SUDS3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2N2H, 4ZQA

Ідентифікатори

Символи

SUDS3, SAP45, SDS3, SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component

Зовнішні ІД

OMIM: 608250 MGI: 1919204 HomoloGene: 15906 GeneCards: SUDS3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• histone deacetylase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • enzyme binding • histone deacetylase activity
Клітинна компонента	• Sin3 complex • нуклеоплазма • Sin3-type complex • клітинне ядро • гіалоплазма • ядерні тільця
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • substantia nigra development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • positive regulation of apoptotic process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • histone deacetylation • GO:0097285 апоптоз • protein deubiquitination • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


64426


71954

Ensembl


ENSG00000111707


ENSMUSG00000066900

UniProt


Q9H7L9


Q8BR65

RefSeq (мРНК)


NM_022491


NM_001122666 NM_178622

RefSeq (білок)


NP_071936


NP_001116138 NP_848737

Локус (UCSC)

Хр. 12: 118.38 – 118.42 Mb

Хр. 5: 117.23 – 117.25 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SUDS3 (англ. SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 328 амінокислот, а молекулярна маса — 38 136^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSAAGLLAPA	PAQAGAPPAP	EYYPEEDEEL	ESAEDDERSC	RGRESDEDTE
DASETDLAKH	DEEDYVEMKE	QMYQDKLASL	KRQLQQLQEG	TLQEYQKRMK
KLDQQYKERI	RNAELFLQLE	TEQVERNYIK	EKKAAVKEFE	DKKVELKENL
IAELEEKKKM	IENEKLTMEL	TGDSMEVKPI	MTRKLRRRPN	DPVPIPDKRR
KPAPAQLNYL	LTDEQIMEDL	RTLNKLKSPK	RPASPSSPEH	LPATPAESPA
QRFEARIEDG	KLYYDKRWYH	KSQAIYLESK	DNQKLSCVIS	SVGANEIWVR
KTSDSTKMRI	YLGQLQRGLF	VIRRRSAA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

Fleischer T.C., Yun U.J., Ayer D.E. (2003). Identification and characterization of three new components of the mSin3A corepressor complex. Mol. Cell. Biol. 23: 3456—3467. PMID 12724404 DOI:10.1128/MCB.23.10.3456-3467.2003
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wysocka J., Myers M.P., Laherty C.D., Eisenman R.N., Herr W. (2003). Human Sin3 deacetylase and trithorax-related Set1/Ash2 histone H3-K4 methyltransferase are tethered together selectively by the cell-proliferation factor HCF-1. Genes Dev. 17: 896—911. PMID 12670868 DOI:10.1101/gad.252103

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29545 (англ.) . Архів оригіналу за 5 квітня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9H7L9 (англ.) . Архів оригіналу за 19 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.