RAB5B

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2HEI

Ідентифікатори

Символи

RAB5B, Rab-5B, member RAS oncogene family

Зовнішні ІД

OMIM: 179514 MGI: 105938 HomoloGene: 104027 GeneCards: RAB5B

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • GDP binding • GTP binding • GTP-dependent protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity
Клітинна компонента	• ендосома • мембрана • Меланосома • endocytic vesicle • внутрішньоклітинний • early endosome • екзосома • клітинна мембрана • secretory granule membrane • early endosome membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела • anchored component of synaptic vesicle membrane
Біологічний процес	• regulation of endocytosis • antigen processing and presentation • endosome organization • plasma membrane to endosome transport • protein transport • neutrophil degranulation • GO:0015915 транспорт • intracellular protein transport • Rab protein signal transduction • ендоцитоз
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5869


19344

Ensembl


ENSG00000111540


ENSMUSG00000000711

UniProt


P61020


P61021

RefSeq (мРНК)


NM_001252036 NM_001252037 NM_002868


NM_011229 NM_177411

RefSeq (білок)


NP_001238965 NP_001238966 NP_002859


NP_803130

Локус (UCSC)

Хр. 12: 55.97 – 56 Mb

Хр. 10: 128.51 – 128.53 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RAB5B (англ. RAB5B, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 215 амінокислот, а молекулярна маса — 23 707^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTSRSTARPN	GQPQASKICQ	FKLVLLGESA	VGKSSLVLRF	VKGQFHEYQE
STIGAAFLTQ	SVCLDDTTVK	FEIWDTAGQE	RYHSLAPMYY	RGAQAAIVVY
DITNQETFAR	AKTWVKELQR	QASPSIVIAL	AGNKADLANK	RMVEYEEAQA
YADDNSLLFM	ETSAKTAMNV	NDLFLAIAKK	LPKSEPQNLG	GAAGRSRGVD
LHEQSQQNKS	QCCSN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендосомах.

Література

Wilson D.B., Wilson M.P. (1992). Identification and subcellular localization of human rab5b, a new member of the ras-related superfamily of GTPases. J. Clin. Invest. 89: 996—1005. PMID 1541686 DOI:10.1172/JCI115683
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Callaghan J.M., Nixon S., Bucci C., Toh B.-H., Stenmark H. (1999). Direct interaction of EEA1 with Rab5b. Eur. J. Biochem. 265: 361—366. PMID 10491193 DOI:10.1046/j.1432-1327.1999.00743.x

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9784 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, P61020 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.