SEC24D |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук для людей: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3EFO, 3EG9 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SEC24D, CLCRP2, SEC24 homolog D, COPII coat complex component |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607186 MGI: 1916858 HomoloGene: 40986 GeneCards: SEC24D |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • SNARE binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • Golgi membrane • ендоплазматичний ретикулум • COPII vesicle coat • гіалоплазма • ER to Golgi transport vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle |
---|
Біологічний процес | • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I • in utero embryonic development • COPII vesicle coating • protein transport • intracellular protein transport • vesicle-mediated transport • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • COPII-coated vesicle cargo loading |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 4: 118.72 – 118.84 Mb | Хр. 3: 123.06 – 123.16 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SEC24D (англ. SEC24 homolog D, COPII coat complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 032 амінокислот, а молекулярна маса — 113 010[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSQQGYVATP | | PYSQPQPGIG | | LSPPHYGHYG | | DPSHTASPTG | | MMKPAGPLGA |
TATRGMLPPG | | PPPPGPHQFG | | QNGAHATGHP | | PQRFPGPPPV | | NNVASSHAPY |
QPSAQSSYPG | | PISTSSVTQL | | GSQLSAMQIN | | SYGSGMAPPS | | QGPPGPLSAT |
SLQTPPRPPQ | | PSILQPGSQV | | LPPPPTTLNG | | PGASPLPLPM | | YRPDGLSGPP |
PPNAQYQPPP | | LPGQTLGAGY | | PPQQANSGPQ | | MAGAQLSYPG | | GFPGGPAQMA |
GPPQPQKKLD | | PDSIPSPIQV | | IENDRASRGG | | QVYATNTRGQ | | IPPLVTTDCM |
IQDQGNASPR | | FIRCTTYCFP | | CTSDMAKQAQ | | IPLAAVIKPF | | ATIPSNESPL |
YLVNHGESGP | | VRCNRCKAYM | | CPFMQFIEGG | | RRYQCGFCNC | | VNDVPPFYFQ |
HLDHIGRRLD | | HYEKPELSLG | | SYEYVATLDY | | CRKSKPPNPP | | AFIFMIDVSY |
SNIKNGLVKL | | ICEELKTMLE | | KIPKEEQEET | | SAIRVGFITY | | NKVLHFFNVK |
SNLAQPQMMV | | VTDVGEVFVP | | LLDGFLVNYQ | | ESQSVIHNLL | | DQIPDMFADS |
NENETVFAPV | | IQAGMEALKA | | ADCPGKLFIF | | HSSLPTAEAP | | GKLKNRDDKK |
LVNTDKEKIL | | FQPQTNVYDS | | LAKDCVAHGC | | SVTLFLFPSQ | | YVDVASLGLV |
PQLTGGTLYK | | YNNFQMHLDR | | QQFLNDLRND | | IEKKIGFDAI | | MRVRTSTGFR |
ATDFFGGILM | | NNTTDVEMAA | | IDCDKAVTVE | | FKHDDKLSED | | SGALIQCAVL |
YTTISGQRRL | | RIHNLGLNCS | | SQLADLYKSC | | ETDALINFFA | | KSAFKAVLHQ |
PLKVIREILV | | NQTAHMLACY | | RKNCASPSAA | | SQLILPDSMK | | VLPVYMNCLL |
KNCVLLSRPE | | ISTDERAYQR | | QLVMTMGVAD | | SQLFFYPQLL | | PIHTLDVKST |
MLPAAVRCSE | | SRLSEEGIFL | | LANGLHMFLW | | LGVSSPPELI | | QGIFNVPSFA |
HINTDMTLLP | | EVGNPYSQQL | | RMIMGIIQQK | | RPYSMKLTIV | | KQREQPEMVF |
RQFLVEDKGL | | YGGSSYVDFL | | CCVHKEICQL | | LN |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах.
Література
- Tang B.L., Kausalya J., Low D.Y.H., Lock M.L., Hong W. (1999). A family of mammalian proteins homologous to yeast Sec24p. Biochem. Biophys. Res. Commun. 258: 679—684. PMID 10329445 DOI:10.1006/bbrc.1999.0574
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Mancias J.D., Goldberg J. (2007). The transport signal on Sec22 for packaging into COPII-coated vesicles is a conformational epitope. Mol. Cell. 26: 403—414. PMID 17499046 DOI:10.1016/j.molcel.2007.03.017
- Bonnon C., Wendeler M.W., Paccaud J.P., Hauri H.P. (2010). Selective export of human GPI-anchored proteins from the endoplasmic reticulum. J. Cell Sci. 123: 1705—1715. PMID 20427317 DOI:10.1242/jcs.062950
- Mancias J.D., Goldberg J. (2008). Structural basis of cargo membrane protein discrimination by the human COPII coat machinery. EMBO J. 27: 2918—2928. PMID 18843296 DOI:10.1038/emboj.2008.208
- Ma W., Goldberg J. (2016). TANGO1/cTAGE5 receptor as a polyvalent template for assembly of large COPII coats. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 113: 10061—10066. PMID 27551091 DOI:10.1073/pnas.1605916113
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10706 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O94855 (англ.) . Архів оригіналу за 24 жовтня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |