RDX

RDX
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1GC6, 1GC7, 1J19, 2D10, 2D11, 2D2Q, 2EMS, 2EMT, 2YVC, 2ZPY

Ідентифікатори
Символи RDX, DFNB24, radixin
Зовнішні ІД OMIM: 179410 MGI: 97887 HomoloGene: 37707 GeneCards: RDX
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal recessive nonsyndromic deafness 24, nonsyndromic deafness[1]
Реагує на сполуку
Viroporin 3a[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• protein homodimerization activity
• protein domain specific binding
• ATPase binding
• protein kinase A binding
• cytoskeletal protein binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• actin binding
• RNA binding
• cadherin binding

Клітинна компонента

• цитоплазма
• мембрана
• focal adhesion
• Філоподія
• ruffle
• myelin sheath
• клітинна мембрана
• apical part of cell
• stereocilium
• Мікроворсинки
• apical plasma membrane
• cortical actin cytoskeleton
• Борозна розщеплення
• екзосома
• цитоскелет
• cell periphery
• lamellipodium
• midbody
• T-tubule
• cell tip
• міжклітинний простір
• cell projection

Біологічний процес

• regulation of cell size
• establishment of endothelial barrier
• microvillus assembly
• regulation of organelle assembly
• establishment of protein localization
• positive regulation of cell migration
• GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity
• positive regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle
• negative regulation of homotypic cell-cell adhesion
• regulation of actin filament bundle assembly
• GO:1901313 positive regulation of gene expression
• GO:0034259 negative regulation of GTPase activity
• negative regulation of adherens junction organization
• apical protein localization
• actin filament capping
• cellular response to thyroid hormone stimulus
• regulation of cell shape
• protein kinase A signaling
• regulation of ruffle assembly
• positive regulation of protein localization to early endosome
• positive regulation of early endosome to late endosome transport
• negative regulation of cell size
• regulation of Rap protein signal transduction
• cellular response to platelet-derived growth factor stimulus
• barbed-end actin filament capping
• protein localization to plasma membrane

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
5962
19684
Ensembl
ENSG00000137710
ENSMUSG00000032050
UniProt
P35241
P26043
RefSeq (мРНК)
NM_002906
NM_001260492
NM_001260493
NM_001260494
NM_001260495
NM_001260496
NM_001104616
NM_001104617
NM_009041
RefSeq (білок)
NP_001247421
NP_001247422
NP_001247423
NP_001247424
NP_001247425
NP_002897
NP_001098086
NP_001098087
NP_033067
Локус (UCSC) Хр. 11: 109.86 – 110.3 Mb Хр. 9: 51.96 – 52.01 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

RDX (англ. Radixin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 583 амінокислот, а молекулярна маса — 68 564[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTVGLREVWFFGLQYV
DSKGYSTWLKLNKKVTQQDVKKENPLQFKFRAKFFPEDVSEELIQEITQR
LFFLQVKEAILNDEIYCPPETAVLLASYAVQAKYGDYNKEIHKPGYLAND
RLLPQRVLEQHKLTKEQWEERIQNWHEEHRGMLREDSMMEYLKIAQDLEM
YGVNYFEIKNKKGTELWLGVDALGLNIYEHDDKLTPKIGFPWSEIRNISF
NDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTI
EVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIEREKEELMER
LKQIEEQTIKAQKELEEQTRKALELDQERKRAKEEAERLEKERRAAEEAK
SAIAKQAADQMKNQEQLAAELAEFTAKIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAF
AAQEDLEKTKEELKTVMSAPPPPPPPPVIPPTENEHDEHDENNAEASAEL
SNEGVMNHRSEEERVTETQKNERVKKQLQALSSELAQARDETKKTQNDVL
HAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAM

Кодований геном білок за функціями належить до кепінгів актину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані.

Література

  • Wilgenbus K.K., Milatovich A., Francke U., Furthmayr H. (1993). Molecular cloning, cDNA sequence, and chromosomal assignment of the human radixin gene and two dispersed pseudogenes. Genomics. 16: 199—206. PMID 8486357 DOI:10.1006/geno.1993.1159
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з RDX переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Radixin переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. ↑ Human PubMed Reference:.
  4. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  5. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9944 (англ.) . Архів оригіналу за 5 квітня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
  6. ↑ UniProt, P35241 (англ.) . Архів оригіналу за 9 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 11
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.