SLMAP

SLMAP
Ідентифікатори
Символи SLMAP, SLAP, sarcolemma associated protein
Зовнішні ІД OMIM: 602701 MGI: 1933549 HomoloGene: 31428 GeneCards: SLMAP
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• GO:0001948, GO:0016582 protein binding

Клітинна компонента

• smooth endoplasmic reticulum
• цитоплазма
• integral component of membrane
• Сарколема
• клітинна мембрана
• integral component of plasma membrane
• цитоскелет
• мембрана
• центр організації мікротрубочок

Біологічний процес

• м'язове скорочення
• protein localization to plasma membrane
• regulation of membrane depolarization during cardiac muscle cell action potential
• regulation of sodium ion transmembrane transport
• regulation of voltage-gated sodium channel activity

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7871
83997
Ensembl
ENSG00000163681
ENSMUSG00000021870
UniProt
Q14BN4
Q3URD3
RefSeq (мРНК)
NM_001304420
NM_001304421
NM_001304422
NM_001304423
NM_001311178
NM_001311179
NM_007159
NM_001377538
NM_001377539
NM_001377540
NM_001377541
NM_001377542
NM_001377545
NM_001377549
NM_001377551
NM_001377552
NM_001377555
NM_001377557
NM_001377559
NM_001377562
NM_001377921
NM_001377922
NM_001377923
NM_001377924
NM_001377925
NM_001377926
NM_001377927
NM_001377928
NM_032008
NM_001310445
NM_001347494
RefSeq (білок)
NP_001291349
NP_001291350
NP_001291351
NP_001291352
NP_001298107
NP_001298108
NP_009090
NP_001297374
NP_001334423
NP_114397
Локус (UCSC) Хр. 3: 57.76 – 57.93 Mb Хр. 14: 26.41 – 26.53 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SLMAP (англ. Sarcolemma associated protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 828 амінокислот, а молекулярна маса — 95 198[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MPSALAIFTCRPNSHPFQERHVYLDEPIKIGRSVARCRPAQNNATFDCKV
LSRNHALVWFDHKTGKFYLQDTKSSNGTFINSQRLSRGSEESPPCEILSG
DIIQFGVDVTENTRKVTHGCIVSTIKLFLPDGMEARLRSDVIHAPLPSPV
DKVAANTPSMYSQELFQLSQYLQEALHREQMLEQKLATLQRLLAITQEAS
DTSWQALIDEDRLLSRLEVMGNQLQACSKNQTEDSLRKELIALQEDKHNY
ETTAKESLRRVLQEKIEVVRKLSEVERSLSNTEDECTHLKEMNERTQEEL
RELANKYNGAVNEIKDLSDKLKVAEGKQEEIQQKGQAEKKELQHKIDEME
EKEQELQAKIEALQADNDFTNERLTALQVRLEHLQEKTLKECSSLEHLLS
KSGGDCTFIHQFIECQKKLIVEGHLTKAVEETKLSKENQTRAKESDFSDT
LSPSKEKSSDDTTDAQMDEQDLNEPLAKVSLLKDDLQGAQSEIEAKQEIQ
HLRKELIEAQELARTSKQKCFELQALLEEERKAYRNQVEESTKQIQVLQA
QLQRLHIDTENLREEKDSEITSTRDELLSARDEILLLHQAAAKVASERDT
DIASLQEELKKVRAELERWRKAASEYEKEITSLQNSFQLRCQQCEDQQRE
EATRLQGELEKLRKEWNALETECHSLKRENVLLSSELQRQEKELHNSQKQ
SLELTSDLSILQMSRKELENQVGSLKEQHLRDSADLKTLLSKAENQAKDV
QKEYEKTQTVLSELKLKFEMTEQEKQSITDELKQCKNNLKLLREKGNNKP
WPWMPMLAALVAVTAIVLYVPGLARASP

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SLMAP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16643 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
  5. ↑ UniProt, Q14BN4 (англ.) . Архів оригіналу за 10 квітня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 3
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.