TAPBP

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3F8U

Ідентифікатори

Символи

TAPBP, NGS17, TAPA, TPN, TPSN, TAP binding protein (tapasin), TAP binding protein

Зовнішні ІД

OMIM: 601962 MGI: 1201689 HomoloGene: 2401 GeneCards: TAPBP

Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptide antigen binding • TAP2 binding • unfolded protein binding • ABC-type peptide antigen transporter activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • MHC class I protein binding • TAP1 binding • TAP complex binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • Golgi membrane • TAP complex • MHC class I peptide loading complex • ендоплазматичний ретикулум • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane • phagocytic vesicle membrane • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane
Біологічний процес	• retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I • antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class I • regulation of protein complex stability • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • peptide antigen stabilization • регуляція експресії генів • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • vesicle fusion with endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment (ERGIC) membrane • amide transport • GO:0034622 protein-containing complex assembly • MHC class Ib protein complex assembly • peptide transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6892


21356

Ensembl

ENSG00000231925 ENSG00000236490 ENSG00000206281 ENSG00000206208 ENSG00000112493
н/д


ENSMUSG00000024308

UniProt


O15533


Q9R233

RefSeq (мРНК)


NM_003190 NM_172208 NM_172209


NM_001025313 NM_009318

RefSeq (білок)


NP_003181 NP_757345 NP_757346


NP_001020484 NP_033344

Локус (UCSC)

Хр. 6: 33.3 – 33.31 Mb

Хр. 17: 34.13 – 34.15 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TAPBP (англ. TAP binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 448 амінокислот, а молекулярна маса — 47 626^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKSLSLLLAV	ALGLATAVSA	GPAVIECWFV	EDASGKGLAK	RPGALLLRQG
PGEPPPRPDL	DPELYLSVHD	PAGALQAAFR	RYPRGAPAPH	CEMSRFVPLP
ASAKWASGLT	PAQNCPRALD	GAWLMVSISS	PVLSLSSLLR	PQPEPQQEPV
LITMATVVLT	VLTHTPAPRV	RLGQDALLDL	SFAYMPPTSE	AASSLAPGPP
PFGLEWRRQH	LGKGHLLLAA	TPGLNGQMPA	AQEGAVAFAA	WDDDEPWGPW
TGNGTFWLPR	VQPFQEGTYL	ATIHLPYLQG	QVTLELAVYK	PPKVSLMPAT
LARAAPGEAP	PELLCLVSHF	YPSGGLEVEW	ELRGGPGGRS	QKAEGQRWLS
ALRHHSDGSV	SLSGHLQPPP	VTTEQHGARY	ACRIHHPSLP	ASGRSAEVTL
EVAGLSGPSL	EDSVGLFLSA	FLLLGLFKAL	GWAAVYLSTC	KDSKKKAE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

Li S., Sjoegren H.-O., Hellman U., Pettersson R.F., Wang P. (1997). Cloning and functional characterization of a subunit of the transporter associated with antigen processing. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 8708—8713. PMID 9238042 DOI:10.1073/pnas.94.16.8708
Herberg J.A., Beck S., Trowsdale J. (1998). TAPASIN, DAXX, RGL2, HKE2 and four new genes (BING 1, 3 to 5) form a dense cluster at the centromeric end of the MHC. J. Mol. Biol. 277: 839—857. PMID 9545376 DOI:10.1006/jmbi.1998.1637
Gao B., Williams A., Sewell A., Elliott T. (2004). Generation of a functional, soluble tapasin protein from an alternatively spliced mRNA. Genes Immun. 5: 101—108. PMID 14668790 DOI:10.1038/sj.gene.6364043
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bangia N., Lehner P.J., Hughes E.A., Surman M., Cresswell P. (1999). The N-terminal region of tapasin is required to stabilize the MHC class I loading complex. Eur. J. Immunol. 29: 1858—1870. PMID 10382748 DOI:10.1002/(SICI)1521-4141(199906)29:06<1858::AID-IMMU1858>3.0.CO;2-C
Li S., Paulsson K.M., Chen S., Sjoegren H.-O., Wang P. (2000). Tapasin is required for efficient peptide binding to transporter associated with antigen processing. J. Biol. Chem. 275: 1581—1586. PMID 10636848 DOI:10.1074/jbc.275.3.1581

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11566 (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, O15533 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.