TLX1

Ідентифікатори

Символи

TLX1, HOX11, TCL3, T-cell leukemia homeobox 1, T cell leukemia homeobox 1

Зовнішні ІД

OMIM: 186770 MGI: 98769 HomoloGene: 4031 GeneCards: TLX1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
Клітинна компонента	• клітинне ядро
Біологічний процес	• multicellular organism development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3195


21908

Ensembl


ENSG00000107807


ENSMUSG00000025215

UniProt


P31314


P43345

RefSeq (мРНК)


NM_001195517 NM_005521


NM_021901

RefSeq (білок)


NP_001182446 NP_005512


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 10: 101.13 – 101.14 Mb

Хр. 19: 45.14 – 45.15 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TLX1 (англ. T-cell leukemia homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 330 амінокислот, а молекулярна маса — 34 365^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEHLGPHHLH	PGHAEPISFG	IDQILNSPDQ	GGCMGPASRL	QDGEYGLGCL
VGGAYTYGGG	GSAAATGAGG	AGAYGTGGPG	GPGGPAGGGG	ACSMGPLTGS
YNVNMALAGG	PGPGGGGGSS	GGAGALSAAG	VIRVPAHRPL	AGAVAHPQPL
ATGLPTVPSV	PAMPGVNNLT	GLTFPWMESN	RRYTKDRFTG	HPYQNRTPPK
KKKPRTSFTR	LQICELEKRF	HRQKYLASAE	RAALAKALKM	TDAQVKTWFQ
NRRTKWRRQT	AEEREAERQQ	ANRILLQLQQ	EAFQKSLAQP	LPADPLCVHN
SSLFALQNLQ	PWSDDSTKIT	SVTSVASACE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Hatano M., Roberts C.W., Minden M., Crist W.M., Korsmeyer S.J. (1991). Deregulation of a homeobox gene, HOX11, by the t(10;14) in T cell leukemia. Science. 253: 79—82. PMID 1676542 DOI:10.1126/science.1676542
Watt P.M., Ranford P.R., Kees U.R. (1999). Sequence of 10q24 locus surrounding the HOX11 oncogene reveals a new gene HUG1 expressed in a T-ALL cell line. Gene. 234: 169—176. PMID 10393251 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00157-2
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Brake R.L., Kees U.R., Watt P.M. (1998). Multiple negative elements contribute to repression of the HOX11 proto-oncogene. Oncogene. 17: 1787—1795. PMID 9778044 DOI:10.1038/sj.onc.1202078
Lu M., Gong Z., Shen W., Ho A.D. (1991). The tcl-3 proto-oncogene altered by chromosomal translocation in T-cell leukemia codes for a homeobox protein. EMBO J. 10: 2905—2910. PMID 1717256
Lu M., Zhang N., Ho A.D. (1992). Genomic organization of the putative human homeobox proto-oncogene HOX-11 (TCL-3) and its endogenous expression in T cells. Oncogene. 7: 1325—1330. PMID 1352396

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5056 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, P31314 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.