SYN3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2P0A

Ідентифікатори

Символи

SYN3, synapsin III

Зовнішні ІД

OMIM: 602705 MGI: 1351334 HomoloGene: 68320 GeneCards: SYN3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • ATP binding
Клітинна компонента	• міжклітинні контакти • синапс • synaptic vesicle membrane • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • Синаптичні бульбашки • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • glutamatergic synapse
Біологічний процес	• regulation of synaptic transmission, GABAergic • GO:0010554 neurotransmitter secretion • synaptic vesicle clustering • synaptic vesicle cycle
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8224


27204

Ensembl


ENSG00000185666


ENSMUSG00000059602

UniProt


O14994


Q8JZP2

RefSeq (мРНК)

NM_001135774 NM_003490 NM_133632 NM_133633 NM_001369907
NM_001369908 NM_001369909 NM_001369910


NM_001164495 NM_013722

RefSeq (білок)

NP_001129246 NP_003481 NP_598344 NP_001356836 NP_001356837
NP_001356838 NP_001356839


NP_001157967 NP_038750

Локус (UCSC)

Хр. 22: 32.51 – 33.06 Mb

Хр. 10: 86.06 – 86.5 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SYN3 (англ. Synapsin III) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 580 амінокислот, а молекулярна маса — 63 303^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNFLRRRLSD	SSFMANLPNG	YMTDLQRPDS	STSSPASPAM	ERRHPQPLAA
SFSSPGSSLF	SSLSSAMKQA	PQATSGLMEP	PGPSTPIVQR	PRILLVIDDA
HTDWSKYFHG	KKVNGEIEIR	VEQAEFSELN	LAAYVTGGCM	VDMQVVRNGT
KVVSRSFKPD	FILVRQHAYS	MALGEDYRSL	VIGLQYGGLP	AVNSLYSVYN
FCSKPWVFSQ	LIKIFHSLGP	EKFPLVEQTF	FPNHKPMVTA	PHFPVVVKLG
HAHAGMGKIK	VENQLDFQDI	TSVVAMAKTY	ATTEAFIDSK	YDIRIQKIGS
NYKAYMRTSI	SGNWKANTGS	AMLEQVAMTE	RYRLWVDSCS	EMFGGLDICA
VKAVHSKDGR	DYIIEVMDSS	MPLIGEHVEE	DRQLMADLVV	SKMSQLPMPG
GTAPSPLRPW	APQIKSAKSP	GQAQLGPQLG	QPQPRPPPQG	GPRQAQSPQP
QRSGSPSQQR	LSPQGQQPLS	PQSGSPQQQR	SPGSPQLSRA	SSGSSPNQAS
KPGATLASQP	RPPVQGRSTS	QQGEESKKPA	PPHPHLNKSQ	SLTNSLSTSD
TSQRGTPSED	EAKAETIRNL	RKSFASLFSD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Porton B., Ferreira A., DeLisi L.E., Kao H.T. (2004). A rare polymorphism affects a mitogen-activated protein kinase site in synapsin III: possible relationship to schizophrenia. Biol. Psychiatry. 55: 118—125. PMID 14732590 DOI:10.1016/j.biopsych.2003.07.002

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11496 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O14994 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.