SUV39H1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3MTS

Ідентифікатори

Символи

SUV39H1, H3-K9-HMTase 1, KMT1A, MG44, SUV39H, suppressor of variegation 3-9 homolog 1, SUV39H1 histone lysine methyltransferase

Зовнішні ІД

OMIM: 300254 MGI: 1099440 HomoloGene: 2388 GeneCards: SUV39H1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • histone methyltransferase activity • histone methyltransferase activity (H3-K9 specific) • S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity • protein N-terminus binding • zinc ion binding • chromatin binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone-lysine N-methyltransferase activity
Клітинна компонента	• Ядерна пластинка • нуклеоплазма • хромосома • GO:0035328 Гетерохроматин • condensed nuclear chromosome • rDNA heterochromatin • chromatin silencing complex • центромера • клітинне ядро
Біологічний процес	• диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • histone H3-K9 dimethylation • ритмічний процес • negative regulation of circadian rhythm • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • histone H3-K9 trimethylation • cellular response to DNA damage stimulus • Метилювання • rDNA heterochromatin assembly • rRNA processing • histone lysine methylation • клітинний цикл • GO:0022415 viral process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to hypoxia • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6839


20937

Ensembl


ENSG00000101945


ENSMUSG00000039231

UniProt


O43463


O54864

RefSeq (мРНК)


NM_003173 NM_001282166


NM_001290716 NM_011514 NM_001358237

RefSeq (білок)


NP_001269095 NP_003164


NP_001277645 NP_035644 NP_001345166

Локус (UCSC)

Хр. X: 48.7 – 48.71 Mb

Хр. X: 7.93 – 7.94 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SUV39H1 (англ. Suppressor of variegation 3-9 homolog 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 412 амінокислот, а молекулярна маса — 47 907^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAENLKGCSV	CCKSSWNQLQ	DLCRLAKLSC	PALGISKRNL	YDFEVEYLCD
YKKIREQEYY	LVKWRGYPDS	ESTWEPRQNL	KCVRILKQFH	KDLERELLRR
HHRSKTPRHL	DPSLANYLVQ	KAKQRRALRR	WEQELNAKRS	HLGRITVENE
VDLDGPPRAF	VYINEYRVGE	GITLNQVAVG	CECQDCLWAP	TGGCCPGASL
HKFAYNDQGQ	VRLRAGLPIY	ECNSRCRCGY	DCPNRVVQKG	IRYDLCIFRT
DDGRGWGVRT	LEKIRKNSFV	MEYVGEIITS	EEAERRGQIY	DRQGATYLFD
LDYVEDVYTV	DAAYYGNISH	FVNHSCDPNL	QVYNVFIDNL	DERLPRIAFF
ATRTIRAGEE	LTFDYNMQVD	PVDMESTRMD	SNFGLAGLPG	SPKKRVRIEC
KCGTESCRKY	LF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, регуляторів хроматину, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, біологічні ритми, процесинг рРНК, диференціація клітин, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Firestein R., Cui X., Huie P., Cleary M.L. (2000). Set domain-dependent regulation of transcriptional silencing and growth control by SUV39H1, a mammalian ortholog of Drosophila Su(var)3-9. Mol. Cell. Biol. 20: 4900—4909. PMID 10848615 DOI:10.1128/MCB.20.13.4900-4909.2000
Lachner M., O'Carroll D., Rea S., Mechtler K., Jenuwein T. (2001). Methylation of histone H3 lysine 9 creates a binding site for HP1 proteins. Nature. 410: 116—120. PMID 11242053 DOI:10.1038/35065132
Chakraborty S., Sinha K.K., Senyuk V., Nucifora G. (2003). SUV39H1 interacts with AML1 and abrogates AML1 transactivity. AML1 is methylated in vivo. Oncogene. 22: 5229—5237. PMID 12917624 DOI:10.1038/sj.onc.1206600
Macaluso M., Cinti C., Russo G., Russo A., Giordano A. (2003). pRb2/p130-E2F4/5-HDAC1-SUV39H1-p300 and pRb2/p130-E2F4/5-HDAC1-SUV39H1-DNMT1 multimolecular complexes mediate the transcription of estrogen receptor-alpha in breast cancer. Oncogene. 22: 3511—3517. PMID 12789259 DOI:10.1038/sj.onc.1206578
Vassen L., Fiolka K., Moeroey T. (2006). Gfi1b alters histone methylation at target gene promoters and sites of gamma-satellite containing heterochromatin. EMBO J. 25: 2409—2419. PMID 16688220 DOI:10.1038/sj.emboj.7601124

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11479 (англ.) . Процитовано 13 вересня 2017.
↑ UniProt, O43463 (англ.) . Архів оригіналу за 13 вересня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.