RBFOX2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2CQ3

Ідентифікатори

Символи

RBFOX2, FOX2, Fox-2, HNRBP2, HRNBP2, RBM9, RTA, dJ106I20.3, fxh, RNA binding protein, fox-1 homolog 2, RNA binding fox-1 homolog 2

Зовнішні ІД

OMIM: 612149 MGI: 1933973 HomoloGene: 49375 GeneCards: RBFOX2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001106 transcription corepressor activity • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • nucleic acid binding • mRNA binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• neuromuscular process controlling balance • dendrite morphogenesis • mRNA processing • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • нейробіологія розвитку • regulation of RNA splicing • regulation of cell population proliferation • Сплайсинг РНК • radial glia guided migration of Purkinje cell • regulation of definitive erythrocyte differentiation • RNA metabolic process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • intracellular estrogen receptor signaling pathway • fibroblast growth factor receptor signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23543


93686

Ensembl


ENSG00000277564 ENSG00000100320


ENSMUSG00000033565

UniProt


O43251


Q8BP71

RefSeq (мРНК)

NM_001031695 NM_001082576 NM_001082577 NM_001082578 NM_001082579
NM_014309 NM_001349982 NM_001349983 NM_001349989 NM_001349990 NM_001349991 NM_001349992 NM_001349994 NM_001349995 NM_001349996 NM_001349997 NM_001349998 NM_001349999 NM_001394108 NM_001394109 NM_001394110 NM_001394111 NM_001394112 NM_001394113 NM_001394114 NM_001394115

NM_001110827 NM_001110828 NM_001110829 NM_001110830 NM_001286417
NM_001286418 NM_001286419 NM_053104 NM_175387 NM_001358770 NM_001358771 NM_001358772

RefSeq (білок)

NP_001026865 NP_001076045 NP_001076046 NP_001076047 NP_001076048
NP_055124 NP_001336911 NP_001336912 NP_001336918 NP_001336919 NP_001336920 NP_001336921 NP_001336923 NP_001336924 NP_001336925 NP_001336926 NP_001336927 NP_001336928

NP_001104297 NP_001104298 NP_001104299 NP_001104300 NP_001273346
NP_001273347 NP_001273348 NP_444334 NP_780596 NP_001345699 NP_001345700 NP_001345701

Локус (UCSC)

Хр. 22: 35.74 – 36.03 Mb

Хр. 15: 77.08 – 77.31 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RBFOX2 (англ. RNA binding protein, fox-1 homolog 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 390 амінокислот, а молекулярна маса — 41 374^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQNEPLTPGY	HGFPARDSQG	NQEPTTTPDA	MVQPFTTIPF	PPPPQNGIPT
EYGVPHTQDY	AGQTGEHNLT	LYGSTQAHGE	QSSNSPSTQN	GSLTTEGGAQ
TDGQQSQTQS	SENSESKSTP	KRLHVSNIPF	RFRDPDLRQM	FGQFGKILDV
EIIFNERGSK	GFGFVTFENS	ADADRAREKL	HGTVVEGRKI	EVNNATARVM
TNKKMVTPYA	NGWKLSPVVG	AVYGPELYAA	SSFQADVSLG	NDAAVPLSGR
GGINTYIPLI	SLPLVPGFPY	PTAATTAAAF	RGAHLRGRGR	TVYGAVRAVP
PTAIPAYPGV	VYQDGFYGAD	LYGGYAAYRY	AQPATATAAT	AAAAAAAAYS
DGYGRVYTAD	PYHALAPAAS	YGVGAVASLY	RGGYSRFAPY

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Norris J.D., Fan D., Sherk A., McDonnell D.P. (2002). A negative coregulator for the human ER. Mol. Endocrinol. 16: 459—468. PMID 11875103 DOI:10.1210/mend.16.3.0787
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9906 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O43251 (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.