RHOBTB3

Ідентифікатори

Символи

RHOBTB3, Rho related BTB domain containing 3

Зовнішні ІД

OMIM: 607353 MGI: 1920546 HomoloGene: 8932 GeneCards: RHOBTB3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • ATP binding • ATPase activity • GO:0006184 GTPase activity • GTP binding • protein kinase binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • комплекс Ґольджі • екзосома • гіалоплазма • trans-Golgi network membrane • клітинна мембрана • cell cortex • cell projection
Біологічний процес	• retrograde transport, endosome to Golgi • vesicle-mediated transport • male gonad development • GO:0015915 транспорт • actin filament organization • establishment or maintenance of cell polarity • Rho protein signal transduction • regulation of cell shape • actin cytoskeleton organization • regulation of actin cytoskeleton organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


22836


73296

Ensembl


ENSG00000164292


ENSMUSG00000021589

UniProt


O94955


Q9CTN4

RefSeq (мРНК)


NM_014899


NM_028493

RefSeq (білок)


NP_055714


NP_082769

Локус (UCSC)

Хр. 5: 95.71 – 95.82 Mb

Хр. 13: 76.02 – 76.09 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RHOBTB3 (англ. Rho related BTB domain containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 611 амінокислот, а молекулярна маса — 69 413^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSIHIVALGN	EGDTFHQDNR	PSGLIRTYLG	RSPLVSGDES	SLLLNAASTV
ARPVFTEYQA	SAFGNVKLVV	HDCPVWDIFD	SDWYTSRNLI	GGADIIVIKY
NVNDKFSFHE	VKDNYIPVIK	RALNSVPVII	AAVGTRQNEE	LPCTCPLCTS
DRGSCVSTTE	GIQLAKELGA	TYLELHSLDD	FYIGKYFGGV	LEYFMIQALN
QKTSEKMKKR	KMSNSFHGIR	PPQLEQPEKM	PVLKAEASHY	NSDLNNLLFC
CQCVDVVFYN	PNLKKVVEAH	KIVLCAVSHV	FMLLFNVKSP	TDIQDSSIIR
TTQDLFAINR	DTAFPGASHE	SSGNPPLRVI	VKDALFCSCL	SDILRFIYSG
AFQWEELEED	IRKKLKDSGD	VSNVIEKVKC	ILKTPGKINC	LRNCKTYQAR
KPLWFYNTSL	KFFLNKPMLA	DVVFEIQGTT	VPAHRAILVA	RCEVMAAMFN
GNYMEAKSVL	IPVYGVSKET	FLSFLEYLYT	DSCCPAGIFQ	AMCLLICAEM
YQVSRLQHIC	ELFIITQLQS	MPSRELASMN	LDIVDLLKKA	KFHHSDCLST
WLLHFIATNY	LIFSQKPEFQ	DLSVEERSFV	EKHRWPSNMY	LKQLAEYRKY
IHSRKCRCLV	M

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у апараті гольджі.

Література

Ramos S., Khademi F., Somesh B.P., Rivero F. (2002). Genomic organization and expression profile of the small GTPases of the RhoBTB family in human and mouse. Gene. 298: 147—157. PMID 12426103 DOI:10.1016/S0378-1119(02)00980-0
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Espinosa E.J., Calero M., Sridevi K., Pfeffer S.R. (2009). RhoBTB3: a Rho GTPase-family ATPase required for endosome to Golgi transport. Cell. 137: 938—948. PMID 19490898 DOI:10.1016/j.cell.2009.03.043

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18757 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, O94955 (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.