SLIT3 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SLIT3, MEGF5, SLIL2, SLIT1, Slit-3, slit2, slit guidance ligand 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603745 MGI: 1315202 HomoloGene: 2303 GeneCards: SLIT3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • Roundabout binding • calcium ion binding • heparin binding |
---|
Клітинна компонента | • extracellular region • мітохондрія • міжклітинний простір |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of chemokine-mediated signaling pathway • chemorepulsion involved in embryonic olfactory bulb interneuron precursor migration • диференціація клітин • negative chemotaxis • Roundabout signaling pathway • negative regulation of gene expression • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • cellular response to hormone stimulus • negative regulation of cell growth • response to cortisol • apoptotic process involved in luteolysis • animal organ morphogenesis • axon extension involved in axon guidance • negative regulation of cell population proliferation • axon guidance • aortic valve morphogenesis • atrioventricular valve morphogenesis • ventricular septum morphogenesis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 168.66 – 169.3 Mb | Хр. 11: 35.01 – 35.6 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SLIT3 (англ. Slit guidance ligand 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 523 амінокислот, а молекулярна маса — 167 713[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAPGWAGVGA | | AVRARLALAL | | ALASVLSGPP | | AVACPTKCTC | | SAASVDCHGL |
GLRAVPRGIP | | RNAERLDLDR | | NNITRITKMD | | FAGLKNLRVL | | HLEDNQVSVI |
ERGAFQDLKQ | | LERLRLNKNK | | LQVLPELLFQ | | STPKLTRLDL | | SENQIQGIPR |
KAFRGITDVK | | NLQLDNNHIS | | CIEDGAFRAL | | RDLEILTLNN | | NNISRILVTS |
FNHMPKIRTL | | RLHSNHLYCD | | CHLAWLSDWL | | RQRRTVGQFT | | LCMAPVHLRG |
FNVADVQKKE | | YVCPAPHSEP | | PSCNANSISC | | PSPCTCSNNI | | VDCRGKGLME |
IPANLPEGIV | | EIRLEQNSIK | | AIPAGAFTQY | | KKLKRIDISK | | NQISDIAPDA |
FQGLKSLTSL | | VLYGNKITEI | | VKGLFDGLVS | | LQLLLLNANK | | INCLRVNTFQ |
DLQNLNLLSL | | YDNKLQTISK | | GLFAPLQSIQ | | TLHLAQNPFV | | CDCHLKWLAD |
YLQDNPIETS | | GARCSSPRRL | | ANKRISQIKS | | KKFRCSGSED | | YRSRFSSECF |
MDLVCPEKCR | | CEGTIVDCSN | | QKLVRIPSHL | | PEYVTDLRLN | | DNEVSVLEAT |
GIFKKLPNLR | | KINLSNNKIK | | EVREGAFDGA | | ASVQELMLTG | | NQLETVHGRV |
FRGLSGLKTL | | MLRSNLIGCV | | SNDTFAGLSS | | VRLLSLYDNR | | ITTITPGAFT |
TLVSLSTINL | | LSNPFNCNCH | | LAWLGKWLRK | | RRIVSGNPRC | | QKPFFLKEIP |
IQDVAIQDFT | | CDGNEESSCQ | | LSPRCPEQCT | | CMETVVRCSN | | KGLRALPRGM |
PKDVTELYLE | | GNHLTAVPRE | | LSALRHLTLI | | DLSNNSISML | | TNYTFSNMSH |
LSTLILSYNR | | LRCIPVHAFN | | GLRSLRVLTL | | HGNDISSVPE | | GSFNDLTSLS |
HLALGTNPLH | | CDCSLRWLSE | | WVKAGYKEPG | | IARCSSPEPM | | ADRLLLTTPT |
HRFQCKGPVD | | INIVAKCNAC | | LSSPCKNNGT | | CTQDPVELYR | | CACPYSYKGK |
DCTVPINTCI | | QNPCQHGGTC | | HLSDSHKDGF | | SCSCPLGFEG | | QRCEINPDDC |
EDNDCENNAT | | CVDGINNYVC | | ICPPNYTGEL | | CDEVIDHCVP | | ELNLCQHEAK |
CIPLDKGFSC | | ECVPGYSGKL | | CETDNDDCVA | | HKCRHGAQCV | | DTINGYTCTC |
PQGFSGPFCE | | HPPPMVLLQT | | SPCDQYECQN | | GAQCIVVQQE | | PTCRCPPGFA |
GPRCEKLITV | | NFVGKDSYVE | | LASAKVRPQA | | NISLQVATDK | | DNGILLYKGD |
NDPLALELYQ | | GHVRLVYDSL | | SSPPTTVYSV | | ETVNDGQFHS | | VELVTLNQTL |
NLVVDKGTPK | | SLGKLQKQPA | | VGINSPLYLG | | GIPTSTGLSA | | LRQGTDRPLG |
GFHGCIHEVR | | INNELQDFKA | | LPPQSLGVSP | | GCKSCTVCKH | | GLCRSVEKDS |
VVCECRPGWT | | GPLCDQEARD | | PCLGHRCHHG | | KCVATGTSYM | | CKCAEGYGGD |
LCDNKNDSAN | | ACSAFKCHHG | | QCHISDQGEP | | YCLCQPGFSG | | EHCQQENPCL |
GQVVREVIRR | | QKGYASCATA | | SKVPIMECRG | | GCGPQCCQPT | | RSKRRKYVFQ |
CTDGSSFVEE | | VERHLECGCL | | ACS |
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Секретований назовні.
Література
- Itoh A., Miyabayashi T., Ohno M., Sakano S. (1998). Cloning and expressions of three mammalian homologues of Drosophila slit suggest possible roles for Slit in the formation and maintenance of the nervous system. Brain Res. Mol. Brain Res. 62: 175—186. PMID 9813312 DOI:10.1016/S0169-328X(98)00224-1
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11087 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O75094 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |