TNIP1

Ідентифікатори

Символи

TNIP1, ABIN-1, NAF1, VAN, nip40-1, TNFAIP3 interacting protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 607714 MGI: 1926194 HomoloGene: 31355 GeneCards: TNIP1

Пов'язані генетичні захворювання

системний червоний вовчак, міастенія, системна склеродермія^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mitogen-activated protein kinase binding • identical protein binding • polyubiquitin modification-dependent protein binding
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинний • нуклеоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма • цитоплазма
Біологічний процес	• leukocyte cell-cell adhesion • defense response • glycoprotein biosynthetic process • negative regulation of viral genome replication • modulation by symbiont of host I-kappaB kinase/NF-kappaB cascade • positive regulation of inflammatory response • inflammatory response • Біосинтез білків • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade • MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • regulation of inflammatory response • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • protein deubiquitination • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to lipopolysaccharide • positive regulation of protein deubiquitination
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10318


57783

Ensembl


ENSG00000145901


ENSMUSG00000020400

UniProt


Q15025


Q9WUU8

RefSeq (мРНК)

NM_001252385 NM_001252386 NM_001252390 NM_001252391 NM_001252392
NM_001252393 NM_001258454 NM_001258455 NM_001258456 NM_006058 NM_001364486 NM_001364487


NM_001199275 NM_001199276 NM_001271455 NM_001271456 NM_021327

RefSeq (білок)

NP_001239314 NP_001239315 NP_001239319 NP_001239320 NP_001239321
NP_001239322 NP_001245383 NP_001245384 NP_001245385 NP_006049 NP_001351415 NP_001351416


NP_001186204 NP_001186205 NP_001258384 NP_001258385 NP_067302

Локус (UCSC)

Хр. 5: 151.03 – 151.09 Mb

Хр. 11: 54.8 – 54.85 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TNIP1 (англ. TNFAIP3 interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 636 амінокислот, а молекулярна маса — 71 864^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEGRGPYRIY	DPGGSVPSGE	ASAAFERLVK	ENSRLKEKMQ	GIKMLGELLE
ESQMEATRLR	QKAEELVKDN	ELLPPPSPSL	GSFDPLAELT	GKDSNVTASP
TAPACPSDKP	APVQKPPSSG	TSSEFEVVTP	EEQNSPESSS	HANAMALGPL
PREDGNLMLH	LQRLETTLSV	CAEEPDHGQL	FTHLGRMALE	FNRLASKVHK
NEQRTSILQT	LCEQLRKENE	ALKAKLDKGL	EQRDQAAERL	REENLELKKL
LMSNGNKEGA	SGRPGSPKME	GTGKKAVAGQ	QQASVTAGKV	PEVVALGAAE
KKVKMLEQQR	SELLEVNKQW	DQHFRSMKQQ	YEQKITELRQ	KLADLQKQVT
DLEAEREQKQ	RDFDRKLLLA	KSKIEMEETD	KEQLTAEAKE	LRQKVKYLQD
QLSPLTRQRE	YQEKEIQRLN	KALEEALSIQ	TPPSSPPTAF	GSPEGAGALL
RKQELVTQNE	LLKQQVKIFE	EDFQRERSDR	ERMNEEKEEL	KKQVEKLQAQ
VTLSNAQLKA	FKDEEKAREA	LRQQKRKAKA	SGERYHVEPH	PEHLCGAYPY
AYPPMPAMVP	HHGFEDWSQI	RYPPPPMAME	HPPPLPNSRL	FHLPEYTWRL
PCGGVRNPNQ	SSQVMDPPTA	RPTEPESPKN	DREGPQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як запальна відповідь, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Gupta K., Ott D., Hope T.J., Siliciano R.F., Boeke J.D. (2000). A human nuclear shuttling protein that interacts with human immunodeficiency virus type 1 matrix is packaged into virions. J. Virol. 74: 11811—11824. PMID 11090181 DOI:10.1128/JVI.74.24.11811-11824.2000
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Loftus S.K., Dixon J., Koprivnikar K., Dixon M.J., Wasmuth J.J. (1996). Transcriptional map of the Treacher Collins candidate gene region. Genome Res. 6: 26—34. PMID 8681136 DOI:10.1101/gr.6.1.26
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TNIP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16903 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q15025 (англ.) . Архів оригіналу за 25 травня 2018. Процитовано 5 вересня 2017.