SUV39H2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2R3A

Ідентифікатори

Символи

SUV39H2, KMT1B, suppressor of variegation 3-9 homolog 2, SUV39H2 histone lysine methyltransferase

Зовнішні ІД

OMIM: 606503 MGI: 1890396 HomoloGene: 32548 GeneCards: SUV39H2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • histone methyltransferase activity (H3-K9 specific) • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone-lysine N-methyltransferase activity • zinc ion binding • S-adenosyl-L-methionine binding
Клітинна компонента	• хромосома • нуклеоплазма • Хроматин • центромера • клітинне ядро
Біологічний процес	• ремоделювання хроматину • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ритмічний процес • histone H3-K9 dimethylation • negative regulation of circadian rhythm • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • histone H3-K9 trimethylation • Метилювання • histone lysine methylation • клітинний цикл • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to hypoxia • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


79723


64707

Ensembl


ENSG00000152455


ENSMUSG00000026646

UniProt


Q9H5I1


Q9EQQ0

RefSeq (мРНК)


NM_001193424 NM_001193425 NM_001193426 NM_001193427 NM_024670


NM_022724

RefSeq (білок)


NP_001180353 NP_001180354 NP_001180355 NP_001180356 NP_078946


NP_073561

Локус (UCSC)

Хр. 10: 14.88 – 14.9 Mb

Хр. 2: 3.46 – 3.48 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SUV39H2 (англ. Suppressor of variegation 3-9 homolog 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 410 амінокислот, а молекулярна маса — 46 682^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAVGAEARG	AWCVPCLVSL	DTLQELCRKE	KLTCKSIGIT	KRNLNNYEVE
YLCDYKVVKD	MEYYLVKWKG	WPDSTNTWEP	LQNLKCPLLL	QQFSNDKHNY
LSQVKKGKAI	TPKDNNKTLK	PAIAEYIVKK	AKQRIALQRW	QDELNRRKNH
KGMIFVENTV	DLEGPPSDFY	YINEYKPAPG	ISLVNEATFG	CSCTDCFFQK
CCPAEAGVLL	AYNKNQQIKI	PPGTPIYECN	SRCQCGPDCP	NRIVQKGTQY
SLCIFRTSNG	RGWGVKTLVK	IKRMSFVMEY	VGEVITSEEA	ERRGQFYDNK
GITYLFDLDY	ESDEFTVDAA	RYGNVSHFVN	HSCDPNLQVF	NVFIDNLDTR
LPRIALFSTR	TINAGEELTF	DYQMKGSGDI	SSDSIDHSPA	KKRVRTVCKC
GAVTCRGYLN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, регуляторів хроматину, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, біологічні ритми, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17287 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9H5I1 (англ.) . Архів оригіналу за 15 серпня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.