SFTPD

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1B08, 1M7L, 1PW9, 1PWB, 2GGU, 2GGX, 2ORJ, 2ORK, 2OS9, 2RIA, 2RIB, 2RIC, 2RID, 2RIE, 3DBZ, 3G81, 3G83, 3G84, 3IKN, 3IKP, 3IKQ, 3IKR, 4E52, 4M17, 4M18

Ідентифікатори

Символи

SFTPD, COLEC7, PSP-D, SFTP4, SP-D, surfactant protein D

Зовнішні ІД

OMIM: 178635 MGI: 109515 HomoloGene: 2272 GeneCards: SFTPD

Пов'язані генетичні захворювання

ревматоїдний артрит, хронічне обструктивне захворювання легень^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • carbohydrate binding • identical protein binding • lipopolysaccharide binding • monosaccharide binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • колаген • endoplasmic reticulum membrane • clathrin-coated endocytic vesicle • endocytic vesicle • extracellular region • лізосома • міжклітинний простір • multivesicular body • rough endoplasmic reticulum
Біологічний процес	• surfactant homeostasis • positive regulation of phagocytosis • процес імунної системи • рецептор-опосередкований ендоцитоз • respiratory gaseous exchange by respiratory system • reactive oxygen species metabolic process • GO:0032657 regulation of cytokine production • negative regulation of T cell proliferation • macrophage chemotaxis • defense response to bacterium • regulation of immune response • lung alveolus development • вроджений імунітет • toll-like receptor signaling pathway • induction of bacterial agglutination • regulation of adhesion of symbiont to host epithelial cell • GO:0007571 розвойовий процес
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6441


20390

Ensembl


ENSG00000133661


ENSMUSG00000021795

UniProt


P35247


P50404

RefSeq (мРНК)


NM_003019


NM_009160

RefSeq (білок)


NP_003010


NP_033186

Локус (UCSC)

Хр. 10: 79.94 – 79.98 Mb

Хр. 14: 40.89 – 40.91 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SFTPD (англ. Surfactant protein D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 375 амінокислот, а молекулярна маса — 37 728^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLLFLLSALV	LLTQPLGYLE	AEMKTYSHRT	MPSACTLVMC	SSVESGLPGR
DGRDGREGPR	GEKGDPGLPG	AAGQAGMPGQ	AGPVGPKGDN	GSVGEPGPKG
DTGPSGPPGP	PGVPGPAGRE	GPLGKQGNIG	PQGKPGPKGE	AGPKGEVGAP
GMQGSAGARG	LAGPKGERGV	PGERGVPGNT	GAAGSAGAMG	PQGSPGARGP
PGLKGDKGIP	GDKGAKGESG	LPDVASLRQQ	VEALQGQVQH	LQAAFSQYKK
VELFPNGQSV	GEKIFKTAGF	VKPFTEAQLL	CTQAGGQLAS	PRSAAENAAL
QQLVVAKNEA	AFLSMTDSKT	EGKFTYPTGE	SLVYSNWAPG	EPNDDGGSED
CVEIFTNGKW	NDRACGEKRL	VVCEF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, лектинами. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

Lu J., Willis A.C., Reid K.B.M. (1992). Purification, characterization and cDNA cloning of human lung surfactant protein D. Biochem. J. 284: 795—802. PMID 1339284 DOI:10.1042/bj2840795
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hakansson K., Lim N.K., Hoppe H.-J., Reid K.B.M. (1999). Crystal structure of the trimeric alpha-helical coiled-coil and the three lectin domains of human lung surfactant protein D. Structure. 7: 255—264. PMID 10368295 DOI:10.1016/S0969-2126(99)80036-7
Crouch E., Rust K., Veile R., Donis-Keller H., Grosso L. (1993). Genomic organization of human surfactant protein D (SP-D). SP-D is encoded on chromosome 10q22.2-23.1. J. Biol. Chem. 268: 2976—2983. PMID 8428971
Crouch E., Persson A., Chang D. (1993). Accumulation of surfactant protein D in human pulmonary alveolar proteinosis. Am. J. Pathol. 142: 241—248. PMID 8424457

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SFTPD переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10803 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P35247 (англ.) . Архів оригіналу за 5 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.