SEC23A |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2NUP, 2NUT, 2YRC, 2YRD, 3EFO, 3EG9, 3EGD, 3EGX | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SEC23A, CLSD, Sec23 homolog A, coat complex II component, hSec23A, Sec23 homolog A, COPII coat complex component |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610511 MGI: 1349635 HomoloGene: 4642 GeneCards: SEC23A |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
cranio–lenticulo–sutural dysplasia[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity |
---|
Клітинна компонента | • мембрана • Golgi membrane • perinuclear region of cytoplasm • COPII-coated ER to Golgi transport vesicle • ендоплазматичний ретикулум • extrinsic component of membrane • COPII vesicle coat • endoplasmic reticulum exit site • цитоплазма • endoplasmic reticulum membrane • гіалоплазма • ER to Golgi transport vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle |
---|
Біологічний процес | • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • COPII vesicle coating • protein transport • intracellular protein transport • vesicle-mediated transport • COPII-coated vesicle cargo loading • COPII-coated vesicle budding • regulation of COPII vesicle coating • Golgi organization • regulation of cell shape • macroautophagy • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • protein localization to plasma membrane |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 14: 39.03 – 39.11 Mb | Хр. 12: 59.01 – 59.06 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SEC23A (англ. Sec23 homolog A, coat complex II component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 765 амінокислот, а молекулярна маса — 86 161[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTTYLEFIQQ | | NEERDGVRFS | | WNVWPSSRLE | | ATRMVVPVAA | | LFTPLKERPD |
LPPIQYEPVL | | CSRTTCRAVL | | NPLCQVDYRA | | KLWACNFCYQ | | RNQFPPSYAG |
ISELNQPAEL | | LPQFSSIEYV | | VLRGPQMPLI | | FLYVVDTCME | | DEDLQALKES |
MQMSLSLLPP | | TALVGLITFG | | RMVQVHELGC | | EGISKSYVFR | | GTKDLSAKQL |
QEMLGLSKVP | | LTQATRGPQV | | QQPPPSNRFL | | QPVQKIDMNL | | TDLLGELQRD |
PWPVPQGKRP | | LRSSGVALSI | | AVGLLECTFP | | NTGARIMMFI | | GGPATQGPGM |
VVGDELKTPI | | RSWHDIDKDN | | AKYVKKGTKH | | FEALANRAAT | | TGHVIDIYAC |
ALDQTGLLEM | | KCCPNLTGGY | | MVMGDSFNTS | | LFKQTFQRVF | | TKDMHGQFKM |
GFGGTLEIKT | | SREIKISGAI | | GPCVSLNSKG | | PCVSENEIGT | | GGTCQWKICG |
LSPTTTLAIY | | FEVVNQHNAP | | IPQGGRGAIQ | | FVTQYQHSSG | | QRRIRVTTIA |
RNWADAQTQI | | QNIAASFDQE | | AAAILMARLA | | IYRAETEEGP | | DVLRWLDRQL |
IRLCQKFGEY | | HKDDPSSFRF | | SETFSLYPQF | | MFHLRRSSFL | | QVFNNSPDES |
SYYRHHFMRQ | | DLTQSLIMIQ | | PILYAYSFSG | | PPEPVLLDSS | | SILADRILLM |
DTFFQILIYH | | GETIAQWRKS | | GYQDMPEYEN | | FRHLLQAPVD | | DAQEILHSRF |
PMPRYIDTEH | | GGSQARFLLS | | KVNPSQTHNN | | MYAWGQESGA | | PILTDDVSLQ |
VFMDHLKKLA | | VSSAA |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Bhattacharyya D., Glick B.S. (2007). Two mammalian Sec16 homologues have nonredundant functions in endoplasmic reticulum (ER) export and transitional ER organization. Mol. Biol. Cell. 18: 839—849. PMID 17192411 DOI:10.1091/mbc.E06-08-0707
- Mancias J.D., Goldberg J. (2007). The transport signal on Sec22 for packaging into COPII-coated vesicles is a conformational epitope. Mol. Cell. 26: 403—414. PMID 17499046 DOI:10.1016/j.molcel.2007.03.017
- Mancias J.D., Goldberg J. (2008). Structural basis of cargo membrane protein discrimination by the human COPII coat machinery. EMBO J. 27: 2918—2928. PMID 18843296 DOI:10.1038/emboj.2008.208
- Ma W., Goldberg J. (2016). TANGO1/cTAGE5 receptor as a polyvalent template for assembly of large COPII coats. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 113: 10061—10066. PMID 27551091 DOI:10.1073/pnas.1605916113
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SEC23A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10701 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q15436 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |