVSI	ASEESETDSS	CSTPLRFNES
FSLSQGLLQL	EMLQEKLKEL	EEENMALRSK	ACHIKTETVT	YEEKEQQLVS
DCVKELRETN	AQMSRMTEEL	SGKSDELIRY	QEELSSLLSQ	IVDLQHKLKE
HVIEKEELKL	HLQASKDAQR	QLTMELHELQ	DRNMECLGML	HESQEEIKEL
RSRSGPTAHL	YFSQSYGAFT	GESLAAEIEG	TMRKKLSLDE	ESSLFKQKAQ
QKRVFDTVRI	ANDTRGRSIS	FPALLPIPGS	NRSSVIMTAK	PFESGLQQTE
DKSLLNQGSS	SEEVAGSSQK	MGQPGPSGDS	DLATALHRLS	LRRQNYLSEK
QFFAEEWQRK	IQVLADQKEG	VSGCVTPTES	LASLCTTQSE	ITDLSSASCL
RGFMPEKLQI	VKPLEGSQTL	YHWQQLAQPN	LGTILDPRPG	VITKGFTQLP
GDAIYHISDL	EEDEEEGITF	QVQQPLEVEE	KLSTSKPVTG	IFLPPITSAG
GPVTVATANP	GKCLSCTNST	FTFTTCRILH	PSDITQVTPS	SGFPSLSCGS
SGSSSSNTAV	NSPALSYRLS	IGESITNRRD	STTTFSSTMS	LAKLLQERGI
SAKVYHSPIS	ENPLQPLPKS	LAIPSTPPNS	PSHSPCPSPL	PFEPRVHLSE
NFLASRPAET	FLQEMYGLRP	SRNPPDVGQL	KMNLVDRLKR	LGIARVVKNP
GAQENGRCQE	AEIGPQKPDS	AVYLNSGSSL	LGGLRRNQSL	PVIMGSFAAP
VCTSSPKMGV	LKED

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Fransson S., Ruusala A., Aspenstroem P. (2006). The atypical Rho GTPases Miro-1 and Miro-2 have essential roles in mitochondrial trafficking. Biochem. Biophys. Res. Commun. 344: 500—510. PMID 16630562 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.03.163

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13206 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.
↑ UniProt, O60296 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.