SUV39H1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SUV39H1, H3-K9-HMTase 1, KMT1A, MG44, SUV39H, suppressor of variegation 3-9 homolog 1, SUV39H1 histone lysine methyltransferase |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 300254 MGI: 1099440 HomoloGene: 2388 GeneCards: SUV39H1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • histone methyltransferase activity • histone methyltransferase activity (H3-K9 specific) • S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity • protein N-terminus binding • zinc ion binding • chromatin binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone-lysine N-methyltransferase activity |
---|
Клітинна компонента | • Ядерна пластинка • нуклеоплазма • хромосома • GO:0035328 Гетерохроматин • condensed nuclear chromosome • rDNA heterochromatin • chromatin silencing complex • центромера • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • histone H3-K9 dimethylation • ритмічний процес • negative regulation of circadian rhythm • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • histone H3-K9 trimethylation • cellular response to DNA damage stimulus • Метилювання • rDNA heterochromatin assembly • rRNA processing • histone lysine methylation • клітинний цикл • GO:0022415 viral process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to hypoxia • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/28/PBB_GE_SUV39H1_218619_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SUV39H1_218619_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001290716 NM_011514 NM_001358237 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001277645 NP_035644 NP_001345166 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. X: 48.7 – 48.71 Mb | Хр. X: 7.93 – 7.94 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SUV39H1 (англ. Suppressor of variegation 3-9 homolog 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 412 амінокислот, а молекулярна маса — 47 907[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAENLKGCSV | | CCKSSWNQLQ | | DLCRLAKLSC | | PALGISKRNL | | YDFEVEYLCD |
YKKIREQEYY | | LVKWRGYPDS | | ESTWEPRQNL | | KCVRILKQFH | | KDLERELLRR |
HHRSKTPRHL | | DPSLANYLVQ | | KAKQRRALRR | | WEQELNAKRS | | HLGRITVENE |
VDLDGPPRAF | | VYINEYRVGE | | GITLNQVAVG | | CECQDCLWAP | | TGGCCPGASL |
HKFAYNDQGQ | | VRLRAGLPIY | | ECNSRCRCGY | | DCPNRVVQKG | | IRYDLCIFRT |
DDGRGWGVRT | | LEKIRKNSFV | | MEYVGEIITS | | EEAERRGQIY | | DRQGATYLFD |
LDYVEDVYTV | | DAAYYGNISH | | FVNHSCDPNL | | QVYNVFIDNL | | DERLPRIAFF |
ATRTIRAGEE | | LTFDYNMQVD | | PVDMESTRMD | | SNFGLAGLPG | | SPKKRVRIEC |
KCGTESCRKY | | LF |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, регуляторів хроматину, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, біологічні ритми, процесинг рРНК, диференціація клітин, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Firestein R., Cui X., Huie P., Cleary M.L. (2000). Set domain-dependent regulation of transcriptional silencing and growth control by SUV39H1, a mammalian ortholog of Drosophila Su(var)3-9. Mol. Cell. Biol. 20: 4900—4909. PMID 10848615 DOI:10.1128/MCB.20.13.4900-4909.2000
- Lachner M., O'Carroll D., Rea S., Mechtler K., Jenuwein T. (2001). Methylation of histone H3 lysine 9 creates a binding site for HP1 proteins. Nature. 410: 116—120. PMID 11242053 DOI:10.1038/35065132
- Chakraborty S., Sinha K.K., Senyuk V., Nucifora G. (2003). SUV39H1 interacts with AML1 and abrogates AML1 transactivity. AML1 is methylated in vivo. Oncogene. 22: 5229—5237. PMID 12917624 DOI:10.1038/sj.onc.1206600
- Macaluso M., Cinti C., Russo G., Russo A., Giordano A. (2003). pRb2/p130-E2F4/5-HDAC1-SUV39H1-p300 and pRb2/p130-E2F4/5-HDAC1-SUV39H1-DNMT1 multimolecular complexes mediate the transcription of estrogen receptor-alpha in breast cancer. Oncogene. 22: 3511—3517. PMID 12789259 DOI:10.1038/sj.onc.1206578
- Vassen L., Fiolka K., Moeroey T. (2006). Gfi1b alters histone methylation at target gene promoters and sites of gamma-satellite containing heterochromatin. EMBO J. 25: 2409—2419. PMID 16688220 DOI:10.1038/sj.emboj.7601124
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11479 (англ.) . Процитовано 13 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O43463 (англ.) . Архів оригіналу за 13 вересня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |