SMC3 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SMC3, BAM, BMH, CDLS3, CSPG6, HCAP, SMC3L1, structural maintenance of chromosomes 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606062 MGI: 1339795 HomoloGene: 3974 GeneCards: SMC3 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Cornelia de Lange syndrome[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • microtubule motor activity • nucleotide binding • mediator complex binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • ATP binding • dynein complex binding • beta-tubulin binding • GO:0032403 protein-containing complex binding |
---|
Клітинна компонента | • гіалоплазма • GO:0034991 meiotic cohesin complex • nuclear matrix • хромосома • нуклеоплазма • lateral element • Хроматин • центромера • клітинне ядро • базальна мембрана • внутрішньоклітинний • GO:0000798 cohesin complex • mitotic spindle pole |
---|
Біологічний процес | • regulation of DNA replication • GO:0051312, GO:0007083 chromosome organization • cellular response to DNA damage stimulus • stem cell population maintenance • поділ клітини • negative regulation of DNA endoreduplication • клітинний цикл • GO:0100026 Репарація ДНК • sister chromatid cohesion • GO:0007067 мітоз • GO:0007126 мейоз • regulation of mitotic spindle assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 10: 110.57 – 110.61 Mb | Хр. 19: 53.59 – 53.63 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SMC3 (англ. Structural maintenance of chromosomes 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 217 амінокислот, а молекулярна маса — 141 542[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MYIKQVIIQG | | FRSYRDQTIV | | DPFSSKHNVI | | VGRNGSGKSN | | FFYAIQFVLS |
DEFSHLRPEQ | | RLALLHEGTG | | PRVISAFVEI | | IFDNSDNRLP | | IDKEEVSLRR |
VIGAKKDQYF | | LDKKMVTKND | | VMNLLESAGF | | SRSNPYYIVK | | QGKINQMATA |
PDSQRLKLLR | | EVAGTRVYDE | | RKEESISLMK | | ETEGKREKIN | | ELLKYIEERL |
HTLEEEKEEL | | AQYQKWDKMR | | RALEYTIYNQ | | ELNETRAKLD | | ELSAKRETSG |
EKSRQLRDAQ | | QDARDKMEDI | | ERQVRELKTK | | ISAMKEEKEQ | | LSAERQEQIK |
QRTKLELKAK | | DLQDELAGNS | | EQRKRLLKER | | QKLLEKIEEK | | QKELAETEPK |
FNSVKEKEER | | GIARLAQATQ | | ERTDLYAKQG | | RGSQFTSKEE | | RDKWIKKELK |
SLDQAINDKK | | RQIAAIHKDL | | EDTEANKEKN | | LEQYNKLDQD | | LNEVKARVEE |
LDRKYYEVKN | | KKDELQSERN | | YLWREENAEQ | | QALAAKREDL | | EKKQQLLRAA |
TGKAILNGID | | SINKVLDHFR | | RKGINQHVQN | | GYHGIVMNNF | | ECEPAFYTCV |
EVTAGNRLFY | | HIVDSDEVST | | KILMEFNKMN | | LPGEVTFLPL | | NKLDVRDTAY |
PETNDAIPMI | | SKLRYNPRFD | | KAFKHVFGKT | | LICRSMEVST | | QLARAFTMDC |
ITLEGDQVSH | | RGALTGGYYD | | TRKSRLELQK | | DVRKAEEELG | | ELEAKLNENL |
RRNIERINNE | | IDQLMNQMQQ | | IETQQRKFKA | | SRDSILSEMK | | MLKEKRQQSE |
KTFMPKQRSL | | QSLEASLHAM | | ESTRESLKAE | | LGTDLLSQLS | | LEDQKRVDAL |
NDEIRQLQQE | | NRQLLNERIK | | LEGIITRVET | | YLNENLRKRL | | DQVEQELNEL |
RETEGGTVLT | | ATTSELEAIN | | KRVKDTMARS | | EDLDNSIDKT | | EAGIKELQKS |
MERWKNMEKE | | HMDAINHDTK | | ELEKMTNRQG | | MLLKKKEECM | | KKIRELGSLP |
QEAFEKYQTL | | SLKQLFRKLE | | QCNTELKKYS | | HVNKKALDQF | | VNFSEQKEKL |
IKRQEELDRG | | YKSIMELMNV | | LELRKYEAIQ | | LTFKQVSKNF | | SEVFQKLVPG |
GKATLVMKKG | | DVEGSQSQDE | | GEGSGESERG | | SGSQSSVPSV | | DQFTGVGIRV |
SFTGKQGEMR | | EMQQLSGGQK | | SLVALALIFA | | IQKCDPAPFY | | LFDEIDQALD |
AQHRKAVSDM | | IMELAVHAQF | | ITTTFRPELL | | ESADKFYGVK | | FRNKVSHIDV |
ITAEMAKDFV | | EDDTTHG |
Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, мітоз, мейоз. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах.
Література
- Shimizu K., Shirataki H., Honda T., Minami S., Takai Y. (1998). Complex formation of SMAP/KAP3, a KIF3A/B ATPase motor-associated protein, with a human chromosome-associated polypeptide. J. Biol. Chem. 273: 6591—6594. PMID 9506951 DOI:10.1074/jbc.273.12.6591
- Sumara I., Vorlaufer E., Gieffers C., Peters B.H., Peters J.-M. (2000). Characterization of vertebrate cohesin complexes and their regulation in prophase. J. Cell Biol. 151: 749—762. PMID 11076961 DOI:10.1083/jcb.151.4.749
- Patel C.A., Ghiselli G. (2005). Hinderin, a five-domains protein including coiled-coil motifs that binds to SMC3. BMC Cell Biol. 6: 3—3. PMID 15656913 DOI:10.1186/1471-2121-6-3
- Rankin S., Ayad N.G., Kirschner M.W. (2005). Sororin, a substrate of the anaphase-promoting complex, is required for sister chromatid cohesion in vertebrates. Mol. Cell. 18: 185—200. PMID 15837422 DOI:10.1016/j.molcel.2005.03.017
- Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
- Terret M.E., Sherwood R., Rahman S., Qin J., Jallepalli P.V. (2009). Cohesin acetylation speeds the replication fork. Nature. 462: 231—234. PMID 19907496 DOI:10.1038/nature08550
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SMC3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2468 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9UQE7 (англ.) . Архів оригіналу за 19 липня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |