SMO (ген)

SMO

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4JKV, 4N4W, 4O9R, 4QIM, 4QIN, 5L7I

Ідентифікатори

Символи

SMO, FZD11, Gx, SMOH, smoothened, frizzled class receptor, CRJS, PHLS

Зовнішні ІД

OMIM: 601500 MGI: 108075 HomoloGene: 4115 GeneCards: SMO

Пов'язані генетичні захворювання

Curry-Jones syndrome^[1]

Реагує на сполуку

saridegib, sonidegib, vismodegib, saridegib, vismodegib, sonidegib, BMS-833923, glasdegib, TAK-441^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• patched binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transmembrane signaling receptor activity • signal transducer activity • G protein-coupled receptor activity • Wnt-protein binding • Wnt-activated receptor activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • endocytic vesicle membrane • мембрана • caveola • cell projection • екзосома • комплекс Ґольджі • внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинна мембрана • ciliary tip • ciliary membrane • війка • integral component of membrane
Біологічний процес	• pattern specification process • pancreas morphogenesis • negative regulation of DNA binding • smoothened signaling pathway involved in ventral spinal cord patterning • васкулогенез • heart looping • odontogenesis of dentin-containing tooth • atrial septum morphogenesis • cell surface receptor signaling pathway • positive regulation of mesenchymal cell proliferation • cerebellar cortex morphogenesis • positive regulation of multicellular organism growth • hair follicle morphogenesis • regulation of heart morphogenesis • type B pancreatic cell development • positive regulation of neuroblast proliferation • renal system development • positive regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis • positive regulation of smoothened signaling pathway • осифікація • embryonic organ development • dentate gyrus development • epithelial-mesenchymal cell signaling • regulation of stem cell population maintenance • in utero embryonic development • cellular response to cholesterol • negative regulation of gene expression • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • forebrain morphogenesis • negative regulation of hair follicle development • central nervous system development • central nervous system neuron differentiation • positive regulation of protein import into nucleus • smoothened signaling pathway • G protein-coupled receptor signaling pathway • multicellular organism growth • thalamus development • positive regulation of epithelial cell proliferation • smoothened signaling pathway involved in regulation of cerebellar granule cell precursor cell proliferation • cell fate specification • protein stabilization • positive regulation of organ growth • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • developmental growth • osteoblast differentiation • determination of left/right asymmetry in lateral mesoderm • cerebral cortex development • регуляція експресії генів • homeostasis of number of cells within a tissue • dorsal/ventral neural tube patterning • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • dorsal/ventral pattern formation • myoblast migration • positive regulation of hh target transcription factor activity • ventral midline determination • розвиток клітин • astrocyte activation • heart morphogenesis • mesenchymal to epithelial transition involved in metanephric renal vesicle formation • somite development • mammary gland epithelial cell differentiation • multicellular organism development • GO:1901313 positive regulation of gene expression • determination of left/right symmetry • skeletal muscle fiber development • neural crest cell migration • positive regulation of cell population proliferation • protein localization to nucleus • digestive tract development • negative regulation of epithelial cell differentiation • left/right axis specification • anterior/posterior pattern specification • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0072468 сигнальна трансдукція • midgut development • non-canonical Wnt signaling pathway • canonical Wnt signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6608


319757

Ensembl


ENSG00000128602


ENSMUSG00000001761

UniProt


Q99835


P56726

RefSeq (мРНК)


NM_005631


NM_176996

RefSeq (білок)


NP_005622


NP_795970

Локус (UCSC)

Хр. 7: 129.19 – 129.21 Mb

Хр. 6: 29.74 – 29.76 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SMO (англ. Smoothened, frizzled class receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 787 амінокислот, а молекулярна маса — 86 397^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAARPARGP	ELPLLGLLLL	LLLGDPGRGA	ASSGNATGPG	PRSAGGSARR
SAAVTGPPPP	LSHCGRAAPC	EPLRYNVCLG	SVLPYGATST	LLAGDSDSQE
EAHGKLVLWS	GLRNAPRCWA	VIQPLLCAVY	MPKCENDRVE	LPSRTLCQAT
RGPCAIVERE	RGWPDFLRCT	PDRFPEGCTN	EVQNIKFNSS	GQCEVPLVRT
DNPKSWYEDV	EGCGIQCQNP	LFTEAEHQDM	HSYIAAFGAV	TGLCTLFTLA
TFVADWRNSN	RYPAVILFYV	NACFFVGSIG	WLAQFMDGAR	REIVCRADGT
MRLGEPTSNE	TLSCVIIFVI	VYYALMAGVV	WFVVLTYAWH	TSFKALGTTY
QPLSGKTSYF	HLLTWSLPFV	LTVAILAVAQ	VDGDSVSGIC	FVGYKNYRYR
AGFVLAPIGL	VLIVGGYFLI	RGVMTLFSIK	SNHPGLLSEK	AASKINETML
RLGIFGFLAF	GFVLITFSCH	FYDFFNQAEW	ERSFRDYVLC	QANVTIGLPT
KQPIPDCEIK	NRPSLLVEKI	NLFAMFGTGI	AMSTWVWTKA	TLLIWRRTWC
RLTGQSDDEP	KRIKKSKMIA	KAFSKRHELL	QNPGQELSFS	MHTVSHDGPV
AGLAFDLNEP	SADVSSAWAQ	HVTKMVARRG	AILPQDISVT	PVATPVPPEE
QANLWLVEAE	ISPELQKRLG	RKKKRRKRKK	EVCPLAPPPE	LHPPAPAPST
IPRLPQLPRQ	KCLVAAGAWG	AGDSCRQGAW	TLVSNPFCPE	PSPPQDPFLP
SAPAPVAWAH	GRRQGLGPIH	SRTNLMDTEL	MDADSDF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, білків розвитку. Локалізований у мембрані, клітинних відростках.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SMO переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Smoothened, frizzled class receptor переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11119 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q99835 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Трансмембранні рецептори: G-білокспряжені рецептори

Клас A: Родопсин-подібні

Рецептори нейромедіаторів

Адренорецептори	α1 A B D α2 A B C β1 β2 β3
Пуринові рецептори	Аденозинові рецептори A1 A2A A2B A3 P2Y 1 2 4 5 6 8 9 10 11 12 13 14
Серотонінові рецептори	(крім 5-HT3) 5-HT1 A B D E F) 5-HT2 A B C 5-HT 4 5A 6 7)
Інші	Мускариновий ацетилхоліновий рецептор M1 M2 M3 M4 M5 Дофамінові рецептори D1 D2 D3 D4 D5 GHB-рецептор Гістамінові рецептори H1 H2 H3 H4 Мелатонінові рецептори 1A 1B 1C TAAR 1 2 5 6 8 9

Метаболіти та
сигнальні молекули

Ейкозаноїдні рецептори	CysLT 1 2 LTB4 1 2 FPR2 OXER1 Простагландинові рецептори DP 1 2 EP 1 2 3 4) FP PTGIR TBXA2R
Інші	Жовчні кислоти Канабіноїдні рецептори CB1 CB2 GPR 18 55 119 EBI2 Естроген Рецептори вільних жирних кислот 1 2 3 4 HCAR 1 2 3 LPAR 1 2 3 4 5 6 S1PR 1 2 3 4 5 OXGR1 PTAFR SUCNR1

Пептиди

Рецептори нейропептидів

B/W
- 1
- 2
FF
- 1
- 2
S
Y
- 1
- 2
- 4
- 5
Нейромедин
- B
- U
  - 1
  - 2
Нейротенсин
- 1
- 2

Інші

Анафілатоксин
- C3a
- C5a
  - 1
  - 2
Ангіатонзин
- 1
- 2
Апелін
Бомбезин
- BRS3
- GRPR
- NMBR
Брадикинін
- B1
- B2
Хемокиновий рецептор
Холецистокинін
- A
- B
Ендотилін
- A
- B
FPR
- 1
- 2
- 3
FSHR
Галанін
- 1
- 2
- 3
GNRHR
- 1
- 2
GHSR
KISS1R
LHCGR
MAS
- 1
- 1L
- D
- E
- F
- G
- X1
- X2
- X3
- X4
Меланокортин
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
MCHR
- 1
- 2
MLNR
Опіати
- Δ
- Κ
- Μ
- OPRL1
- OGFR
Орексин
- 1
- 2
Окситоцин
Прокінетецин
- 1
- 2
PRLHR
Релаксин
- 1
- 2
- 3
- 4
Рецептори соматостатинів
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
Тахінін
- 1
- 2
- 3
Рецептор тиреотропного гормону
TRHR
UTS2R
Рецептори вазопресину
- 1A
- 1B
- 2

Різні

Смак, гірке	TAS2R 1 3 4 5 7 8 9 10 13 14 16 19 20 30 31 38 39 40 41 42 43 45 46 50 60 VN1R 1 2 3 4 5
Орфанні	GPR (1 3 4 6 12 15 17 18 19 20 21 22 23 25 26 27 31 32 33 34 35 37 39 42 44 45 50 52 55 61 62 63 65 68 75 77 78 81 82 83 84 85 87 88 92 101 103 109A 109B 119 120 132 135 137B 139 141 142 146 148 149 150 151 152 153 160 161 162 171 173 174 176 177 182 183)
Інші	GPR182 Запах Опсин 3 4 5 1LW 1MW 1SW RGR RRH F2R 1 2 3 4 SREB 1 2 3

Клас B: Секретин-подібні

Адгезивні	ADGRG 1 2 3 4 5 6 7
Орфанні	GPR (56 64 97 98 110 111 112 113 114 115 116 123 124 125 126 128 133 143 144 155 157)
Інші	ADGRB 1 2 3 CELSR 1 2 3 Кальцитонін CALCRL ADGRE5 CRHR 1 2 EMR 1 2 3 Глюкагон GR GIPR GLP1R GLP2R GHRHR PACAPR1 Латрофілін 1 2 3 4 PTH 1 2 SCTR VIPR 1 2

Клас C: Метаботропні глутаматні рецептори / феромони

Смак, солодке	TAS1R 1 2 3 VN2R
Other	CASR ГАМК-рецептори 1 2 Глутаматні рецептори Метаботропні глутаматні 1 2 3 4 5 6 7 8 GPRC6A GPR 156 158 179 RAIG 1 2 3 4