TGS1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3EGI, 3GDH | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TGS1, NCOA6IP, PIMT, PIPMT, trimethylguanosine synthase 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606461 MGI: 2151797 HomoloGene: 32608 GeneCards: TGS1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • RNA trimethylguanosine synthase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA methyltransferase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • Тільце Кахаля • нуклеоплазма • ядерце • small nuclear ribonucleoprotein complex • клітинне ядро • міжклітинний простір • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • spliceosomal snRNP assembly • Метилювання • 7-methylguanosine RNA capping • 7-methylguanosine cap hypermethylation • ribonucleoprotein complex biogenesis • RNA methylation • regulation of lipid metabolic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_024831 NM_001317902 NM_001363184 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001304831 NP_079107 NP_001350113 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 8: 55.77 – 55.83 Mb | Хр. 4: 3.57 – 3.62 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TGS1 (англ. Trimethylguanosine synthase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 853 амінокислот, а молекулярна маса — 96 620[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MCCEKWSRVA | | EMFLFIEERE | | DCKILCLCSR | | AFVEDRKLYN | | LGLKGYYIRD |
SGNNSGDQAT | | EEEEGGYSCG | | TAESHDSKGI | | GLDESELDSE | | AELMRSMGLP |
LQFGRITAHK | | DFEVSMNTRN | | KVKIKKKKHQ | | KKYLDEIVQE | | SWRKEYEEDD |
ILASDDPSSI | | EQYENTRTYE | | LQSKKDTETE | | NPPVENTLSP | | KLEITEKWEK |
YWNEYGGGLL | | WQSWQEKHPG | | QALSSEPWNF | | PDTKEEWEQH | | YSQLYWYYLE |
QFQYWEAQGW | | TFDASQSCDT | | DTYTSKTEAD | | DKNDEKCMKV | | DLVSFPSSPI |
MVDNDSSGTS | | DKDHSEILDG | | ISNIKLNSEE | | VTQSQLDSCT | | SHDGHQQLSE |
VSSKRECPAS | | GQSEPRNGGT | | NEESNSSGNT | | NTDPPAEDSQ | | KSSGANTSKD |
RPHASGTDGD | | ESEEDPPEHK | | PSKLKRSHEL | | DIDENPASDF | | DDSGSLLGFK |
YGSGQKYGGI | | PNFSHRQVRY | | LEKNVKLKSK | | YLDMRRQIKM | | KNKHIFFTKE |
SEKPFFKKSK | | ILSKVEKFLT | | WVNKPMDEEA | | SQESSSHDNV | | HDASTSSDSE |
EQDMSVKKGD | | DLLETNNPEP | | EKCQSVSSAG | | ELETENYERD | | SLLATVPDEQ |
DCVTQEVPDS | | RQAETEAEVK | | KKKNKKKNKK | | VNGLPPEIAA | | VPELAKYWAQ |
RYRLFSRFDD | | GIKLDREGWF | | SVTPEKIAEH | | IAGRVSQSFK | | CDVVVDAFCG |
VGGNTIQFAL | | TGMRVIAIDI | | DPVKIALARN | | NAEVYGIADK | | IEFICGDFLL |
LASFLKADVV | | FLSPPWGGPD | | YATAETFDIR | | TMMSPDGFEI | | FRLSKKITNN |
IVYFLPRNAD | | IDQVASLAGP | | GGQVEIEQNF | | LNNKLKTITA | | YFGDLIRRPA |
SET |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Monecke T., Dickmanns A., Strasser A., Ficner R. (2009). Structure analysis of the conserved methyltransferase domain of human trimethylguanosine synthase TGS1. Acta Crystallogr. D. 65: 332—338. PMID 19307714 DOI:10.1107/S0907444909003102
- Monecke T., Dickmanns A., Ficner R. (2009). Structural basis for m7G-cap hypermethylation of small nuclear, small nucleolar and telomerase RNA by the dimethyltransferase TGS1. Nucleic Acids Res. 37: 3865—3877. PMID 19386620 DOI:10.1093/nar/gkp249
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17843 (англ.) . Архів оригіналу за 10 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q96RS0 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |