PYGB

Ідентифікатори

Символи

PYGB, GPBB, phosphorylase, glycogen; brain, glycogen phosphorylase B

Зовнішні ІД

OMIM: 138550 MGI: 97828 HomoloGene: 100930 GeneCards: PYGB

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • pyridoxal phosphate binding • glycogen phosphorylase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • каталітична активність • 1,4-alpha-oligoglucan phosphorylase activity • glycosyltransferase activity • SHG alpha-glucan phosphorylase activity • linear malto-oligosaccharide phosphorylase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • екзосома • мембрана • extracellular region • azurophil granule lumen
Біологічний процес	• glycogen metabolic process • обмін речовин • Глікогеноліз • neutrophil degranulation • carbohydrate metabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5834


110078

Ensembl


ENSG00000100994


ENSMUSG00000033059

UniProt


P11216


Q8CI94

RefSeq (мРНК)


NM_002862


NM_153781

RefSeq (білок)


NP_002853


NP_722476

Локус (UCSC)

Хр. 20: 25.25 – 25.3 Mb

Хр. 2: 150.63 – 150.67 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PYGB (англ. Glycogen phosphorylase B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 843 амінокислот, а молекулярна маса — 96 696^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAKPLTDSEK	RKQISVRGLA	GLGDVAEVRK	SFNRHLHFTL	VKDRNVATPR
DYFFALAHTV	RDHLVGRWIR	TQQHYYERDP	KRIYYLSLEF	YMGRTLQNTM
VNLGLQNACD	EAIYQLGLDL	EELEEIEEDA	GLGNGGLGRL	AACFLDSMAT
LGLAAYGYGI	RYEFGIFNQK	IVNGWQVEEA	DDWLRYGNPW	EKARPEYMLP
VHFYGRVEHT	PDGVKWLDTQ	VVLAMPYDTP	VPGYKNNTVN	TMRLWSAKAP
NDFKLQDFNV	GDYIEAVLDR	NLAENISRVL	YPNDNFFEGK	ELRLKQEYFV
VAATLQDIIR	RFKSSKFGCR	DPVRTCFETF	PDKVAIQLND	THPALSIPEL
MRILVDVEKV	DWDKAWEITK	KTCAYTNHTV	LPEALERWPV	SMFEKLLPRH
LEIIYAINQR	HLDHVAALFP	GDVDRLRRMS	VIEEGDCKRI	NMAHLCVIGS
HAVNGVARIH	SEIVKQSVFK	DFYELEPEKF	QNKTNGITPR	RWLLLCNPGL
ADTIVEKIGE	EFLTDLSQLK	KLLPLVSDEV	FIRDVAKVKQ	ENKLKFSAFL
EKEYKVKINP	SSMFDVHVKR	IHEYKRQLLN	CLHVVTLYNR	IKRDPAKAFV
PRTVMIGGKA	APGYHMAKLI	IKLVTSIGDV	VNHDPVVGDR	LKVIFLENYR
VSLAEKVIPA	ADLSQQISTA	GTEASGTGNM	KFMLNGALTI	GTMDGANVEM
AEEAGAENLF	IFGLRVEDVE	ALDRKGYNAR	EYYDHLPELK	QAVDQISSGF
FSPKEPDCFK	DIVNMLMHHD	RFKVFADYEA	YMQCQAQVDQ	LYRNPKEWTK
KVIRNIACSG	KFSSDRTITE	YAREIWGVEP	SDLQIPPPNI	PRD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, глікозилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як вуглеводний обмін, метаболізм глікогену. Білок має сайт для зв'язування з піридоксаль-фосфатом.

Література

Gelinas R.P., Froman B.E., McElroy F., Tait R.C., Gorin F.A. (1989). Human brain glycogen phosphorylase: characterization of fetal cDNA and genomic sequences. Brain Res. Mol. Brain Res. 6: 177—185. PMID 2615594 DOI:10.1016/0169-328X(89)90052-1
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Newgard C.B., Littman D.R., van Genderen C., Smith M., Fletterick R.J. (1988). Human brain glycogen phosphorylase. Cloning, sequence analysis, chromosomal mapping, tissue expression, and comparison with the human liver and muscle isozymes. J. Biol. Chem. 263: 3850—3857. PMID 3346228

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9723 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P11216 (англ.) . Архів оригіналу за 9 квітня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.