RC3H1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3X1O, 4QIK, 4QIL, 4ULW, 4YWQ

Ідентифікатори

Символи

RC3H1, RNF198, ROQUIN, ring finger and CCCH-type domains 1, FHL6, IMDSHY

Зовнішні ІД

OMIM: 609424 MGI: 2685397 HomoloGene: 19036 GeneCards: RC3H1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • зв'язування з іоном металу • mRNA binding • RNA stem-loop binding • mRNA 3'-UTR binding • RNA binding • double-stranded RNA binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • zinc ion binding • transferase activity • miRNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • P-body • cytoplasmic stress granule
Біологічний процес	• regulation of T cell proliferation • regulation of T cell activation • B cell homeostasis • spleen development • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling • T cell homeostasis • T cell proliferation • регуляція експресії генів • lymph node development • T follicular helper cell differentiation • negative regulation of T-helper cell differentiation • regulation of mRNA stability • positive regulation of mRNA catabolic process • regulation of germinal center formation • posttranscriptional regulation of gene expression • negative regulation of germinal center formation • negative regulation of B cell proliferation • cellular response to interleukin-1 • Убіквітин-залежний протеоліз • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay • P-body assembly • regulation of T cell receptor signaling pathway • nuclear-transcribed mRNA catabolic process • negative regulation of activated T cell proliferation • 3'-UTR-mediated mRNA destabilization • protein polyubiquitination • T cell receptor signaling pathway • negative regulation of T-helper 17 cell differentiation • regulation of miRNA metabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


149041


381305

Ensembl


ENSG00000135870


ENSMUSG00000040423

UniProt


Q5TC82


Q4VGL6

RefSeq (мРНК)


NM_001300850 NM_001300851 NM_001300852 NM_172071


NM_001024952

RefSeq (білок)


NP_001287779 NP_001287780 NP_001287781 NP_742068 NP_001287779.1


NP_001020123

Локус (UCSC)

Хр. 1: 173.93 – 174.02 Mb

Хр. 1: 160.73 – 160.8 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RC3H1 (англ. Ring finger and CCCH-type domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 133 амінокислот, а молекулярна маса — 125 736^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPVQAPQWTD	FLSCPICTQT	FDETIRKPIS	LGCGHTVCKM	CLNKLHRKAC
PFDQTTINTD	IELLPVNSAL	LQLVGAQVPE	QQPITLCSGV	EDTKHYEEAK
KCVEELALYL	KPLSSARGVG	LNSTTQSVLS	RPMQRKLVTL	VHCQLVEEEG
RIRAMRAARS	LGERTVTELI	LQHQNPQQLS	SNLWAAVRAR	GCQFLGPAMQ
EEALKLVLLA	LEDGSALSRK	VLVLFVVQRL	EPRFPQASKT	SIGHVVQLLY
RASCFKVTKR	DEDSSLMQLK	EEFRTYEALR	REHDSQIVQI	AMEAGLRIAP
DQWSSLLYGD	QSHKSHMQSI	IDKLQTPASF	AQSVQELTIA	LQRTGDPANL
NRLRPHLELL	ANIDPSPDAP	PPTWEQLENG	LVAVRTVVHG	LVDYIQNHSK
KGADQQQPPQ	HSKYKTYMCR	DMKQRGGCPR	GASCTFAHSQ	EELEKFRKMN
KRLVPRRPLS	ASLGQLNEVG	LPSAAILPDE	GAVDLPSRKP	PALPNGIVST
GNTVTQLIPR	GTDPSYDSSL	KPGKIDHLSS	SAPGSPPDLL	ESVPKSISAL
PVNPHSIPPR	GPADLPPMPV	TKPLQMVPRG	SQLYPAQQTD	VYYQDPRGAA
PPFEPAPYQQ	GMYYTPPPQC	VSRFVRPPPS	APEPAPPYLD	HYPPYLQERV
VNSQYGTQPQ	QYPPIYPSHY	DGRRVYPAPS	YTREEIFRES	PIPIEIPPAA
VPSYVPESRE	RYQQIESYYP	VAPHPTQIRP	SYLREPPYSR	LPPPPQPHPS
LDELHRRRKE	IMAQLEERKV	ISPPPFAPSP	TLPPTFHPEE	FLDEDLKVAG
KYKGNDYSQY	SPWSCDTIGS	YIGTKDAKPK	DVVAAGSVEM	MNVESKGMRD
QRLDLQRRAA	ETSDDDLIPF	GDRPTVSRFG	AISRTSKTIY	QGAGPMQAMA
PQGAPTKSIN	ISDYSPYGTH	GGWGASPYSP	HQNIPSQGHF	SERERISMSE
VASHGKPLPS	AEREQLRLEL	QQLNHQISQQ	TQLRGLEAVS	NRLVLQREAN
TLAGQSQPPP	PPPPKWPGMI	SSEQLSLELH	QVEREIGKRT	RELSMENQCS
LDMKSKLNTS	KQAENGQPEP	QNKVPAEDLT	LTFSDVPNGS	ALTQENISLL
SNKTSSLNLS	EDPEGGGDNN	DSQRSGVTPS	SAP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Heissmeyer V., Vogel K.U. (2013). Molecular control of Tfh-cell differentiation by Roquin family proteins. Immunol. Rev. 253: 273—289. PMID 23550652 DOI:10.1111/imr.12056

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29434 (англ.) . Архів оригіналу за 19 вересня 2015. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q5TC82 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.