SCG3 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

SCG3

Ідентифікатори

Символи

SCG3, SGIII, secretogranin III

Зовнішні ІД

OMIM: 611796 MGI: 103032 HomoloGene: 7526 GeneCards: SCG3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• RNA binding
Клітинна компонента	• extracellular region • secretory granule lumen • transport vesicle membrane • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • endoplasmic reticulum lumen • secretory granule membrane • transport vesicle
Біологічний процес	• platelet degranulation • посттрансляційна модифікація • protein localization to secretory granule
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


29106


20255

Ensembl


ENSG00000104112


ENSMUSG00000032181

UniProt


Q8WXD2


P47867

RefSeq (мРНК)


NM_013243 NM_001165257


NM_001164790 NM_009130

RefSeq (білок)


NP_001158729 NP_037375


NP_001158262 NP_033156

Локус (UCSC)

Хр. 15: 51.68 – 51.72 Mb

Хр. 9: 75.55 – 75.59 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SCG3 (англ. Secretogranin III) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 468 амінокислот, а молекулярна маса — 53 005^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGFLGTGTWI	LVLVLPIQAF	PKPGGSQDKS	LHNRELSAER	PLNEQIAEAE
EDKIKKTYPP	ENKPGQSNYS	FVDNLNLLKA	ITEKEKIEKE	RQSIRSSPLD
NKLNVEDVDS	TKNRKLIDDY	DSTKSGLDHK	FQDDPDGLHQ	LDGTPLTAED
IVHKIAARIY	EENDRAVFDK	IVSKLLNLGL	ITESQAHTLE	DEVAEVLQKL
ISKEANNYEE	DPNKPTSWTE	NQAGKIPEKV	TPMAAIQDGL	AKGENDETVS
NTLTLTNGLE	RRTKTYSEDN	FEELQYFPNF	YALLKSIDSE	KEAKEKETLI
TIMKTLIDFV	KMMVKYGTIS	PEEGVSYLEN	LDEMIALQTK	NKLEKNATDN
ISKLFPAPSE	KSHEETDSTK	EEAAKMEKEY	GSLKDSTKDD	NSNPGGKTDE
PKGKTEAYLE	AIRKNIEWLK	KHDKKGNKED	YDLSKMRDFI	NKQADAYVEK
GILDKEEAEA	IKRIYSSL

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Halim A., Ruetschi U., Larson G., Nilsson J. (2013). LC-MS/MS characterization of O-glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins. J. Proteome Res. 12: 573—584. PMID 23234360 DOI:10.1021/pr300963h

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13707 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8WXD2 (англ.) . Архів оригіналу за 10 квітня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.