RIPK1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4ITH, 4ITI, 4ITJ, 4NEU, 5HX6 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | RIPK1, RIP, RIP1, RIP-1, receptor interacting serine/threonine kinase 1, IMD57, AIEFL |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603453 MGI: 108212 HomoloGene: 2820 GeneCards: RIPK1 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
Viroporin 3a[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • transferase activity • protein kinase activity • nucleotide binding • death domain binding • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • ATP binding • ubiquitin protein ligase binding • signal transducer activity • GO:0032403 protein-containing complex binding • death receptor binding • JUN kinase kinase kinase activity |
---|
Клітинна компонента | • мембрана • receptor complex • клітинна мембрана • мітохондрія • death-inducing signaling complex • membrane raft • цитоплазма • гіалоплазма • endosome membrane • ripoptosome • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • T cell apoptotic process • positive regulation of protein phosphorylation • amyloid fibril formation • positive regulation of cell death • фосфорилювання • regulation of ATP:ADP antiporter activity • peptidyl-serine autophosphorylation • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • positive regulation of macrophage differentiation • cellular response to tumor necrosis factor • cellular response to growth factor stimulus • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway • positive regulation of programmed cell death • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • positive regulation of JNK cascade • GO:1904489 regulation of reactive oxygen species metabolic process • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • response to tumor necrosis factor • positive regulation of necroptotic process • protein phosphorylation • positive regulation of reactive oxygen species metabolic process • death-inducing signaling complex assembly • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • necroptotic signaling pathway • positive regulation of interleukin-8 production • positive regulation of tumor necrosis factor production • positive regulation of apoptotic process • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway • protein autophosphorylation • regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors • GO:0060554, GO:0060555 Некроптоз • positive regulation of phosphorylation • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • protein homooligomerization • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • ripoptosome assembly • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of MAPK cascade • positive regulation of hydrogen peroxide-induced cell death • apoptotic signaling pathway • GO:0097285 апоптоз • GO:0010703, GO:0010702 запрограмована клітинна смерть • extrinsic apoptotic signaling pathway • positive regulation of necrotic cell death • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors • protein deubiquitination • ripoptosome assembly involved in necroptotic process • MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway • toll-like receptor 3 signaling pathway • GO:0022415 viral process • protein heterooligomerization • MAPK cascade • negative regulation of cardiac muscle cell proliferation • cellular response to hydrogen peroxide • programmed necrotic cell death • positive regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • positive regulation of production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA • GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_003804 NM_001317061 NM_001354930 NM_001354931 NM_001354932
| NM_001354933 NM_001354934 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001303990 NP_003795 NP_001341859 NP_001341860 NP_001341861
| NP_001341862 NP_001341863 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 3.06 – 3.12 Mb | Хр. 13: 34.19 – 34.22 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RIPK1 (англ. Receptor interacting serine/threonine kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 671 амінокислот, а молекулярна маса — 75 931[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MQPDMSLNVI | | KMKSSDFLES | | AELDSGGFGK | | VSLCFHRTQG | | LMIMKTVYKG |
PNCIEHNEAL | | LEEAKMMNRL | | RHSRVVKLLG | | VIIEEGKYSL | | VMEYMEKGNL |
MHVLKAEMST | | PLSVKGRIIL | | EIIEGMCYLH | | GKGVIHKDLK | | PENILVDNDF |
HIKIADLGLA | | SFKMWSKLNN | | EEHNELREVD | | GTAKKNGGTL | | YYMAPEHLND |
VNAKPTEKSD | | VYSFAVVLWA | | IFANKEPYEN | | AICEQQLIMC | | IKSGNRPDVD |
DITEYCPREI | | ISLMKLCWEA | | NPEARPTFPG | | IEEKFRPFYL | | SQLEESVEED |
VKSLKKEYSN | | ENAVVKRMQS | | LQLDCVAVPS | | SRSNSATEQP | | GSLHSSQGLG |
MGPVEESWFA | | PSLEHPQEEN | | EPSLQSKLQD | | EANYHLYGSR | | MDRQTKQQPR |
QNVAYNREEE | | RRRRVSHDPF | | AQQRPYENFQ | | NTEGKGTAYS | | SAASHGNAVH |
QPSGLTSQPQ | | VLYQNNGLYS | | SHGFGTRPLD | | PGTAGPRVWY | | RPIPSHMPSL |
HNIPVPETNY | | LGNTPTMPFS | | SLPPTDESIK | | YTIYNSTGIQ | | IGAYNYMEIG |
GTSSSLLDST | | NTNFKEEPAA | | KYQAIFDNTT | | SLTDKHLDPI | | RENLGKHWKN |
CARKLGFTQS | | QIDEIDHDYE | | RDGLKEKVYQ | | MLQKWVMREG | | IKGATVGKLA |
QALHQCSRID | | LLSSLIYVSQ | | N |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.
Література
- Hsu H., Huang J., Shu H.-B., Baichwal V.R., Goeddel D.V. (1996). TNF-dependent recruitment of the protein kinase RIP to the TNF receptor-1 signaling complex. Immunity. 4: 387—396. PMID 8612133 DOI:10.1016/S1074-7613(00)80252-6
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Stanger B.Z., Leder P., Lee T.-H., Kim E., Seed B. (1995). RIP: a novel protein containing a death domain that interacts with Fas/APO-1 (CD95) in yeast and causes cell death. Cell. 81: 513—523. PMID 7538908 DOI:10.1016/0092-8674(95)90072-1
- Lin Y., Devin A., Rodriguez Y., Liu Z.-G. (1999). Cleavage of the death domain kinase RIP by caspase-8 prompts TNF-induced apoptosis. Genes Dev. 13: 2514—2526. PMID 10521396 DOI:10.1101/gad.13.19.2514
- Sanz L., Sanchez P., Lallena M.-J., Diaz-Meco M.T., Moscat J. (1999). The interaction of p62 with RIP links the atypical PKCs to NF-kappaB activation. EMBO J. 18: 3044—3053. PMID 10356400 DOI:10.1093/emboj/18.11.3044
- Chen D., Li X., Zhai Z., Shu H.-B. (2002). A novel zinc finger protein interacts with receptor-interacting protein (RIP) and inhibits tumor necrosis factor (TNF)- and IL1-induced NF-kappa B activation. J. Biol. Chem. 277: 15985—15991. PMID 11854271 DOI:10.1074/jbc.M108675200
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Receptor interacting serine/threonine kinase 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10019 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q13546 (англ.) . Архів оригіналу за 13 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |