SMU1 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

SMU1

Ідентифікатори

Символи

SMU1, BWD, SMU-1, fSAP57, smu-1 suppressor of mec-8 and unc-52 homolog (C. elegans), DNA replication regulator and spliceosomal factor, DNA replication regulator and spliceosomal factor, SMU1 DNA replication regulator and spliceosomal factor

Зовнішні ІД

OMIM: 617811 MGI: 1915546 HomoloGene: 10079 GeneCards: SMU1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • nuclear speck • клітинне ядро • U2-type precatalytic spliceosome
Біологічний процес	• regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • Сплайсинг РНК • mRNA splicing, via spliceosome
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55234


74255

Ensembl


ENSG00000122692


ENSMUSG00000028409

UniProt


Q2TAY7


Q3UKJ7

RefSeq (мРНК)


NM_018225


NM_021535

RefSeq (білок)


NP_060695 NP_060695.2


NP_067510

Локус (UCSC)

Хр. 9: 33.04 – 33.08 Mb

Хр. 4: 40.74 – 40.76 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SMU1 (англ. DNA replication regulator and spliceosomal factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 513 амінокислот, а молекулярна маса — 57 544^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSIEIESSDV	IRLIMQYLKE	NSLHRALATL	QEETTVSLNT	VDSIESFVAD
INSGHWDTVL	QAIQSLKLPD	KTLIDLYEQV	VLELIELREL	GAARSLLRQT
DPMIMLKQTQ	PERYIHLENL	LARSYFDPRE	AYPDGSSKEK	RRAAIAQALA
GEVSVVPPSR	LMALLGQALK	WQQHQGLLPP	GMTIDLFRGK	AAVKDVEEEK
FPTQLSRHIK	FGQKSHVECA	RFSPDGQYLV	TGSVDGFIEV	WNFTTGKIRK
DLKYQAQDNF	MMMDDAVLCM	CFSRDTEMLA	TGAQDGKIKV	WKIQSGQCLR
RFERAHSKGV	TCLSFSKDSS	QILSASFDQT	IRIHGLKSGK	TLKEFRGHSS
FVNEATFTQD	GHYIISASSD	GTVKIWNMKT	TECSNTFKSL	GSTAGTDITV
NSVILLPKNP	EHFVVCNRSN	TVVIMNMQGQ	IVRSFSSGKR	EGGDFVCCAL
SPRGEWIYCV	GEDFVLYCFS	TVTGKLERTL	TVHEKDVIGI	AHHPHQNLIA
TYSEDGLLKL	WKP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18247 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q2TAY7 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.