SEMA4C |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SEMA4C, M-SEMA-F, SEMACL1, SEMAF, SEMAI, semaphorin 4C |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604462 MGI: 109252 HomoloGene: 23047 GeneCards: SEMA4C |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • neuropilin binding • semaphorin receptor binding • chemorepellent activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • postsynaptic membrane • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • клітинна мембрана • синапс • synaptic vesicle membrane • міжклітинні контакти • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • міжклітинний простір • мембрана • integral component of plasma membrane |
---|
Біологічний процес | • диференціація клітин • cell migration in hindbrain • cerebellum development • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • muscle cell differentiation • neural tube closure • positive regulation of stress-activated MAPK cascade • semaphorin-plexin signaling pathway • negative chemotaxis • neural crest cell migration • positive regulation of cell migration • negative regulation of axon extension involved in axon guidance |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001126047 NM_001304329 NM_001304330 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001119519 NP_001291258 NP_001291259 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 96.86 – 96.87 Mb | Хр. 1: 36.59 – 36.6 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SEMA4C (англ. Semaphorin 4C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 833 амінокислот, а молекулярна маса — 92 623[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAPHWAVWLL | | AARLWGLGIG | | AEVWWNLVPR | | KTVSSGELAT | | VVRRFSQTGI |
QDFLTLTLTE | | PTGLLYVGAR | | EALFAFSMEA | | LELQGAISWE | | APVEKKTECI |
QKGKNNQTEC | | FNFIRFLQPY | | NASHLYVCGT | | YAFQPKCTYV | | NMLTFTLEHG |
EFEDGKGKCP | | YDPAKGHAGL | | LVDGELYSAT | | LNNFLGTEPI | | ILRNMGPHHS |
MKTEYLAFWL | | NEPHFVGSAY | | VPESVGSFTG | | DDDKVYFFFR | | ERAVESDCYA |
EQVVARVARV | | CKGDMGGART | | LQRKWTTFLK | | ARLACSAPNW | | QLYFNQLQAM |
HTLQDTSWHN | | TTFFGVFQAQ | | WGDMYLSAIC | | EYQLEEIQRV | | FEGPYKEYHE |
EAQKWDRYTD | | PVPSPRPGSC | | INNWHRRHGY | | TSSLELPDNI | | LNFVKKHPLM |
EEQVGPRWSR | | PLLVKKGTNF | | THLVADRVTG | | LDGATYTVLF | | IGTGDGWLLK |
AVSLGPWVHL | | IEELQLFDQE | | PMRSLVLSQS | | KKLLFAGSRS | | QLVQLPVADC |
MKYRSCADCV | | LARDPYCAWS | | VNTSRCVAVG | | GHSGSLLIQH | | VMTSDTSGIC |
NLRGSKKVRP | | TPKNITVVAG | | TDLVLPCHLS | | SNLAHARWTF | | GGRDLPAEQP |
GSFLYDARLQ | | ALVVMAAQPR | | HAGAYHCFSE | | EQGARLAAEG | | YLVAVVAGPS |
VTLEARAPLE | | NLGLVWLAVV | | ALGAVCLVLL | | LLVLSLRRRL | | REELEKGAKA |
TERTLVYPLE | | LPKEPTSPPF | | RPCPEPDEKL | | WDPVGYYYSD | | GSLKIVPGHA |
RCQPGGGPPS | | PPPGIPGQPL | | PSPTRLHLGG | | GRNSNANGYV | | RLQLGGEDRG |
GLGHPLPELA | | DELRRKLQQR | | QPLPDSNPEE | | SSV |
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як диференціація, нейрогенез. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10731 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9C0C4 (англ.) . Архів оригіналу за 5 травня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |