SEL1L

Ідентифікатори

Символи

SEL1L, PRO1063, SEL1-LIKE, SEL1L1, SEL1L ERAD E3 ligase adaptor subunit, ERAD E3 ligase adaptor subunit, Hrd3, SEL1L adaptor subunit of ERAD E3 ubiquitin ligase

Зовнішні ІД

OMIM: 602329 MGI: 1329016 HomoloGene: 31286 GeneCards: SEL1L

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • Hrd1p ubiquitin ligase complex • endoplasmic reticulum membrane • Derlin-1 retrotranslocation complex • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • endoplasmic reticulum quality control compartment • Hrd1p ubiquitin ligase ERAD-L complex
Біологічний процес	• Сигнальний шлях Notch • protein stabilization • retrograde protein transport, ER to cytosol • ubiquitin-dependent ERAD pathway • response to endoplasmic reticulum stress • endoplasmic reticulum mannose trimming • triglyceride metabolic process • protein secretion • ERAD pathway • трансмембранний транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6400


20338

Ensembl


ENSG00000071537


ENSMUSG00000020964

UniProt


Q9UBV2


Q9Z2G6

RefSeq (мРНК)


NM_001244984 NM_005065


NM_001039089 NM_011344

RefSeq (білок)


NP_001231913 NP_005056


NP_001034178 NP_035474

Локус (UCSC)

Хр. 14: 81.47 – 81.53 Mb

Хр. 12: 91.77 – 91.82 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SEL1L (англ. SEL1L ERAD E3 ligase adaptor subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 794 амінокислот, а молекулярна маса — 88 755^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRVRIGLTLL	LCAVLLSLAS	ASSDEEGSQD	ESLDSKTTLT	SDESVKDHTT
AGRVVAGQIF	LDSEESELES	SIQEEEDSLK	SQEGESVTED	ISFLESPNPE
NKDYEEPKKV	RKPALTAIEG	TAHGEPCHFP	FLFLDKEYDE	CTSDGREDGR
LWCATTYDYK	ADEKWGFCET	EEEAAKRRQM	QEAEMMYQTG	MKILNGSNKK
SQKREAYRYL	QKAASMNHTK	ALERVSYALL	FGDYLPQNIQ	AAREMFEKLT
EEGSPKGQTA	LGFLYASGLG	VNSSQAKALV	YYTFGALGGN	LIAHMVLGYR
YWAGIGVLQS	CESALTHYRL	VANHVASDIS	LTGGSVVQRI	RLPDEVENPG
MNSGMLEEDL	IQYYQFLAEK	GDVQAQVGLG	QLHLHGGRGV	EQNHQRAFDY
FNLAANAGNS	HAMAFLGKMY	SEGSDIVPQS	NETALHYFKK	AADMGNPVGQ
SGLGMAYLYG	RGVQVNYDLA	LKYFQKAAEQ	GWVDGQLQLG	SMYYNGIGVK
RDYKQALKYF	NLASQGGHIL	AFYNLAQMHA	SGTGVMRSCH	TAVELFKNVC
ERGRWSERLM	TAYNSYKDGD	YNAAVIQYLL	LAEQGYEVAQ	SNAAFILDQR
EASIVGENET	YPRALLHWNR	AASQGYTVAR	IKLGDYHFYG	FGTDVDYETA
FIHYRLASEQ	QHSAQAMFNL	GYMHEKGLGI	KQDIHLAKRF	YDMAAEASPD
AQVPVFLALC	KLGVVYFLQY	IRETNIRDMF	TQLDMDQLLG	PEWDLYLMTI
IALLLGTVIA	YRQRQHQDMP	APRPPGPRPA	PPQQEGPPEQ	QPPQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 DOI:10.1038/nbt827
Lilley B.N., Ploegh H.L. (2005). Multiprotein complexes that link dislocation, ubiquitination, and extraction of misfolded proteins from the endoplasmic reticulum membrane. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 14296—14301. PMID 16186509 DOI:10.1073/pnas.0505014102
Christianson J.C., Shaler T.A., Tyler R.E., Kopito R.R. (2008). OS-9 and GRP94 deliver mutant alpha1-antitrypsin to the Hrd1-SEL1L ubiquitin ligase complex for ERAD. Nat. Cell Biol. 10: 272—282. PMID 18264092 DOI:10.1038/ncb1689
Cormier J.H., Tamura T., Sunryd J.C., Hebert D.N. (2009). EDEM1 recognition and delivery of misfolded proteins to the SEL1L-containing ERAD complex. Mol. Cell. 34: 627—633. PMID 19524542 DOI:10.1016/j.molcel.2009.05.018
Hosokawa N., Wada I. (2016). Association of the SEL1L protein transmembrane domain with HRD1 ubiquitin ligase regulates ERAD-L. FEBS J. 283: 157—172. PMID 26471130 DOI:10.1111/febs.13564

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10717 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UBV2 (англ.) . Архів оригіналу за 13 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.