SRSF5

Ідентифікатори

Символи

SRSF5, HRS, SFRS5, SRP40, serine/arginine-rich splicing factor 5, serine and arginine rich splicing factor 5

Зовнішні ІД

OMIM: 600914 MGI: 98287 HomoloGene: 134432 GeneCards: SRSF5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • protein kinase B binding • RNA binding
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • ядерце • клітинне ядро • гіалоплазма • nuclear speck
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • mRNA export from nucleus • regulation of cell cycle • liver regeneration • mRNA splice site selection • cellular response to insulin stimulus • mRNA 3'-end processing • liver development • Сплайсинг РНК • response to insulin • RNA export from nucleus • positive regulation of RNA splicing • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • mRNA cis splicing, via spliceosome
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6430


20384

Ensembl


ENSG00000100650


ENSMUSG00000021134

UniProt


Q13243


O35326

RefSeq (мРНК)


NM_001039465 NM_006925 NM_001320214


NM_001079694 NM_001079695 NM_009159 NM_001347415 NM_001347416

RefSeq (білок)


NP_001034554 NP_001307143 NP_008856


NP_001073162 NP_001073163 NP_001334344 NP_001334345 NP_033185

Локус (UCSC)

Хр. 14: 69.73 – 69.77 Mb

Хр. 12: 80.99 – 81 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SRSF5 (англ. Serine and arginine rich splicing factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 272 амінокислот, а молекулярна маса — 31 264^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGCRVFIGR	LNPAAREKDV	ERFFKGYGRI	RDIDLKRGFG	FVEFEDPRDA
DDAVYELDGK	ELCSERVTIE	HARARSRGGR	GRGRYSDRFS	SRRPRNDRRN
APPVRTENRL	IVENLSSRVS	WQDLKDFMRQ	AGEVTFADAH	RPKLNEGVVE
FASYGDLKNA	IEKLSGKEIN	GRKIKLIEGS	KRHSRSRSRS	RSRTRSSSRS
RSRSRSRSRK	SYSRSRSRSR	SRSRSKSRSV	SRSPVPEKSQ	KRGSSSRSKS
PASVDRQRSR	SRSRSRSVDS	GN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Du K., Taub R. (1997). Alternative splicing and structure of the human and mouse SFRS5/HRS/SRp40 genes. Gene. 204: 243—249. PMID 9434190 DOI:10.1016/S0378-1119(97)00552-0
Zahler A.M., Lane W.S., Stolk J.A., Roth M.B. (1992). SR proteins: a conserved family of pre-mRNA splicing factors. Genes Dev. 6: 837—847. PMID 1577277 DOI:10.1101/gad.6.5.837
Blencowe B.J., Issner R., Nickerson J.A., Sharp P.A. (1998). A coactivator of pre-mRNA splicing. Genes Dev. 12: 996—1009. PMID 9531537 DOI:10.1101/gad.12.7.996
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10787 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q13243 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.